More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4313 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4313  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
199 aa  394  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168777  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  93.94 
 
 
199 aa  353  7.999999999999999e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  93.94 
 
 
199 aa  353  1e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  85.34 
 
 
199 aa  301  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3884  isochorismatase hydrolase  77.16 
 
 
199 aa  290  9e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2540  isochorismatase hydrolase  62.5 
 
 
198 aa  258  6e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.417405  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0675  putative isochorismatase  61.05 
 
 
200 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4420  isochorismatase hydrolase  69.04 
 
 
199 aa  228  5e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3931  isochorismatase hydrolase  62.69 
 
 
199 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.835033  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3916  isochorismatase hydrolase  62.69 
 
 
199 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3990  isochorismatase hydrolase  62.69 
 
 
199 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2275  isochorismatase hydrolase  66.15 
 
 
199 aa  208  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2042  isochorismatase hydrolase  57.29 
 
 
207 aa  202  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.40855  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3945  isochorismatase hydrolase  64.92 
 
 
200 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5247  isochorismatase hydrolase  52.33 
 
 
196 aa  178  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.860702 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5288  hypothetical protein  50.78 
 
 
198 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2741  isochorismatase hydrolase  43.65 
 
 
198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0122139  normal  0.603247 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  45.45 
 
 
223 aa  145  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3595  hypothetical protein  41.8 
 
 
198 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23720  Isochorismatase hydrolase protein  44.16 
 
 
197 aa  144  9e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2225  isochorismatase hydrolase  42.93 
 
 
202 aa  142  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19915  normal  0.0825967 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0044  isochorismatase hydrolase  41.33 
 
 
201 aa  139  3e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  39.59 
 
 
196 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42820  isochorismatase family hydrolase  41.27 
 
 
198 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  39.09 
 
 
196 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  39.09 
 
 
196 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  39.09 
 
 
196 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  45.11 
 
 
193 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1616  isochorismatase hydrolase  49.24 
 
 
206 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743005  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1849  isochorismatase hydrolase  38.22 
 
 
196 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.605673 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1914  isochorismatase hydrolase  42.56 
 
 
203 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0052  isochorismatase hydrolase  39.8 
 
 
201 aa  132  3e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2039  isochorismatase family protein  37.7 
 
 
196 aa  129  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  45.03 
 
 
193 aa  127  9.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  43.3 
 
 
207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0481  isochorismatase hydrolase  50.26 
 
 
210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.694975  hitchhiker  0.0021355 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1718  isochorismatase hydrolase  40.31 
 
 
196 aa  125  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.854731  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  46.2 
 
 
186 aa  123  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  39.36 
 
 
228 aa  122  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  36.22 
 
 
231 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  37.24 
 
 
231 aa  121  8e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  36.73 
 
 
231 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  36.73 
 
 
231 aa  118  6e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2676  isochorismatase hydrolase  46.63 
 
 
182 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  39.04 
 
 
289 aa  115  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  36.26 
 
 
181 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2236  isochorismatase hydrolase  43.79 
 
 
199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  37.87 
 
 
181 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  41.18 
 
 
187 aa  112  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  37.43 
 
 
181 aa  112  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  39.08 
 
 
185 aa  112  5e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  39.16 
 
 
181 aa  111  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  37.43 
 
 
187 aa  111  9e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  37.43 
 
 
187 aa  111  9e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  39.68 
 
 
216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  36.26 
 
 
187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  36.26 
 
 
187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  36.78 
 
 
187 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  36.26 
 
 
187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  36.26 
 
 
181 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  36.84 
 
 
187 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1488  isochorismatase hydrolase  38.95 
 
 
182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.151105 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  40.11 
 
 
211 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  40.11 
 
 
211 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  40.74 
 
 
181 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  39.57 
 
 
203 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3430  isochorismatase hydrolase  39.11 
 
 
184 aa  107  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000128039 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  39.77 
 
 
210 aa  106  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1917  isochorismatase hydrolase  44.64 
 
 
190 aa  105  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  31.84 
 
 
181 aa  103  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0721  isochorismatase hydrolase  34.66 
 
 
182 aa  103  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150785 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0018  isochorismatase family protein  34.68 
 
 
185 aa  102  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.967692 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  38.59 
 
 
203 aa  102  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  37.43 
 
 
203 aa  102  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  34.76 
 
 
234 aa  101  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  32.75 
 
 
190 aa  100  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  40.22 
 
 
212 aa  97.8  9e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  37.93 
 
 
182 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  37.64 
 
 
184 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1287  isochorismatase hydrolase  30.94 
 
 
184 aa  94.4  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1280  isochorismatase family protein  32.2 
 
 
184 aa  94  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1382  isochorismatase family protein  32.2 
 
 
184 aa  94  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.030054  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  32.77 
 
 
185 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1416  isochorismatase family protein  31.52 
 
 
184 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  31.64 
 
 
184 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1454  isochorismatase family protein  32.2 
 
 
184 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.40872 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1846  isochorismatase hydrolase  36.53 
 
 
187 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255835  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
342 aa  92  6e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  33.85 
 
 
218 aa  91.3  9e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1252  isochorismatase family protein  31.64 
 
 
185 aa  90.5  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425084  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12730  hypothetical protein  39.43 
 
 
193 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673629  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4435  isochorismatase hydrolase  36 
 
 
180 aa  89.7  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3927  isochorismatase family protein  31.67 
 
 
184 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  31.25 
 
 
180 aa  87  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5755  isochorismatase hydrolase  34.29 
 
 
180 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.066854  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3819  isochorismatase hydrolase  34.29 
 
 
180 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4549  isochorismatase hydrolase  34.29 
 
 
180 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.524921 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  34.06 
 
 
174 aa  85.5  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  34.3 
 
 
182 aa  85.1  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  32.95 
 
 
185 aa  84.7  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.2688 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>