More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0306 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
342 aa  707    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  68.16 
 
 
187 aa  267  2e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  63.48 
 
 
185 aa  247  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  62.92 
 
 
182 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8036  putative isochorismatase hydrolase  51.96 
 
 
201 aa  185  8e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4542  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2265  GCN5-related N-acetyltransferase  52.9 
 
 
160 aa  173  5e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3260  isochorismatase hydrolase  48.89 
 
 
210 aa  170  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1332  hypothetical protein  47.49 
 
 
209 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2658  isochorismatase hydrolase  47.22 
 
 
217 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2531  isochorismatase hydrolase  47.22 
 
 
240 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.736138 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5942  isochorismatase hydrolase  48.33 
 
 
248 aa  162  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2640  isochorismatase hydrolase  47.25 
 
 
221 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2001  isochorismatase hydrolase  47.25 
 
 
221 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2611  isochorismatase hydrolase  47.25 
 
 
221 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0476  isochorismatase hydrolase  46.37 
 
 
209 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.531958  normal  0.0271328 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0706  putative isochorismatase hydrolase  48.33 
 
 
210 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4084  isochorismatase hydrolase  43.02 
 
 
219 aa  149  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15140  hypothetical protein  46.37 
 
 
209 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.163225  hitchhiker  0.0000214815 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4196  isochorismatase hydrolase  43.02 
 
 
219 aa  149  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4138  isochorismatase hydrolase  44.2 
 
 
211 aa  149  7e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0488  isochorismatase hydrolase  46.41 
 
 
209 aa  146  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4081  isochorismatase hydrolase  43.11 
 
 
193 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  41.52 
 
 
231 aa  125  7e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  41.52 
 
 
231 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  41.52 
 
 
231 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  40.91 
 
 
228 aa  122  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  40.35 
 
 
231 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2726  isochorismatase hydrolase  38.59 
 
 
213 aa  113  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.312269  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  34.64 
 
 
180 aa  112  1.0000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1488  isochorismatase hydrolase  34.46 
 
 
182 aa  110  3e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.151105 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  31.28 
 
 
181 aa  110  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  40.94 
 
 
289 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0721  isochorismatase hydrolase  36.02 
 
 
182 aa  110  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150785 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  38.86 
 
 
216 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  34.43 
 
 
184 aa  106  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  37.43 
 
 
203 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  32.22 
 
 
181 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  31.67 
 
 
181 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  38.46 
 
 
203 aa  103  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  32.78 
 
 
181 aa  102  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  30.17 
 
 
359 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  31.67 
 
 
181 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  37.02 
 
 
203 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  36.87 
 
 
211 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2676  isochorismatase hydrolase  33.51 
 
 
182 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  36.87 
 
 
211 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  35.8 
 
 
234 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 
193 aa  99.4  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  31.67 
 
 
187 aa  99  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  31.67 
 
 
187 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  32.22 
 
 
181 aa  98.6  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  31.11 
 
 
187 aa  98.6  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  31.11 
 
 
187 aa  98.6  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  31.11 
 
 
187 aa  98.6  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  28.41 
 
 
193 aa  97.8  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  31.11 
 
 
187 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  31.11 
 
 
187 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3430  isochorismatase hydrolase  32.24 
 
 
184 aa  97.4  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000128039 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  32.79 
 
 
223 aa  96.3  7e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  31.02 
 
 
181 aa  96.3  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  32.77 
 
 
185 aa  96.3  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  30.94 
 
 
187 aa  95.9  8e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2236  isochorismatase hydrolase  32.39 
 
 
199 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  30.34 
 
 
182 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  37.06 
 
 
174 aa  94.4  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  29.34 
 
 
359 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  31.49 
 
 
210 aa  92  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  35.66 
 
 
176 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  31.4 
 
 
186 aa  91.7  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  32.22 
 
 
207 aa  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2121  isochorismatase hydrolase  37.41 
 
 
174 aa  91.7  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.29808  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2540  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 
198 aa  90.5  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.417405  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0675  putative isochorismatase  32.75 
 
 
200 aa  89.7  7e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  34.97 
 
 
176 aa  89.4  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  34.97 
 
 
176 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  34.97 
 
 
176 aa  89.4  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  34.97 
 
 
176 aa  89  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1856  isochorismatase hydrolase  31.32 
 
 
182 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.16857 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  33.77 
 
 
199 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1917  isochorismatase hydrolase  32.78 
 
 
190 aa  88.2  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  34.01 
 
 
199 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 
196 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  33.77 
 
 
199 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  28.74 
 
 
196 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0235  isochorismatase hydrolase  29.61 
 
 
316 aa  87.4  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.809907 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  28.74 
 
 
196 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4435  isochorismatase hydrolase  40.58 
 
 
180 aa  86.3  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  32.87 
 
 
176 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2962  isochorismatase hydrolase  34.27 
 
 
172 aa  85.5  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.419394  normal  0.652284 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  28.16 
 
 
196 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3884  isochorismatase hydrolase  31.21 
 
 
199 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0481  isochorismatase hydrolase  39.44 
 
 
210 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.694975  hitchhiker  0.0021355 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3507  isochorismatase hydrolase  31.46 
 
 
182 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  35.42 
 
 
186 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3990  isochorismatase hydrolase  33.1 
 
 
199 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3916  isochorismatase hydrolase  33.1 
 
 
199 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664242  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3931  isochorismatase hydrolase  33.1 
 
 
199 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.835033  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4313  isochorismatase hydrolase  35.71 
 
 
199 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168777  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5755  isochorismatase hydrolase  39.86 
 
 
180 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.066854  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4549  isochorismatase hydrolase  39.86 
 
 
180 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.524921 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>