More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1846 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1846  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
187 aa  375  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255835  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2126  isochorismatase hydrolase  46.2 
 
 
182 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.996682  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  45.81 
 
 
212 aa  143  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3001  isochorismatase hydrolase  44.89 
 
 
185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0439517  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  37.64 
 
 
190 aa  134  7.000000000000001e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1280  isochorismatase family protein  37.57 
 
 
184 aa  132  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  37.7 
 
 
185 aa  132  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1382  isochorismatase family protein  37.57 
 
 
184 aa  132  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.030054  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1454  isochorismatase family protein  37.57 
 
 
184 aa  132  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.40872 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0688  isochorismatase hydrolase  39.89 
 
 
184 aa  131  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870626  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1252  isochorismatase family protein  37.16 
 
 
185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425084  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2101  isochorismatase hydrolase  44.57 
 
 
187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.682407  normal  0.139759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4750  isochorismatase hydrolase  43.89 
 
 
186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  35.91 
 
 
184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3208  isochorismatase hydrolase  43.45 
 
 
195 aa  125  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.408182  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1416  isochorismatase family protein  36.46 
 
 
184 aa  125  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3927  isochorismatase family protein  37.02 
 
 
184 aa  123  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1200  isochorismatase family protein  38.55 
 
 
191 aa  123  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.474191  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1287  isochorismatase hydrolase  36.05 
 
 
184 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6128  isochorismatase hydrolase  43.58 
 
 
176 aa  119  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2098  isochorismatase family protein  36.87 
 
 
188 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1215  isochorismatase hydrolase  37.65 
 
 
185 aa  112  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1893  isochorismatase hydrolase  36.72 
 
 
188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.173425  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  42.53 
 
 
223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12730  hypothetical protein  37.85 
 
 
193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673629  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1914  isochorismatase hydrolase  39.2 
 
 
203 aa  105  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1155  hypothetical protein  35.68 
 
 
193 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0863147  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2225  isochorismatase hydrolase  39.51 
 
 
202 aa  99.4  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19915  normal  0.0825967 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1718  isochorismatase hydrolase  37.93 
 
 
196 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.854731  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  32.57 
 
 
210 aa  95.5  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03429  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12220)  37.5 
 
 
230 aa  94.7  7e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.422147  normal  0.109574 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  30.61 
 
 
227 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  35.63 
 
 
182 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  31.52 
 
 
193 aa  89.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  37.74 
 
 
199 aa  89  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  37.65 
 
 
196 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  37.65 
 
 
196 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  30.1 
 
 
212 aa  87.8  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3884  isochorismatase hydrolase  40.77 
 
 
199 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  37.65 
 
 
196 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2236  isochorismatase hydrolase  38.01 
 
 
199 aa  87  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  33.15 
 
 
184 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2540  isochorismatase hydrolase  34.16 
 
 
198 aa  85.9  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.417405  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  32.68 
 
 
181 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  35.37 
 
 
199 aa  85.1  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3595  hypothetical protein  38.36 
 
 
198 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  33.87 
 
 
187 aa  85.1  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  35.37 
 
 
199 aa  85.1  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  37.06 
 
 
196 aa  84.3  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5288  hypothetical protein  37.78 
 
 
198 aa  84  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  31.18 
 
 
207 aa  84  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  31.28 
 
 
193 aa  84  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  35.71 
 
 
186 aa  83.2  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  28.76 
 
 
181 aa  82.4  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1927  isochorismatase hydrolase  36.42 
 
 
172 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.110403  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  32.02 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42820  isochorismatase family hydrolase  37.86 
 
 
198 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0338  isochorismatase hydrolase  30.73 
 
 
183 aa  81.3  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  32.79 
 
 
211 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  32.79 
 
 
211 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0675  putative isochorismatase  34.64 
 
 
200 aa  81.3  0.000000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1616  isochorismatase hydrolase  45.76 
 
 
206 aa  81.3  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743005  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  32 
 
 
203 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  32.58 
 
 
203 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2741  isochorismatase hydrolase  41.22 
 
 
198 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0122139  normal  0.603247 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3990  isochorismatase hydrolase  44.14 
 
 
199 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0044  isochorismatase hydrolase  32.65 
 
 
201 aa  79.3  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3931  isochorismatase hydrolase  44.14 
 
 
199 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.835033  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4313  isochorismatase hydrolase  36.8 
 
 
199 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168777  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3916  isochorismatase hydrolase  44.14 
 
 
199 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664242  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2188  isochorismatase hydrolase  39.44 
 
 
186 aa  79.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288867  normal  0.048401 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  30.46 
 
 
187 aa  79  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  30.46 
 
 
187 aa  79  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  30.46 
 
 
187 aa  79  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23720  Isochorismatase hydrolase protein  40.44 
 
 
197 aa  78.6  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3430  isochorismatase hydrolase  35.06 
 
 
184 aa  78.2  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000128039 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  30.9 
 
 
185 aa  77.8  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0721  isochorismatase hydrolase  27.93 
 
 
182 aa  77.8  0.00000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150785 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  29.07 
 
 
359 aa  77.8  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  29.89 
 
 
187 aa  77.8  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  29.89 
 
 
181 aa  77.8  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  37.82 
 
 
237 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1174  isochorismatase hydrolase  32.91 
 
 
216 aa  77  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.910338  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  28.16 
 
 
181 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1488  isochorismatase hydrolase  29.89 
 
 
182 aa  77.4  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.151105 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  29.89 
 
 
187 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  34.31 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5346  isochorismatase hydrolase  29.88 
 
 
217 aa  76.3  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708564  normal  0.524133 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  29.31 
 
 
181 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  29.89 
 
 
187 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4372  isochorismatase hydrolase  34.04 
 
 
199 aa  76.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0306857  normal  0.52694 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  29.65 
 
 
176 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2039  isochorismatase family protein  33.91 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  29.65 
 
 
176 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  25.84 
 
 
231 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  29.65 
 
 
176 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  25.84 
 
 
231 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  27.33 
 
 
176 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4420  isochorismatase hydrolase  40.3 
 
 
199 aa  75.5  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>