More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4208 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 234 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  57.62 
 
 		 289 aa  243  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  55.78 
 
 		 216 aa  223  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  55.84 
 
 		 203 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  55.33 
 
 		 203 aa  210  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  54.82 
 
 		 211 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  54.82 
 
 		 211 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  54.31 
 
 		 203 aa  209  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  50 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  47.47 
 
 		 231 aa  202  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  47.47 
 
 		 231 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  45.61 
 
 		 231 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  49.25 
 
 		 231 aa  201  9e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0829  isochorismatase hydrolase  50.21 
 
 		 244 aa  192  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.291924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  41.21 
 
 		 218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  41.09 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8036  putative isochorismatase hydrolase  39.43 
 
 		 201 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0675  putative isochorismatase  36.9 
 
 		 200 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0052  isochorismatase hydrolase  32.46 
 
 		 201 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  35.59 
 
 		 223 aa  108  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3916  isochorismatase hydrolase  39.63 
 
 		 199 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664242  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3931  isochorismatase hydrolase  39.63 
 
 		 199 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.835033  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3990  isochorismatase hydrolase  39.63 
 
 		 199 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0044  isochorismatase hydrolase  30.89 
 
 		 201 aa  105  6e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2531  isochorismatase hydrolase  37.57 
 
 		 240 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.736138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2540  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 198 aa  102  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.417405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2658  isochorismatase hydrolase  37.57 
 
 		 217 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  33.15 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  35.8 
 
 		 342 aa  100  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2001  isochorismatase hydrolase  36.52 
 
 		 221 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2611  isochorismatase hydrolase  36.52 
 
 		 221 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5942  isochorismatase hydrolase  37.57 
 
 		 248 aa  99.8  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  32.22 
 
 		 193 aa  99.4  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  32 
 
 		 196 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  32 
 
 		 196 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3884  isochorismatase hydrolase  33.15 
 
 		 199 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  31.43 
 
 		 196 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  31.43 
 
 		 196 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  34.22 
 
 		 199 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5288  hypothetical protein  36.75 
 
 		 198 aa  96.7  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  34.22 
 
 		 199 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  34.46 
 
 		 182 aa  96.3  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2640  isochorismatase hydrolase  35.96 
 
 		 221 aa  96.3  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  35.03 
 
 		 182 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3260  isochorismatase hydrolase  35.96 
 
 		 210 aa  95.5  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0706  putative isochorismatase hydrolase  37.08 
 
 		 210 aa  95.1  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  31.28 
 
 		 187 aa  95.1  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  31.28 
 
 		 187 aa  95.1  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  31.07 
 
 		 181 aa  95.1  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1718  isochorismatase hydrolase  31.03 
 
 		 196 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.854731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 		 181 aa  94  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  30.17 
 
 		 187 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  30.73 
 
 		 181 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  34.68 
 
 		 185 aa  92.8  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3595  hypothetical protein  30.95 
 
 		 198 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42820  isochorismatase family hydrolase  32.14 
 
 		 198 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2275  isochorismatase hydrolase  40 
 
 		 199 aa  92  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  30.9 
 
 		 193 aa  91.7  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  32.95 
 
 		 187 aa  91.7  9e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2225  isochorismatase hydrolase  33.14 
 
 		 202 aa  91.7  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19915  normal  0.0825967 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1849  isochorismatase hydrolase  28.16 
 
 		 196 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.605673 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  29.61 
 
 		 187 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  29.05 
 
 		 181 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  30.17 
 
 		 181 aa  90.5  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  35.39 
 
 		 184 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4420  isochorismatase hydrolase  37.97 
 
 		 199 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4084  isochorismatase hydrolase  33.51 
 
 		 219 aa  89.7  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4196  isochorismatase hydrolase  33.51 
 
 		 219 aa  89.7  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  29.55 
 
 		 190 aa  89.4  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2676  isochorismatase hydrolase  36.87 
 
 		 182 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  32.02 
 
 		 186 aa  89.4  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  28.49 
 
 		 187 aa  89.4  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  28.49 
 
 		 187 aa  89.4  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  28.49 
 
 		 187 aa  89.4  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1914  isochorismatase hydrolase  31.64 
 
 		 203 aa  88.6  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  29.61 
 
 		 185 aa  87.8  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  37.14 
 
 		 181 aa  87.8  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2039  isochorismatase family protein  28.16 
 
 		 196 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0476  isochorismatase hydrolase  34.68 
 
 		 209 aa  86.3  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.531958  normal  0.0271328 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  27.07 
 
 		 184 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  30.73 
 
 		 187 aa  86.7  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1287  isochorismatase hydrolase  28.18 
 
 		 184 aa  86.3  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  35.15 
 
 		 199 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0481  isochorismatase hydrolase  42.75 
 
 		 210 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.694975  hitchhiker  0.0021355 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4313  isochorismatase hydrolase  35.81 
 
 		 199 aa  85.1  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4138  isochorismatase hydrolase  32.96 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  30.05 
 
 		 210 aa  84.7  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0721  isochorismatase hydrolase  30.56 
 
 		 182 aa  84.7  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150785 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0384  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23720  Isochorismatase hydrolase protein  31.55 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  32.4 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3927  isochorismatase family protein  28.73 
 
 		 184 aa  82  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1252  isochorismatase family protein  27.07 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425084  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1454  isochorismatase family protein  27.07 
 
 		 184 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.40872 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5247  isochorismatase hydrolase  34.48 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.860702 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1280  isochorismatase family protein  27.07 
 
 		 184 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1382  isochorismatase family protein  27.07 
 
 		 184 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.030054  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2233  isochorismatase superfamily hydrolase  39.16 
 
 		 182 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1416  isochorismatase family protein  27.62 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3430  isochorismatase hydrolase  31.46 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128039 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>