More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3854 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 199 aa  395  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  99.5 
 
 		 199 aa  393  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4313  isochorismatase hydrolase  93.94 
 
 		 199 aa  332  2e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  83.25 
 
 		 199 aa  297  6e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3884  isochorismatase hydrolase  76.14 
 
 		 199 aa  285  4e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2540  isochorismatase hydrolase  63.02 
 
 		 198 aa  257  9e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.417405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0675  putative isochorismatase  59.47 
 
 		 200 aa  228  4e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4420  isochorismatase hydrolase  68.02 
 
 		 199 aa  227  7e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3931  isochorismatase hydrolase  64.25 
 
 		 199 aa  223  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.835033  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3916  isochorismatase hydrolase  64.25 
 
 		 199 aa  223  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3990  isochorismatase hydrolase  64.25 
 
 		 199 aa  223  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2275  isochorismatase hydrolase  62.81 
 
 		 199 aa  203  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2042  isochorismatase hydrolase  56.85 
 
 		 207 aa  200  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.40855  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3945  isochorismatase hydrolase  63.87 
 
 		 200 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5247  isochorismatase hydrolase  51.3 
 
 		 196 aa  176  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.860702 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5288  hypothetical protein  51.27 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  46.52 
 
 		 223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23720  Isochorismatase hydrolase protein  44.56 
 
 		 197 aa  144  6e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2741  isochorismatase hydrolase  44.04 
 
 		 198 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0122139  normal  0.603247 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3595  hypothetical protein  41.8 
 
 		 198 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  40.62 
 
 		 196 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0044  isochorismatase hydrolase  40.31 
 
 		 201 aa  137  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2225  isochorismatase hydrolase  41.88 
 
 		 202 aa  136  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19915  normal  0.0825967 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  40.1 
 
 		 196 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  40.1 
 
 		 196 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42820  isochorismatase family hydrolase  41.8 
 
 		 198 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1616  isochorismatase hydrolase  49.49 
 
 		 206 aa  135  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743005  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1849  isochorismatase hydrolase  38.74 
 
 		 196 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.605673 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1914  isochorismatase hydrolase  42.56 
 
 		 203 aa  132  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0052  isochorismatase hydrolase  39.27 
 
 		 201 aa  132  5e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2039  isochorismatase family protein  38.22 
 
 		 196 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  38.54 
 
 		 196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  43.48 
 
 		 193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0481  isochorismatase hydrolase  50.26 
 
 		 210 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.694975  hitchhiker  0.0021355 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1718  isochorismatase hydrolase  40.64 
 
 		 196 aa  125  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.854731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  41.54 
 
 		 207 aa  125  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  43.27 
 
 		 193 aa  124  7e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  40 
 
 		 228 aa  124  8.000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  46.78 
 
 		 186 aa  122  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  34.36 
 
 		 231 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  34.69 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  33.85 
 
 		 231 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  42.01 
 
 		 187 aa  118  7e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 231 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  41.72 
 
 		 181 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2676  isochorismatase hydrolase  45.51 
 
 		 182 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  39.04 
 
 		 216 aa  115  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  37.7 
 
 		 289 aa  114  6.9999999999999995e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2236  isochorismatase hydrolase  43.79 
 
 		 199 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  37.87 
 
 		 181 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  39.16 
 
 		 181 aa  114  8.999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  36.26 
 
 		 181 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  37.7 
 
 		 185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  37.43 
 
 		 181 aa  112  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  37.21 
 
 		 187 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  37.21 
 
 		 187 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  36.26 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  36.26 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  36.84 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  36.84 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  36.26 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  36.26 
 
 		 181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  40.59 
 
 		 210 aa  108  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1917  isochorismatase hydrolase  43.02 
 
 		 190 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  38.59 
 
 		 211 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  38.59 
 
 		 211 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3430  isochorismatase hydrolase  39.55 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128039 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  38.59 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1488  isochorismatase hydrolase  37.36 
 
 		 182 aa  105  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151105 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  31.67 
 
 		 181 aa  105  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  36.9 
 
 		 203 aa  104  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0721  isochorismatase hydrolase  35.67 
 
 		 182 aa  104  9e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150785 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  38.04 
 
 		 203 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  34.22 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  33.53 
 
 		 190 aa  102  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  37.64 
 
 		 184 aa  102  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  38.51 
 
 		 182 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0018  isochorismatase family protein  34.1 
 
 		 185 aa  101  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.967692 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  39.66 
 
 		 212 aa  98.2  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1287  isochorismatase hydrolase  30.39 
 
 		 184 aa  93.6  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  35.2 
 
 		 218 aa  93.6  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  32.95 
 
 		 185 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1846  isochorismatase hydrolase  35.93 
 
 		 187 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1416  isochorismatase family protein  31.69 
 
 		 184 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1454  isochorismatase family protein  32.39 
 
 		 184 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.40872 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  31.15 
 
 		 184 aa  91.7  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 342 aa  91.3  8e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1280  isochorismatase family protein  31.82 
 
 		 184 aa  91.3  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1382  isochorismatase family protein  31.82 
 
 		 184 aa  91.3  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.030054  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1252  isochorismatase family protein  31.82 
 
 		 185 aa  89.7  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425084  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1856  isochorismatase hydrolase  40 
 
 		 182 aa  89  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16857 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  32.39 
 
 		 180 aa  89.4  4e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3001  isochorismatase hydrolase  39.29 
 
 		 185 aa  88.6  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0439517  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3927  isochorismatase family protein  31.67 
 
 		 184 aa  88.6  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  35.29 
 
 		 174 aa  88.2  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2233  isochorismatase superfamily hydrolase  40 
 
 		 182 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4435  isochorismatase hydrolase  34.48 
 
 		 180 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  32.85 
 
 		 359 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2101  isochorismatase hydrolase  35.93 
 
 		 187 aa  85.9  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.682407  normal  0.139759 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  33.91 
 
 		 182 aa  85.1  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>