More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0476 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0476  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 209 aa  427  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.531958  normal  0.0271328 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3260  isochorismatase hydrolase  78.95 
 
 		 210 aa  338  4e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0706  putative isochorismatase hydrolase  80.29 
 
 		 210 aa  329  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4084  isochorismatase hydrolase  69.8 
 
 		 219 aa  287  7e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4196  isochorismatase hydrolase  69.8 
 
 		 219 aa  287  7e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5942  isochorismatase hydrolase  63.82 
 
 		 248 aa  259  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1332  hypothetical protein  60.98 
 
 		 209 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2531  isochorismatase hydrolase  63.54 
 
 		 240 aa  251  7e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.736138 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2001  isochorismatase hydrolase  62.56 
 
 		 221 aa  249  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2611  isochorismatase hydrolase  62.56 
 
 		 221 aa  249  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2640  isochorismatase hydrolase  62.56 
 
 		 221 aa  248  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2658  isochorismatase hydrolase  61.98 
 
 		 217 aa  244  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4081  isochorismatase hydrolase  61.26 
 
 		 193 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15140  hypothetical protein  60.1 
 
 		 209 aa  235  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.163225  hitchhiker  0.0000214815 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0488  isochorismatase hydrolase  59.31 
 
 		 209 aa  233  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8036  putative isochorismatase hydrolase  54.31 
 
 		 201 aa  207  9e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4138  isochorismatase hydrolase  48.31 
 
 		 211 aa  199  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  46.37 
 
 		 342 aa  161  7e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  49.16 
 
 		 182 aa  159  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  45.7 
 
 		 185 aa  154  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  42.62 
 
 		 187 aa  153  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2726  isochorismatase hydrolase  45.77 
 
 		 213 aa  150  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.312269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  38.98 
 
 		 211 aa  99  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  38.98 
 
 		 211 aa  99  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  38.98 
 
 		 203 aa  97.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  38.42 
 
 		 203 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  36.87 
 
 		 203 aa  95.5  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  37.24 
 
 		 228 aa  92.4  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  34.27 
 
 		 216 aa  92  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1849  isochorismatase hydrolase  31.43 
 
 		 196 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.605673 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  35.33 
 
 		 289 aa  89.4  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  36.69 
 
 		 231 aa  88.2  9e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  36.69 
 
 		 231 aa  87.4  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  36.69 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  34.68 
 
 		 234 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  35.97 
 
 		 231 aa  84.7  9e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  34.81 
 
 		 207 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  30.22 
 
 		 181 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2039  isochorismatase family protein  30.86 
 
 		 196 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  30.48 
 
 		 187 aa  84.3  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  32.57 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  26.82 
 
 		 181 aa  79.7  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  29.78 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  29.78 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  25.68 
 
 		 181 aa  77  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  29.55 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  30.34 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23720  Isochorismatase hydrolase protein  34.1 
 
 		 197 aa  74.3  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  25.56 
 
 		 193 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0721  isochorismatase hydrolase  26.49 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150785 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  31.69 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  28.26 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2676  isochorismatase hydrolase  27.81 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4231  isochorismatase hydrolase  36.88 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0539738  normal  0.306851 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  27.47 
 
 		 210 aa  72  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2540  isochorismatase hydrolase  29.65 
 
 		 198 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.417405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4435  isochorismatase hydrolase  31.38 
 
 		 180 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0675  putative isochorismatase  33.33 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1488  isochorismatase hydrolase  27.37 
 
 		 182 aa  71.2  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151105 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  29.12 
 
 		 182 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2121  isochorismatase hydrolase  29.35 
 
 		 174 aa  70.9  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.29808  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1856  isochorismatase hydrolase  29.05 
 
 		 182 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16857 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  25.99 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5755  isochorismatase hydrolase  31.02 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.066854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3819  isochorismatase hydrolase  31.02 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4549  isochorismatase hydrolase  31.02 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.524921 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3430  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128039 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  30.39 
 
 		 359 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42820  isochorismatase family hydrolase  31.46 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3595  hypothetical protein  30 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2860  isochorismatase hydrolase  30.81 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.782004  normal  0.258884 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3507  isochorismatase hydrolase  31.21 
 
 		 182 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1718  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.854731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2236  isochorismatase hydrolase  28.82 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  25.82 
 
 		 185 aa  67.8  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2275  isochorismatase hydrolase  36.22 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2233  isochorismatase superfamily hydrolase  31.21 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  29.71 
 
 		 176 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3990  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1917  isochorismatase hydrolase  28.73 
 
 		 190 aa  67  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3931  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.835033  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3916  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664242  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  25.4 
 
 		 180 aa  67  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0547  amidase  29.24 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145331  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  27.22 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0481  isochorismatase hydrolase  33.69 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.694975  hitchhiker  0.0021355 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  27.22 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5288  hypothetical protein  33.14 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  32.61 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  32.61 
 
 		 199 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2962  isochorismatase hydrolase  35.16 
 
 		 172 aa  64.7  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.419394  normal  0.652284 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0829  isochorismatase hydrolase  35.43 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.291924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  32.96 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4313  isochorismatase hydrolase  34.38 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  25.27 
 
 		 187 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  29.14 
 
 		 174 aa  64.7  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  26.06 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  28.57 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  25.26 
 
 		 181 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>