More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4196 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4196  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 219 aa  454  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4084  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 219 aa  454  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3260  isochorismatase hydrolase  71.78 
 
 		 210 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0476  isochorismatase hydrolase  69.8 
 
 		 209 aa  287  8e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.531958  normal  0.0271328 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0706  putative isochorismatase hydrolase  71.29 
 
 		 210 aa  287  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1332  hypothetical protein  61.5 
 
 		 209 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2531  isochorismatase hydrolase  60.91 
 
 		 240 aa  252  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.736138 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2658  isochorismatase hydrolase  59.39 
 
 		 217 aa  247  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4081  isochorismatase hydrolase  62.77 
 
 		 193 aa  242  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5942  isochorismatase hydrolase  59.18 
 
 		 248 aa  240  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2001  isochorismatase hydrolase  58.08 
 
 		 221 aa  240  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2611  isochorismatase hydrolase  58.08 
 
 		 221 aa  240  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2640  isochorismatase hydrolase  58.08 
 
 		 221 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15140  hypothetical protein  60.29 
 
 		 209 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.163225  hitchhiker  0.0000214815 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0488  isochorismatase hydrolase  57.42 
 
 		 209 aa  229  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8036  putative isochorismatase hydrolase  54.82 
 
 		 201 aa  225  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4138  isochorismatase hydrolase  43.14 
 
 		 211 aa  182  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  50.82 
 
 		 182 aa  181  6e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  49.18 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  44.81 
 
 		 187 aa  167  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  43.02 
 
 		 342 aa  149  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2726  isochorismatase hydrolase  43.37 
 
 		 213 aa  132  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.312269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  35.68 
 
 		 203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  37.99 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  37.99 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  37.29 
 
 		 203 aa  106  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  37.43 
 
 		 203 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  36.16 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  36.46 
 
 		 207 aa  97.4  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  33.51 
 
 		 234 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  29.83 
 
 		 193 aa  89  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  34.68 
 
 		 289 aa  88.6  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  35.66 
 
 		 231 aa  88.6  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  35.66 
 
 		 231 aa  88.2  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  35.66 
 
 		 231 aa  88.2  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  31.87 
 
 		 182 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0721  isochorismatase hydrolase  28.09 
 
 		 182 aa  87.8  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150785 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  37.23 
 
 		 228 aa  87  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  34.97 
 
 		 231 aa  85.5  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  34.57 
 
 		 218 aa  85.1  8e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  30.68 
 
 		 174 aa  84.7  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  25.97 
 
 		 181 aa  84.3  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  33.7 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  30.05 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  30.39 
 
 		 359 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  27.53 
 
 		 181 aa  82.4  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  32.95 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  29.28 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  27.87 
 
 		 187 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  27.87 
 
 		 187 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  27.87 
 
 		 187 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  30 
 
 		 181 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  31.88 
 
 		 176 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1488  isochorismatase hydrolase  29.05 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151105 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  27.32 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  27.87 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  28.98 
 
 		 176 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  27.32 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  28.98 
 
 		 176 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  28.98 
 
 		 176 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  27.37 
 
 		 181 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  31.16 
 
 		 176 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  27.87 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  27.68 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  28.73 
 
 		 176 aa  78.2  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  29.55 
 
 		 196 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  28.73 
 
 		 187 aa  77.8  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1849  isochorismatase hydrolase  27.43 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.605673 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  33.8 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  28.98 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  28.98 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2236  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2039  isochorismatase family protein  27.07 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  30.11 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0018  isochorismatase family protein  28.65 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.967692 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  28.18 
 
 		 359 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  26.82 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  27.37 
 
 		 181 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2188  isochorismatase hydrolase  33.57 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288867  normal  0.048401 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2962  isochorismatase hydrolase  38.84 
 
 		 172 aa  73.2  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.419394  normal  0.652284 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0975  isochorismatase hydrolase  36.13 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.8451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1224  isochorismatase hydrolase  34.69 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  26.26 
 
 		 181 aa  72  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2676  isochorismatase hydrolase  30.94 
 
 		 182 aa  72  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1153  isochorismatase hydrolase  36.51 
 
 		 181 aa  72  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3507  isochorismatase hydrolase  30.39 
 
 		 182 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1154  isochorismatase hydrolase  34.69 
 
 		 181 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.399552  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2233  isochorismatase superfamily hydrolase  30.39 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4590  isochorismatase family protein  32.9 
 
 		 177 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3430  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128039 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4231  isochorismatase hydrolase  34.97 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0539738  normal  0.306851 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1718  isochorismatase hydrolase  27.68 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.854731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  25.99 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2121  isochorismatase hydrolase  34.43 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.29808  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4435  isochorismatase hydrolase  36 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3916  isochorismatase hydrolase  33.58 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664242  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3931  isochorismatase hydrolase  33.58 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.835033  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3990  isochorismatase hydrolase  33.58 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5755  isochorismatase hydrolase  31.72 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.066854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4549  isochorismatase hydrolase  31.72 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.524921 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>