More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2225 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2225  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 202 aa  402  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19915  normal  0.0825967 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1914  isochorismatase hydrolase  82.14 
 
 		 203 aa  303  9.000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42820  isochorismatase family hydrolase  48.45 
 
 		 198 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  51.85 
 
 		 223 aa  171  5e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3595  hypothetical protein  47.42 
 
 		 198 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5288  hypothetical protein  50.78 
 
 		 198 aa  171  7.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  46.67 
 
 		 196 aa  167  8e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  46.15 
 
 		 196 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  46.15 
 
 		 196 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2039  isochorismatase family protein  46.24 
 
 		 196 aa  165  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  46.15 
 
 		 196 aa  165  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23720  Isochorismatase hydrolase protein  48.72 
 
 		 197 aa  161  6e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1849  isochorismatase hydrolase  45.7 
 
 		 196 aa  161  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.605673 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0044  isochorismatase hydrolase  40.93 
 
 		 201 aa  159  2e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2741  isochorismatase hydrolase  47.42 
 
 		 198 aa  157  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0122139  normal  0.603247 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0052  isochorismatase hydrolase  41.45 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1718  isochorismatase hydrolase  43.92 
 
 		 196 aa  152  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.854731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1616  isochorismatase hydrolase  49.75 
 
 		 206 aa  149  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743005  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0481  isochorismatase hydrolase  54.26 
 
 		 210 aa  138  7e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.694975  hitchhiker  0.0021355 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2540  isochorismatase hydrolase  37.37 
 
 		 198 aa  134  9e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.417405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0675  putative isochorismatase  39.89 
 
 		 200 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  41.36 
 
 		 207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  42.63 
 
 		 193 aa  129  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5247  isochorismatase hydrolase  43.23 
 
 		 196 aa  129  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.860702 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  42.41 
 
 		 199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  41.88 
 
 		 199 aa  125  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3884  isochorismatase hydrolase  42.47 
 
 		 199 aa  124  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3931  isochorismatase hydrolase  44.3 
 
 		 199 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.835033  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3916  isochorismatase hydrolase  44.3 
 
 		 199 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3990  isochorismatase hydrolase  44.3 
 
 		 199 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  42.33 
 
 		 199 aa  122  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2042  isochorismatase hydrolase  42.29 
 
 		 207 aa  122  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.40855  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  41.4 
 
 		 193 aa  121  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0721  isochorismatase hydrolase  41.44 
 
 		 182 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150785 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1488  isochorismatase hydrolase  41.24 
 
 		 182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151105 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  38.92 
 
 		 181 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4313  isochorismatase hydrolase  42.93 
 
 		 199 aa  115  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2275  isochorismatase hydrolase  41.38 
 
 		 199 aa  115  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4420  isochorismatase hydrolase  42.78 
 
 		 199 aa  114  8.999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  36.63 
 
 		 181 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  37.79 
 
 		 187 aa  112  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  37.79 
 
 		 187 aa  112  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  37.79 
 
 		 187 aa  112  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  37.79 
 
 		 187 aa  112  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  37.79 
 
 		 187 aa  111  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  37.21 
 
 		 181 aa  111  9e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  36.63 
 
 		 181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3945  isochorismatase hydrolase  44.37 
 
 		 200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  37.21 
 
 		 187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  37.21 
 
 		 187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  36.05 
 
 		 181 aa  105  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  40 
 
 		 182 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  34.9 
 
 		 228 aa  102  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  38.37 
 
 		 187 aa  101  8e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  38.82 
 
 		 181 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  33.68 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  36.61 
 
 		 210 aa  99.8  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  34.43 
 
 		 231 aa  99.4  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1846  isochorismatase hydrolase  39.51 
 
 		 187 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1917  isochorismatase hydrolase  39.88 
 
 		 190 aa  99.8  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2236  isochorismatase hydrolase  40.23 
 
 		 199 aa  99  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2676  isochorismatase hydrolase  42.44 
 
 		 182 aa  98.6  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  33.16 
 
 		 231 aa  98.6  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  39.05 
 
 		 203 aa  97.4  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  37.95 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  37.95 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3430  isochorismatase hydrolase  36.16 
 
 		 184 aa  97.4  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128039 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  33.16 
 
 		 231 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  37.95 
 
 		 203 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  39.25 
 
 		 216 aa  96.3  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3208  isochorismatase hydrolase  35.82 
 
 		 195 aa  95.5  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.408182  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0018  isochorismatase family protein  34.48 
 
 		 185 aa  95.1  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.967692 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  36.63 
 
 		 184 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  36.92 
 
 		 203 aa  92.4  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  30.23 
 
 		 181 aa  92  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  33.14 
 
 		 234 aa  91.7  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2126  isochorismatase hydrolase  34.48 
 
 		 182 aa  89.4  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.996682  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  35.29 
 
 		 218 aa  89.7  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  35.88 
 
 		 186 aa  89.7  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4372  isochorismatase hydrolase  36.05 
 
 		 199 aa  89  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0306857  normal  0.52694 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0338  isochorismatase hydrolase  34.91 
 
 		 183 aa  87  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2233  isochorismatase superfamily hydrolase  40.62 
 
 		 182 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  32.12 
 
 		 289 aa  85.1  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1200  isochorismatase family protein  33.52 
 
 		 191 aa  85.1  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.474191  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1856  isochorismatase hydrolase  40.62 
 
 		 182 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16857 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12730  hypothetical protein  33.88 
 
 		 193 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673629  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2098  isochorismatase family protein  31.07 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1215  isochorismatase hydrolase  29.78 
 
 		 185 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3507  isochorismatase hydrolase  40 
 
 		 182 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1155  hypothetical protein  33.52 
 
 		 193 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0863147  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  32.77 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  33.14 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  32.12 
 
 		 359 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1247  isochorismatase hydrolase  39.72 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.127255  normal  0.527652 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3260  isochorismatase hydrolase  35.26 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2169  isochorismatase hydrolase  34.43 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1893  isochorismatase hydrolase  29.94 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.173425  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  31.39 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  31.39 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8036  putative isochorismatase hydrolase  33.14 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4542  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>