More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2716 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2716  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
183 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0445  isochorismatase hydrolase  54.1 
 
 
183 aa  189  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.230544 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0487  isochorismatase hydrolase  53.55 
 
 
183 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.972949 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0419  isochorismatase hydrolase  54.1 
 
 
183 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.860585  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1936  isochorismatase family protein  51.91 
 
 
183 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0508  isochorismatase family protein  51.91 
 
 
183 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.537066  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0670  isochorismatase family protein  51.91 
 
 
183 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2926  isochorismatase family protein  53.01 
 
 
183 aa  186  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2589  isochorismatase hydrolase  53.01 
 
 
183 aa  185  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0515  isochorismatase hydrolase  53.01 
 
 
183 aa  185  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170108  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0966  isochorismatase family protein  51.91 
 
 
183 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.145103  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3602  isochorismatase hydrolase  53.55 
 
 
183 aa  184  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.865119 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3608  isochorismatase family protein  51.37 
 
 
237 aa  184  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3583  isochorismatase family protein  51.37 
 
 
183 aa  183  9e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.46144  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3597  isochorismatase family protein  50.82 
 
 
237 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2883  isochorismatase hydrolase  53.55 
 
 
183 aa  176  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226746  normal  0.142757 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1652  isochorismatase hydrolase  44.94 
 
 
173 aa  142  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2135  isochorismatase hydrolase  44.08 
 
 
177 aa  135  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.990188 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1403  isochorismatase hydrolase  42.2 
 
 
175 aa  125  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3421  isochorismatase hydrolase  39.77 
 
 
176 aa  124  8.000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1847  isochorismatase hydrolase  40.57 
 
 
177 aa  122  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.614848  hitchhiker  0.00000933231 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3564  isochorismatase hydrolase  34.68 
 
 
177 aa  118  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.247569 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3069  isochorismatase hydrolase  36.02 
 
 
173 aa  108  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000901159  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5659  isochorismatase hydrolase  38.15 
 
 
177 aa  108  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.616311  normal  0.236437 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2534  isochorismatase hydrolase  35.84 
 
 
174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.70955  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  33.15 
 
 
359 aa  108  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  33.76 
 
 
176 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  33.76 
 
 
176 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  33.76 
 
 
176 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  34.39 
 
 
359 aa  106  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  33.14 
 
 
174 aa  106  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  33.12 
 
 
176 aa  104  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  33.33 
 
 
176 aa  104  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  37.78 
 
 
186 aa  104  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1153  isochorismatase hydrolase  30.17 
 
 
181 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  32.69 
 
 
176 aa  102  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1224  isochorismatase hydrolase  30.17 
 
 
181 aa  102  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1927  isochorismatase hydrolase  35.53 
 
 
172 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.110403  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1174  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
216 aa  100  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.910338  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1154  isochorismatase hydrolase  30.17 
 
 
181 aa  100  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.399552  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2838  isochorismatase hydrolase  32.95 
 
 
174 aa  99.8  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102988  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1230  isochorismatase hydrolase  33.91 
 
 
174 aa  99.4  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2188  isochorismatase hydrolase  32.22 
 
 
186 aa  98.2  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288867  normal  0.048401 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4231  isochorismatase hydrolase  37.42 
 
 
194 aa  96.7  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0539738  normal  0.306851 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0251  isochorismatase family protein  33.55 
 
 
176 aa  95.5  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2678  isochorismatase hydrolase  35.06 
 
 
184 aa  94.7  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1721  isochorismatase hydrolase  34.27 
 
 
185 aa  94  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2817  isochorismatase hydrolase  35.2 
 
 
188 aa  91.7  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369083  hitchhiker  0.00306149 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1978  isochorismatase hydrolase  35.67 
 
 
185 aa  90.9  8e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4435  isochorismatase hydrolase  35.95 
 
 
180 aa  89.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3819  isochorismatase hydrolase  35.29 
 
 
180 aa  88.6  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5755  isochorismatase hydrolase  35.29 
 
 
180 aa  88.6  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.066854  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0076  isochorismatase hydrolase  29.55 
 
 
184 aa  88.6  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4549  isochorismatase hydrolase  35.29 
 
 
180 aa  88.6  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.524921 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2701  isochorismatase  32.65 
 
 
168 aa  86.3  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1431  isochorismatase hydrolase  29.7 
 
 
164 aa  85.9  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4942  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 
186 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0334336 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0367  amidase  29.3 
 
 
166 aa  81.6  0.000000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0547  amidase  30.97 
 
 
161 aa  79.3  0.00000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145331  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0845  isochorismatase hydrolase  32.67 
 
 
177 aa  77.8  0.00000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0614531 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
181 aa  75.9  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0489  isochorismatase hydrolase  30.11 
 
 
184 aa  74.7  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4138  isochorismatase hydrolase  37.86 
 
 
211 aa  73.6  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0812  isochorismatase hydrolase  28.31 
 
 
184 aa  72.4  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2347  amidase  29.94 
 
 
164 aa  72.4  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00237714  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1718  isochorismatase hydrolase  27.22 
 
 
196 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.854731  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  35.71 
 
 
187 aa  70.9  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3999  isochorismatase family protein  26.28 
 
 
169 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4278  isochorismatase family protein  26.28 
 
 
169 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4009  isochorismatase family protein  26.28 
 
 
169 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4372  isochorismatase family protein  24.38 
 
 
170 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  33.1 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  30.22 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1761  isochorismatase family protein  27.5 
 
 
186 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8036  putative isochorismatase hydrolase  32.35 
 
 
201 aa  67.8  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4542  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  33.81 
 
 
228 aa  67.8  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5030  isochorismatase hydrolase  26.97 
 
 
186 aa  67  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0593911  decreased coverage  0.00786893 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4391  isochorismatase family protein  23.72 
 
 
170 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4338  isochorismatase family protein  23.57 
 
 
170 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0862  isochorismatase family protein  23.75 
 
 
170 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  33.1 
 
 
211 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0975  isochorismatase hydrolase  30.92 
 
 
172 aa  65.9  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.8451  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  33.1 
 
 
211 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 
196 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  32.39 
 
 
203 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1504  isochorismatase family protein  26.25 
 
 
186 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4160  isochorismatase family protein  26.35 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1476  isochorismatase  26.25 
 
 
186 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.731816  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1620  isochorismatase family protein  26.25 
 
 
186 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  32.88 
 
 
199 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2962  isochorismatase hydrolase  31.51 
 
 
172 aa  63.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.419394  normal  0.652284 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4196  isochorismatase hydrolase  34.96 
 
 
219 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1508  isochorismatase hydrolase  26.75 
 
 
186 aa  63.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4084  isochorismatase hydrolase  34.96 
 
 
219 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  28.87 
 
 
196 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1711  isochorismatase family protein  26.42 
 
 
186 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.08395  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  28.87 
 
 
196 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1656  isochorismatase  26.11 
 
 
186 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3884  isochorismatase hydrolase  30.56 
 
 
199 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
289 aa  63.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>