More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1616 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1616  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 206 aa  388  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743005  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0481  isochorismatase hydrolase  76.65 
 
 		 210 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.694975  hitchhiker  0.0021355 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5288  hypothetical protein  61.58 
 
 		 198 aa  191  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1914  isochorismatase hydrolase  53.23 
 
 		 203 aa  177  7e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2225  isochorismatase hydrolase  49.75 
 
 		 202 aa  176  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19915  normal  0.0825967 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  53.27 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23720  Isochorismatase hydrolase protein  47.21 
 
 		 197 aa  161  5.0000000000000005e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42820  isochorismatase family hydrolase  48.45 
 
 		 198 aa  161  6e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2741  isochorismatase hydrolase  51.02 
 
 		 198 aa  159  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0122139  normal  0.603247 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3595  hypothetical protein  45.88 
 
 		 198 aa  155  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  43.37 
 
 		 196 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  43.88 
 
 		 196 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  42.86 
 
 		 196 aa  151  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  42.86 
 
 		 196 aa  151  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2039  isochorismatase family protein  41.92 
 
 		 196 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1718  isochorismatase hydrolase  42.86 
 
 		 196 aa  148  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.854731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3916  isochorismatase hydrolase  47.45 
 
 		 199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664242  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3931  isochorismatase hydrolase  47.45 
 
 		 199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.835033  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3990  isochorismatase hydrolase  47.45 
 
 		 199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  49.49 
 
 		 199 aa  145  6e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  49.49 
 
 		 199 aa  144  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1849  isochorismatase hydrolase  39.9 
 
 		 196 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.605673 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3884  isochorismatase hydrolase  44.9 
 
 		 199 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  49.39 
 
 		 199 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0675  putative isochorismatase  41.71 
 
 		 200 aa  132  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4420  isochorismatase hydrolase  48.17 
 
 		 199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4313  isochorismatase hydrolase  49.24 
 
 		 199 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2275  isochorismatase hydrolase  46.94 
 
 		 199 aa  128  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2540  isochorismatase hydrolase  41.49 
 
 		 198 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.417405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3945  isochorismatase hydrolase  47.89 
 
 		 200 aa  121  8e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0044  isochorismatase hydrolase  36.6 
 
 		 201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  40.2 
 
 		 207 aa  119  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5247  isochorismatase hydrolase  40.51 
 
 		 196 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.860702 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2042  isochorismatase hydrolase  43 
 
 		 207 aa  115  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.40855  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0052  isochorismatase hydrolase  36.08 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  39.79 
 
 		 193 aa  112  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  39.44 
 
 		 193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  38.59 
 
 		 182 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  37.42 
 
 		 181 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  31.84 
 
 		 181 aa  102  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3430  isochorismatase hydrolase  38.55 
 
 		 184 aa  102  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128039 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  34.44 
 
 		 187 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  34.44 
 
 		 187 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  36.31 
 
 		 181 aa  99.8  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  35.8 
 
 		 228 aa  99  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  32.22 
 
 		 181 aa  98.6  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  33.33 
 
 		 187 aa  97.1  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  33.33 
 
 		 187 aa  97.1  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  33.33 
 
 		 187 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  33.33 
 
 		 187 aa  97.1  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  33.33 
 
 		 187 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2676  isochorismatase hydrolase  39.34 
 
 		 182 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  34.46 
 
 		 231 aa  95.9  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  34.46 
 
 		 231 aa  96.3  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  34.46 
 
 		 231 aa  95.9  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1856  isochorismatase hydrolase  40.76 
 
 		 182 aa  94.7  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16857 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  35.84 
 
 		 210 aa  94  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  38.04 
 
 		 187 aa  93.6  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2236  isochorismatase hydrolase  39.88 
 
 		 199 aa  94  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2233  isochorismatase superfamily hydrolase  40.44 
 
 		 182 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  33.9 
 
 		 231 aa  92.4  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  31.67 
 
 		 181 aa  91.3  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  32.22 
 
 		 181 aa  91.7  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1846  isochorismatase hydrolase  43.14 
 
 		 187 aa  91.7  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  37.02 
 
 		 211 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  37.02 
 
 		 211 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  38.27 
 
 		 203 aa  90.5  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  35.71 
 
 		 184 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  38.16 
 
 		 216 aa  89.4  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3507  isochorismatase hydrolase  39.89 
 
 		 182 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  37.76 
 
 		 203 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0018  isochorismatase family protein  32.14 
 
 		 185 aa  89  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.967692 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  37.24 
 
 		 203 aa  89  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  35.83 
 
 		 212 aa  87.4  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  36.22 
 
 		 234 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  31.11 
 
 		 181 aa  87  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  33.1 
 
 		 359 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0488  isochorismatase hydrolase  34.27 
 
 		 209 aa  85.9  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1155  hypothetical protein  37.85 
 
 		 193 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0863147  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12730  hypothetical protein  37.85 
 
 		 193 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  33.1 
 
 		 359 aa  85.1  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  36.82 
 
 		 289 aa  84.7  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  38.03 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0384  isochorismatase hydrolase  32.12 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0721  isochorismatase hydrolase  32.74 
 
 		 182 aa  84.3  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150785 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1488  isochorismatase hydrolase  35.92 
 
 		 182 aa  84  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151105 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1917  isochorismatase hydrolase  35.71 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  33.82 
 
 		 174 aa  84  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  34.07 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4750  isochorismatase hydrolase  34.43 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  28.73 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  33.82 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  33.09 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  33.09 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  33.09 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0771  isochorismatase family protein  32.05 
 
 		 316 aa  82  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3260  isochorismatase hydrolase  36.87 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0706  putative isochorismatase hydrolase  37.93 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  33.09 
 
 		 176 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  34.05 
 
 		 185 aa  80.9  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>