More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0481 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0481  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 210 aa  392  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.694975  hitchhiker  0.0021355 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1616  isochorismatase hydrolase  76.65 
 
 		 206 aa  240  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743005  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5288  hypothetical protein  61.46 
 
 		 198 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2225  isochorismatase hydrolase  54.26 
 
 		 202 aa  187  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19915  normal  0.0825967 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1914  isochorismatase hydrolase  55.56 
 
 		 203 aa  179  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3595  hypothetical protein  51.26 
 
 		 198 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42820  isochorismatase family hydrolase  51.26 
 
 		 198 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2039  isochorismatase family protein  45.96 
 
 		 196 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23720  Isochorismatase hydrolase protein  51.3 
 
 		 197 aa  173  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  45.45 
 
 		 196 aa  168  6e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1718  isochorismatase hydrolase  45.96 
 
 		 196 aa  168  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.854731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  54.36 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1849  isochorismatase hydrolase  44.44 
 
 		 196 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.605673 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  44.44 
 
 		 196 aa  165  5e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  44.44 
 
 		 196 aa  165  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  44.44 
 
 		 196 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2741  isochorismatase hydrolase  51.81 
 
 		 198 aa  162  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0122139  normal  0.603247 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  50.78 
 
 		 199 aa  154  7e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  50.78 
 
 		 199 aa  154  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3884  isochorismatase hydrolase  48.21 
 
 		 199 aa  152  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3990  isochorismatase hydrolase  47.64 
 
 		 199 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3931  isochorismatase hydrolase  47.64 
 
 		 199 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.835033  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3916  isochorismatase hydrolase  47.64 
 
 		 199 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664242  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  51.19 
 
 		 199 aa  150  8.999999999999999e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0044  isochorismatase hydrolase  41.36 
 
 		 201 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4313  isochorismatase hydrolase  50.78 
 
 		 199 aa  137  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2540  isochorismatase hydrolase  42.78 
 
 		 198 aa  136  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.417405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0052  isochorismatase hydrolase  40.84 
 
 		 201 aa  135  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4420  isochorismatase hydrolase  48.99 
 
 		 199 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0675  putative isochorismatase  44.09 
 
 		 200 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2275  isochorismatase hydrolase  48.65 
 
 		 199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5247  isochorismatase hydrolase  43.01 
 
 		 196 aa  128  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.860702 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  42.36 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2042  isochorismatase hydrolase  46.71 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.40855  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  41.76 
 
 		 182 aa  118  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  43.07 
 
 		 203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  41.79 
 
 		 211 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  41.79 
 
 		 211 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3945  isochorismatase hydrolase  45.77 
 
 		 200 aa  115  6e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  41.79 
 
 		 203 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2676  isochorismatase hydrolase  44.44 
 
 		 182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  37.24 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  41.72 
 
 		 181 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  40.48 
 
 		 181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  39.89 
 
 		 193 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  35.38 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  35.38 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  38.8 
 
 		 184 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  35.38 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  37.23 
 
 		 193 aa  106  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  35.38 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  39.8 
 
 		 203 aa  106  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  32.53 
 
 		 181 aa  105  5e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  39.2 
 
 		 234 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  38.59 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  40.69 
 
 		 218 aa  102  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  38.73 
 
 		 210 aa  102  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  40.22 
 
 		 289 aa  101  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  42.55 
 
 		 216 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  36.93 
 
 		 182 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2236  isochorismatase hydrolase  44.58 
 
 		 199 aa  99.8  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  31.67 
 
 		 181 aa  99.8  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1488  isochorismatase hydrolase  38.04 
 
 		 182 aa  99.4  4e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151105 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2233  isochorismatase superfamily hydrolase  44.17 
 
 		 182 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  33.69 
 
 		 187 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  33.69 
 
 		 187 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  32.78 
 
 		 184 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  32.62 
 
 		 187 aa  96.7  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  32.62 
 
 		 187 aa  96.7  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  32.62 
 
 		 187 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  33.9 
 
 		 185 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  38.33 
 
 		 186 aa  97.1  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  32.62 
 
 		 187 aa  96.7  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  32.62 
 
 		 187 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  32.04 
 
 		 181 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  32.6 
 
 		 181 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  38.67 
 
 		 212 aa  95.9  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3507  isochorismatase hydrolase  43.56 
 
 		 182 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  37.2 
 
 		 342 aa  95.1  7e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1454  isochorismatase family protein  33.33 
 
 		 184 aa  94.7  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.40872 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  37.04 
 
 		 185 aa  94.4  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8036  putative isochorismatase hydrolase  37.14 
 
 		 201 aa  94.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1917  isochorismatase hydrolase  41.67 
 
 		 190 aa  94  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0721  isochorismatase hydrolase  35.12 
 
 		 182 aa  93.2  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150785 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1280  isochorismatase family protein  33.33 
 
 		 184 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1382  isochorismatase family protein  33.33 
 
 		 184 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.030054  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1856  isochorismatase hydrolase  42.86 
 
 		 182 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16857 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  32.6 
 
 		 187 aa  93.2  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1846  isochorismatase hydrolase  43.14 
 
 		 187 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255835  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1252  isochorismatase family protein  32.77 
 
 		 185 aa  92.4  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425084  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3430  isochorismatase hydrolase  38.12 
 
 		 184 aa  92.4  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128039 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  33.33 
 
 		 359 aa  92  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3927  isochorismatase family protein  31.84 
 
 		 184 aa  91.7  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3260  isochorismatase hydrolase  36.46 
 
 		 210 aa  91.3  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  30.46 
 
 		 180 aa  91.3  9e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0338  isochorismatase hydrolase  38.55 
 
 		 183 aa  91.3  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  30.23 
 
 		 176 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3208  isochorismatase hydrolase  36.56 
 
 		 195 aa  90.1  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.408182  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  32.62 
 
 		 359 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1200  isochorismatase family protein  40.45 
 
 		 191 aa  89.7  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.474191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>