287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4138 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4138  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 211 aa  427  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2726  isochorismatase hydrolase  56.22 
 
 		 213 aa  219  3e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.312269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3260  isochorismatase hydrolase  50.72 
 
 		 210 aa  208  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8036  putative isochorismatase hydrolase  50.25 
 
 		 201 aa  203  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0476  isochorismatase hydrolase  48.31 
 
 		 209 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.531958  normal  0.0271328 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0706  putative isochorismatase hydrolase  52.17 
 
 		 210 aa  199  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0488  isochorismatase hydrolase  49.76 
 
 		 209 aa  189  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2531  isochorismatase hydrolase  51.11 
 
 		 240 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.736138 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2658  isochorismatase hydrolase  51.11 
 
 		 217 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4084  isochorismatase hydrolase  43.14 
 
 		 219 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4196  isochorismatase hydrolase  43.14 
 
 		 219 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5942  isochorismatase hydrolase  47.98 
 
 		 248 aa  182  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2001  isochorismatase hydrolase  50.56 
 
 		 221 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2611  isochorismatase hydrolase  50.56 
 
 		 221 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2640  isochorismatase hydrolase  50.56 
 
 		 221 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4081  isochorismatase hydrolase  46.24 
 
 		 193 aa  175  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1332  hypothetical protein  41.41 
 
 		 209 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15140  hypothetical protein  42.42 
 
 		 209 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.163225  hitchhiker  0.0000214815 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  44.2 
 
 		 342 aa  149  3e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  40.54 
 
 		 182 aa  138  4.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  40 
 
 		 187 aa  135  5e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  40.54 
 
 		 185 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  35.16 
 
 		 203 aa  101  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  34.62 
 
 		 211 aa  99.4  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  34.62 
 
 		 211 aa  99.4  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  37.24 
 
 		 228 aa  96.7  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  33.52 
 
 		 203 aa  97.1  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  33.7 
 
 		 203 aa  95.5  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  35 
 
 		 289 aa  93.6  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  32.96 
 
 		 216 aa  86.7  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  33.11 
 
 		 231 aa  85.9  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  33.11 
 
 		 231 aa  85.5  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  33.11 
 
 		 231 aa  85.5  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  32.02 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  32.96 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  32.45 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1849  isochorismatase hydrolase  30.51 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.605673 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  29.83 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4590  isochorismatase family protein  33.78 
 
 		 177 aa  82  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2039  isochorismatase family protein  31.64 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  26.37 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  28.33 
 
 		 181 aa  81.3  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  29.28 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  29.28 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0721  isochorismatase hydrolase  29.83 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150785 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  32.43 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  28.26 
 
 		 181 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  27.47 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3976  isochorismatase hydrolase  33.56 
 
 		 178 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  31.38 
 
 		 184 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  28.57 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  28.57 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  28.02 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  28.02 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3597  isochorismatase family protein  34.92 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  28.02 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  28.96 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2716  isochorismatase hydrolase  37.86 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  28.57 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3608  isochorismatase family protein  34.92 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1936  isochorismatase family protein  34.92 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2676  isochorismatase hydrolase  31.22 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0508  isochorismatase family protein  34.92 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.537066  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2121  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.29808  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0670  isochorismatase family protein  34.92 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0966  isochorismatase family protein  34.92 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.145103  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  28.02 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  28.02 
 
 		 181 aa  72  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  30.43 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  26.37 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  28.88 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  25.82 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3583  isochorismatase family protein  34.39 
 
 		 183 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.46144  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  29.35 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1718  isochorismatase hydrolase  27.68 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.854731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3819  isochorismatase hydrolase  34.72 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5755  isochorismatase hydrolase  34.72 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.066854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4549  isochorismatase hydrolase  34.72 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.524921 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4435  isochorismatase hydrolase  37.24 
 
 		 180 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1488  isochorismatase hydrolase  27.47 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151105 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0829  isochorismatase hydrolase  29.02 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.291924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  26.04 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0975  isochorismatase hydrolase  35.71 
 
 		 172 aa  67.8  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.8451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4231  isochorismatase hydrolase  34.48 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0539738  normal  0.306851 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0675  putative isochorismatase  32 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3507  isochorismatase hydrolase  33.51 
 
 		 182 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  26.7 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2962  isochorismatase hydrolase  35.82 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.419394  normal  0.652284 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2926  isochorismatase family protein  32.09 
 
 		 183 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2233  isochorismatase superfamily hydrolase  32.97 
 
 		 182 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  25.41 
 
 		 187 aa  64.3  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4750  isochorismatase hydrolase  27.6 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  29.61 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  26.49 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1856  isochorismatase hydrolase  32.42 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16857 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2817  isochorismatase hydrolase  32.62 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369083  hitchhiker  0.00306149 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2236  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0547  amidase  27.33 
 
 		 161 aa  62  0.000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145331  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2540  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.417405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1287  isochorismatase hydrolase  27.93 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>