More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4163 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 199 aa  394  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  99.5 
 
 		 199 aa  393  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4313  isochorismatase hydrolase  93.94 
 
 		 199 aa  332  2e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  83.25 
 
 		 199 aa  297  5e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3884  isochorismatase hydrolase  76.65 
 
 		 199 aa  285  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2540  isochorismatase hydrolase  63.54 
 
 		 198 aa  258  4e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.417405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4420  isochorismatase hydrolase  68.53 
 
 		 199 aa  228  3e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0675  putative isochorismatase  59.47 
 
 		 200 aa  228  3e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3931  isochorismatase hydrolase  64.77 
 
 		 199 aa  224  6e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.835033  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3916  isochorismatase hydrolase  64.77 
 
 		 199 aa  224  6e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3990  isochorismatase hydrolase  64.77 
 
 		 199 aa  224  6e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2275  isochorismatase hydrolase  63.32 
 
 		 199 aa  204  8e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2042  isochorismatase hydrolase  56.85 
 
 		 207 aa  200  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.40855  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3945  isochorismatase hydrolase  63.35 
 
 		 200 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5247  isochorismatase hydrolase  51.81 
 
 		 196 aa  177  9e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.860702 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5288  hypothetical protein  51.78 
 
 		 198 aa  167  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  47.06 
 
 		 223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23720  Isochorismatase hydrolase protein  44.56 
 
 		 197 aa  144  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2741  isochorismatase hydrolase  43.52 
 
 		 198 aa  143  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0122139  normal  0.603247 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3595  hypothetical protein  41.27 
 
 		 198 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0044  isochorismatase hydrolase  40.31 
 
 		 201 aa  137  1e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2225  isochorismatase hydrolase  42.41 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19915  normal  0.0825967 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  40.1 
 
 		 196 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  39.58 
 
 		 196 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  39.58 
 
 		 196 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42820  isochorismatase family hydrolase  41.27 
 
 		 198 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1616  isochorismatase hydrolase  49.49 
 
 		 206 aa  134  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743005  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1849  isochorismatase hydrolase  38.22 
 
 		 196 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.605673 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1914  isochorismatase hydrolase  43.08 
 
 		 203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0052  isochorismatase hydrolase  39.27 
 
 		 201 aa  132  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  44.02 
 
 		 193 aa  131  6e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2039  isochorismatase family protein  37.7 
 
 		 196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  38.54 
 
 		 196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0481  isochorismatase hydrolase  50.26 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.694975  hitchhiker  0.0021355 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  41.62 
 
 		 207 aa  125  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  43.86 
 
 		 193 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  40 
 
 		 228 aa  123  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1718  isochorismatase hydrolase  40.11 
 
 		 196 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.854731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  46.2 
 
 		 186 aa  121  8e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  34.36 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  42.6 
 
 		 187 aa  119  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  34.69 
 
 		 231 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  33.85 
 
 		 231 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 231 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  41.72 
 
 		 181 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  38.46 
 
 		 181 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  36.84 
 
 		 181 aa  115  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2236  isochorismatase hydrolase  44.38 
 
 		 199 aa  115  5e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2676  isochorismatase hydrolase  44.94 
 
 		 182 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  38.25 
 
 		 185 aa  115  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  39.04 
 
 		 216 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  39.16 
 
 		 181 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  38.01 
 
 		 181 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  37.7 
 
 		 289 aa  114  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  37.79 
 
 		 187 aa  112  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  37.79 
 
 		 187 aa  112  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  37.43 
 
 		 187 aa  112  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  36.84 
 
 		 181 aa  112  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  37.43 
 
 		 187 aa  112  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  36.84 
 
 		 187 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  36.84 
 
 		 187 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  36.84 
 
 		 187 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  41.18 
 
 		 210 aa  109  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3430  isochorismatase hydrolase  40.11 
 
 		 184 aa  108  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128039 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1917  isochorismatase hydrolase  43.02 
 
 		 190 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  38.59 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  38.59 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  38.59 
 
 		 203 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1488  isochorismatase hydrolase  37.36 
 
 		 182 aa  105  4e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151105 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  31.11 
 
 		 181 aa  104  9e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0721  isochorismatase hydrolase  35.67 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150785 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  34.12 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  38.04 
 
 		 203 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  36.9 
 
 		 203 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  34.22 
 
 		 234 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0018  isochorismatase family protein  34.68 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.967692 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  37.64 
 
 		 184 aa  101  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  37.93 
 
 		 182 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  39.66 
 
 		 212 aa  98.2  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  35.2 
 
 		 218 aa  93.6  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1846  isochorismatase hydrolase  35.93 
 
 		 187 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255835  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1280  isochorismatase family protein  32.39 
 
 		 184 aa  92.4  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1382  isochorismatase family protein  32.39 
 
 		 184 aa  92.4  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.030054  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1287  isochorismatase hydrolase  29.83 
 
 		 184 aa  92.4  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  32.39 
 
 		 185 aa  91.7  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1454  isochorismatase family protein  31.82 
 
 		 184 aa  91.3  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.40872 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1416  isochorismatase family protein  31.15 
 
 		 184 aa  91.3  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 342 aa  90.9  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  30.6 
 
 		 184 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3001  isochorismatase hydrolase  40 
 
 		 185 aa  89.7  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0439517  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1252  isochorismatase family protein  31.25 
 
 		 185 aa  88.6  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425084  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  31.82 
 
 		 180 aa  88.2  7e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1856  isochorismatase hydrolase  39.38 
 
 		 182 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16857 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  35.29 
 
 		 174 aa  87.4  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3927  isochorismatase family protein  31.11 
 
 		 184 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2233  isochorismatase superfamily hydrolase  39.38 
 
 		 182 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2101  isochorismatase hydrolase  36.53 
 
 		 187 aa  86.7  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.682407  normal  0.139759 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4435  isochorismatase hydrolase  34.48 
 
 		 180 aa  86.3  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  32.85 
 
 		 359 aa  85.5  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  33.91 
 
 		 182 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>