272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2726 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2726  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 213 aa  427  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.312269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4138  isochorismatase hydrolase  56.1 
 
 		 211 aa  233  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2531  isochorismatase hydrolase  50 
 
 		 240 aa  177  9e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.736138 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2658  isochorismatase hydrolase  48.98 
 
 		 217 aa  175  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0488  isochorismatase hydrolase  49.75 
 
 		 209 aa  171  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2640  isochorismatase hydrolase  49.22 
 
 		 221 aa  168  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5942  isochorismatase hydrolase  48.7 
 
 		 248 aa  166  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2001  isochorismatase hydrolase  48.7 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2611  isochorismatase hydrolase  48.7 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3260  isochorismatase hydrolase  47.39 
 
 		 210 aa  165  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0476  isochorismatase hydrolase  45.77 
 
 		 209 aa  162  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.531958  normal  0.0271328 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4081  isochorismatase hydrolase  43.52 
 
 		 193 aa  157  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0706  putative isochorismatase hydrolase  47.62 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8036  putative isochorismatase hydrolase  43.15 
 
 		 201 aa  152  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1332  hypothetical protein  43.81 
 
 		 209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4084  isochorismatase hydrolase  43.37 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4196  isochorismatase hydrolase  43.37 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15140  hypothetical protein  43.3 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.163225  hitchhiker  0.0000214815 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  43.33 
 
 		 182 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  42.22 
 
 		 185 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  38.59 
 
 		 342 aa  122  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  37.3 
 
 		 187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  34.62 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  33.9 
 
 		 289 aa  81.6  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  32.97 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  33.9 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  33.9 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  33.9 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  32.76 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  34.07 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4590  isochorismatase family protein  31.76 
 
 		 177 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3208  isochorismatase hydrolase  29.24 
 
 		 195 aa  75.9  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.408182  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  34.97 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2121  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 174 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.29808  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  28.26 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  28.26 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  28.26 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  27.72 
 
 		 187 aa  72  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  27.72 
 
 		 187 aa  72  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  27.72 
 
 		 187 aa  72  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3976  isochorismatase hydrolase  32.41 
 
 		 178 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  31.07 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  25.68 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  26.23 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  27.17 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2962  isochorismatase hydrolase  32.68 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.419394  normal  0.652284 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  25.14 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  26.92 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0721  isochorismatase hydrolase  28.19 
 
 		 182 aa  67.8  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150785 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  30.11 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  30.86 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  27.37 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  27.37 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3507  isochorismatase hydrolase  33.94 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  24.04 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2233  isochorismatase superfamily hydrolase  33.73 
 
 		 182 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  27.37 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  30.9 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  31.02 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  28.09 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  25.57 
 
 		 180 aa  63.9  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  35.33 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  34.87 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  29.15 
 
 		 187 aa  62  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  31.28 
 
 		 218 aa  62  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2236  isochorismatase hydrolase  28.07 
 
 		 199 aa  62  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1917  isochorismatase hydrolase  29.12 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4231  isochorismatase hydrolase  31.76 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0539738  normal  0.306851 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  31.46 
 
 		 193 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0975  isochorismatase hydrolase  30.99 
 
 		 172 aa  61.2  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.8451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12730  hypothetical protein  29.21 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2716  isochorismatase hydrolase  34.72 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0018  isochorismatase family protein  27.81 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.967692 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4750  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3819  isochorismatase hydrolase  32.32 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4549  isochorismatase hydrolase  32.32 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.524921 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5755  isochorismatase hydrolase  32.32 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.066854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3884  isochorismatase hydrolase  32.26 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  29.66 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3430  isochorismatase hydrolase  30.43 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128039 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4435  isochorismatase hydrolase  32.93 
 
 		 180 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1174  isochorismatase hydrolase  29.49 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.910338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  28.3 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0481  isochorismatase hydrolase  37.32 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.694975  hitchhiker  0.0021355 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  25.77 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1849  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.605673 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  31.47 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2039  isochorismatase family protein  27.84 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  33.81 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1155  hypothetical protein  28.33 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0863147  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  28.3 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1488  isochorismatase hydrolase  26.67 
 
 		 182 aa  58.2  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151105 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  28.3 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  32.96 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  28.28 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  28.3 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  33.81 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  25.41 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1287  isochorismatase hydrolase  26.23 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2676  isochorismatase hydrolase  30.39 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>