More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0384 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0384  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 313 aa  651    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0771  isochorismatase family protein  72.82 
 
 		 316 aa  480  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0235  isochorismatase hydrolase  68.28 
 
 		 316 aa  436  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.809907 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  43.96 
 
 		 210 aa  158  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  40.54 
 
 		 182 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  43.15 
 
 		 181 aa  136  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  43.84 
 
 		 181 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  38.2 
 
 		 181 aa  135  8e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  34.27 
 
 		 181 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  42.47 
 
 		 187 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  43.84 
 
 		 187 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  43.84 
 
 		 187 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  43.84 
 
 		 187 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  42.47 
 
 		 187 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  43.15 
 
 		 187 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  43.15 
 
 		 181 aa  127  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  43.15 
 
 		 187 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2236  isochorismatase hydrolase  40.74 
 
 		 199 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  38.2 
 
 		 184 aa  126  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  41.01 
 
 		 187 aa  125  7e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3430  isochorismatase hydrolase  37.08 
 
 		 184 aa  124  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128039 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  40.11 
 
 		 193 aa  124  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3507  isochorismatase hydrolase  41.61 
 
 		 182 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2233  isochorismatase superfamily hydrolase  41.61 
 
 		 182 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0018  isochorismatase family protein  38.2 
 
 		 185 aa  123  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.967692 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2676  isochorismatase hydrolase  42.07 
 
 		 182 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  33.89 
 
 		 181 aa  122  7e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1856  isochorismatase hydrolase  40.37 
 
 		 182 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16857 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  39.2 
 
 		 193 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  40.85 
 
 		 186 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1917  isochorismatase hydrolase  36.52 
 
 		 190 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1488  isochorismatase hydrolase  32.77 
 
 		 182 aa  113  5e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151105 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0721  isochorismatase hydrolase  32.57 
 
 		 182 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150785 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1247  isochorismatase hydrolase  43.15 
 
 		 190 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.127255  normal  0.527652 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  36.11 
 
 		 180 aa  104  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  31.46 
 
 		 181 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0449  hypothetical protein  40.83 
 
 		 121 aa  102  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2962  isochorismatase hydrolase  37.41 
 
 		 172 aa  100  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.419394  normal  0.652284 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  35.92 
 
 		 223 aa  99.8  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  35.95 
 
 		 207 aa  99.8  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  33.71 
 
 		 185 aa  99.4  7e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2540  isochorismatase hydrolase  37.27 
 
 		 198 aa  96.3  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.417405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3976  isochorismatase hydrolase  40.14 
 
 		 178 aa  95.9  9e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  35.66 
 
 		 203 aa  95.5  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  35 
 
 		 211 aa  92.8  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  35 
 
 		 211 aa  92.8  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  35 
 
 		 203 aa  92.8  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  37.04 
 
 		 199 aa  92.4  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  34.72 
 
 		 203 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4590  isochorismatase family protein  36.6 
 
 		 177 aa  90.9  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2121  isochorismatase hydrolase  34.53 
 
 		 174 aa  89  8e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.29808  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  35.97 
 
 		 289 aa  89  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3931  isochorismatase hydrolase  37.58 
 
 		 199 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.835033  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  34.51 
 
 		 216 aa  87.8  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3916  isochorismatase hydrolase  37.58 
 
 		 199 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3990  isochorismatase hydrolase  37.58 
 
 		 199 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05268  hypothetical protein  35.77 
 
 		 123 aa  87.4  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0975  isochorismatase hydrolase  35.97 
 
 		 172 aa  87.4  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.8451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0675  putative isochorismatase  33.12 
 
 		 200 aa  86.7  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  34.29 
 
 		 359 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  33.76 
 
 		 231 aa  85.9  9e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  30.81 
 
 		 184 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  33.76 
 
 		 231 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  32.95 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  34.06 
 
 		 359 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  34.38 
 
 		 199 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  33.77 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  34.78 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  34.78 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  34.78 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  27.53 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1280  isochorismatase family protein  30.27 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1382  isochorismatase family protein  30.27 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.030054  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  33.12 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  33.75 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1200  isochorismatase family protein  33.53 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.474191  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3001  isochorismatase hydrolase  36.43 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0439517  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  33.09 
 
 		 228 aa  82.4  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1252  isochorismatase family protein  29.73 
 
 		 185 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425084  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0044  isochorismatase hydrolase  32.41 
 
 		 201 aa  82  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1454  isochorismatase family protein  29.73 
 
 		 184 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.40872 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1287  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 184 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3927  isochorismatase family protein  30.9 
 
 		 184 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  37.5 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0052  isochorismatase hydrolase  31.72 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3208  isochorismatase hydrolase  30.06 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.408182  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3945  isochorismatase hydrolase  39.31 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  29.19 
 
 		 185 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  31.88 
 
 		 176 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  32.61 
 
 		 176 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  30.05 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1416  isochorismatase family protein  29.21 
 
 		 184 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  31.16 
 
 		 176 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1616  isochorismatase hydrolase  34.51 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743005  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2275  isochorismatase hydrolase  37.21 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2101  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.682407  normal  0.139759 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  31.88 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  30.41 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0185  hypothetical protein  34.62 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>