More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1742 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 193 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  89.12 
 
 		 193 aa  353  1e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  57.14 
 
 		 186 aa  204  7e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  56 
 
 		 185 aa  204  9e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  51.14 
 
 		 181 aa  202  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  51.7 
 
 		 181 aa  202  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  49.14 
 
 		 181 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  50 
 
 		 187 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  50 
 
 		 187 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  50.57 
 
 		 187 aa  194  6e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  50.57 
 
 		 187 aa  194  7e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  50.57 
 
 		 187 aa  194  7e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  50.57 
 
 		 187 aa  194  7e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  50.57 
 
 		 181 aa  193  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  50 
 
 		 187 aa  193  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0721  isochorismatase hydrolase  50.83 
 
 		 182 aa  191  5e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150785 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3430  isochorismatase hydrolase  50.29 
 
 		 184 aa  191  6e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128039 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2676  isochorismatase hydrolase  59.43 
 
 		 182 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  51.12 
 
 		 181 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  51.38 
 
 		 187 aa  186  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  48 
 
 		 181 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0018  isochorismatase family protein  50 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.967692 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1488  isochorismatase hydrolase  48.86 
 
 		 182 aa  178  4e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151105 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  50.29 
 
 		 184 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  48.6 
 
 		 182 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  49.44 
 
 		 210 aa  170  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2236  isochorismatase hydrolase  48.81 
 
 		 199 aa  167  6e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  47.43 
 
 		 181 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1917  isochorismatase hydrolase  53.14 
 
 		 190 aa  159  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  42.25 
 
 		 207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1856  isochorismatase hydrolase  50.84 
 
 		 182 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16857 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  46.02 
 
 		 223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1247  isochorismatase hydrolase  52.81 
 
 		 190 aa  145  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.127255  normal  0.527652 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2233  isochorismatase superfamily hydrolase  50.84 
 
 		 182 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3507  isochorismatase hydrolase  50.28 
 
 		 182 aa  140  8e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  40.57 
 
 		 180 aa  140  9.999999999999999e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1718  isochorismatase hydrolase  40 
 
 		 196 aa  131  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.854731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  40.57 
 
 		 196 aa  131  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  41.14 
 
 		 196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  40 
 
 		 196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  40 
 
 		 196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2540  isochorismatase hydrolase  45.25 
 
 		 198 aa  128  6e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.417405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3931  isochorismatase hydrolase  45.26 
 
 		 199 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.835033  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3916  isochorismatase hydrolase  45.26 
 
 		 199 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3990  isochorismatase hydrolase  45.26 
 
 		 199 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2225  isochorismatase hydrolase  41.4 
 
 		 202 aa  121  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19915  normal  0.0825967 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0675  putative isochorismatase  42.7 
 
 		 200 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1849  isochorismatase hydrolase  40 
 
 		 196 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.605673 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42820  isochorismatase family hydrolase  38.24 
 
 		 198 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  44.02 
 
 		 199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3884  isochorismatase hydrolase  40.96 
 
 		 199 aa  119  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  43.48 
 
 		 199 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0771  isochorismatase family protein  36.72 
 
 		 316 aa  119  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0235  isochorismatase hydrolase  38.86 
 
 		 316 aa  118  6e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.809907 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2039  isochorismatase family protein  38.86 
 
 		 196 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3595  hypothetical protein  36.47 
 
 		 198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0384  isochorismatase hydrolase  39.2 
 
 		 313 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0044  isochorismatase hydrolase  35.33 
 
 		 201 aa  116  3e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  43.59 
 
 		 199 aa  115  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0052  isochorismatase hydrolase  35.87 
 
 		 201 aa  114  8.999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  34.57 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2275  isochorismatase hydrolase  45 
 
 		 199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  34.41 
 
 		 231 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  34.41 
 
 		 231 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  35 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  34.57 
 
 		 203 aa  109  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1914  isochorismatase hydrolase  41.81 
 
 		 203 aa  109  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4313  isochorismatase hydrolase  43.36 
 
 		 199 aa  109  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5247  isochorismatase hydrolase  42.22 
 
 		 196 aa  108  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.860702 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  33.87 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  33.51 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  33.51 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1155  hypothetical protein  35.71 
 
 		 193 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0863147  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  34.44 
 
 		 228 aa  105  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  33.51 
 
 		 203 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23720  Isochorismatase hydrolase protein  40 
 
 		 197 aa  104  8e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4420  isochorismatase hydrolase  44.81 
 
 		 199 aa  103  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  30.73 
 
 		 185 aa  102  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  34.09 
 
 		 289 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1200  isochorismatase family protein  35.39 
 
 		 191 aa  102  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.474191  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  32.26 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  32.02 
 
 		 182 aa  101  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2741  isochorismatase hydrolase  38.64 
 
 		 198 aa  101  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0122139  normal  0.603247 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1616  isochorismatase hydrolase  42.58 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743005  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  32.22 
 
 		 234 aa  99.4  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  28.65 
 
 		 342 aa  99.4  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2042  isochorismatase hydrolase  41.56 
 
 		 207 aa  99  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.40855  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5288  hypothetical protein  41.18 
 
 		 198 aa  99  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12730  hypothetical protein  32.11 
 
 		 193 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3945  isochorismatase hydrolase  45.71 
 
 		 200 aa  97.8  9e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1280  isochorismatase family protein  32.22 
 
 		 184 aa  95.9  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  32.22 
 
 		 185 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1382  isochorismatase family protein  32.22 
 
 		 184 aa  95.9  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.030054  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  31.11 
 
 		 184 aa  95.5  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1893  isochorismatase hydrolase  32.97 
 
 		 188 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.173425  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1454  isochorismatase family protein  31.67 
 
 		 184 aa  94.7  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.40872 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1416  isochorismatase family protein  31.11 
 
 		 184 aa  94.7  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  33.7 
 
 		 190 aa  94  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4750  isochorismatase hydrolase  34.09 
 
 		 186 aa  92.4  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3069  isochorismatase hydrolase  34.83 
 
 		 173 aa  91.7  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000901159  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>