More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2042 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2042  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 207 aa  411  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.40855  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0675  putative isochorismatase  55.1 
 
 		 200 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2540  isochorismatase hydrolase  51.26 
 
 		 198 aa  207  6e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.417405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  56.85 
 
 		 199 aa  203  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  56.85 
 
 		 199 aa  202  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4313  isochorismatase hydrolase  57 
 
 		 199 aa  190  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  57.89 
 
 		 199 aa  187  8e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3884  isochorismatase hydrolase  52.26 
 
 		 199 aa  186  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3931  isochorismatase hydrolase  55.22 
 
 		 199 aa  184  6e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.835033  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3916  isochorismatase hydrolase  55.22 
 
 		 199 aa  184  6e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3990  isochorismatase hydrolase  55.22 
 
 		 199 aa  184  6e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4420  isochorismatase hydrolase  56.78 
 
 		 199 aa  178  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5247  isochorismatase hydrolase  50.75 
 
 		 196 aa  168  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.860702 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2275  isochorismatase hydrolase  55.73 
 
 		 199 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3945  isochorismatase hydrolase  56.22 
 
 		 200 aa  152  4e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  43.56 
 
 		 223 aa  135  6.0000000000000005e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  38.89 
 
 		 196 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2225  isochorismatase hydrolase  42 
 
 		 202 aa  132  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19915  normal  0.0825967 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  38.89 
 
 		 196 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  38.38 
 
 		 196 aa  130  9e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  38.38 
 
 		 196 aa  130  9e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5288  hypothetical protein  46.19 
 
 		 198 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3595  hypothetical protein  38.58 
 
 		 198 aa  121  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2741  isochorismatase hydrolase  42.13 
 
 		 198 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0122139  normal  0.603247 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1849  isochorismatase hydrolase  35.75 
 
 		 196 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.605673 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1914  isochorismatase hydrolase  42.29 
 
 		 203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23720  Isochorismatase hydrolase protein  40.3 
 
 		 197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42820  isochorismatase family hydrolase  37.06 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2039  isochorismatase family protein  35.23 
 
 		 196 aa  109  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0044  isochorismatase hydrolase  33.7 
 
 		 201 aa  108  5e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  39.01 
 
 		 193 aa  105  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1616  isochorismatase hydrolase  43 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743005  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0052  isochorismatase hydrolase  32.04 
 
 		 201 aa  105  6e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1718  isochorismatase hydrolase  37.43 
 
 		 196 aa  103  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.854731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  38.76 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0481  isochorismatase hydrolase  45.78 
 
 		 210 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.694975  hitchhiker  0.0021355 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2236  isochorismatase hydrolase  40.23 
 
 		 199 aa  97.4  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  38.12 
 
 		 187 aa  97.1  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  36.16 
 
 		 231 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  34.5 
 
 		 207 aa  94.4  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  36.16 
 
 		 231 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  37.16 
 
 		 216 aa  92.4  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  35.59 
 
 		 231 aa  92.4  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  31.82 
 
 		 181 aa  92  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  35.59 
 
 		 231 aa  91.7  7e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  33.52 
 
 		 228 aa  91.7  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  29.94 
 
 		 181 aa  90.9  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1488  isochorismatase hydrolase  33.15 
 
 		 182 aa  88.2  7e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151105 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  29.51 
 
 		 181 aa  88.2  8e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  31.07 
 
 		 187 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  29.38 
 
 		 187 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  29.38 
 
 		 187 aa  87.8  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  29.94 
 
 		 187 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  30.51 
 
 		 181 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  31.07 
 
 		 187 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  29.38 
 
 		 187 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  36.07 
 
 		 182 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  29.38 
 
 		 181 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  29.94 
 
 		 187 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0721  isochorismatase hydrolase  31.75 
 
 		 182 aa  84.7  9e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150785 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  33.86 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  28.81 
 
 		 181 aa  84  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  33.82 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3430  isochorismatase hydrolase  34.43 
 
 		 184 aa  81.6  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128039 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  36.21 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  33.51 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  30.56 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  34.08 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  34.08 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  33.52 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  34.15 
 
 		 181 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2962  isochorismatase hydrolase  38.82 
 
 		 172 aa  78.6  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.419394  normal  0.652284 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2676  isochorismatase hydrolase  40.11 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  34.08 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1856  isochorismatase hydrolase  38.25 
 
 		 182 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16857 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  36.16 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1174  isochorismatase hydrolase  35.95 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.910338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  30.86 
 
 		 359 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  30.29 
 
 		 359 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1846  isochorismatase hydrolase  33.7 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0018  isochorismatase family protein  29.78 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.967692 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0235  isochorismatase hydrolase  32.56 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.809907 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  32.45 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  31.72 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  29.23 
 
 		 342 aa  72.8  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2188  isochorismatase hydrolase  34.46 
 
 		 186 aa  72  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288867  normal  0.048401 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2101  isochorismatase hydrolase  33.71 
 
 		 187 aa  72  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.682407  normal  0.139759 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 174 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  29.14 
 
 		 180 aa  71.6  0.000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0771  isochorismatase family protein  33.8 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  34.97 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  34.67 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  31.4 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4372  isochorismatase hydrolase  31.21 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0306857  normal  0.52694 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  30.67 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2233  isochorismatase superfamily hydrolase  36.72 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  30.67 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  30.67 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4942  isochorismatase hydrolase  34.07 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0334336 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3507  isochorismatase hydrolase  36.72 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>