More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0338 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0338  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 183 aa  363  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4372  isochorismatase hydrolase  59.16 
 
 		 199 aa  212  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0306857  normal  0.52694 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3130  isochorismatase hydrolase  56.77 
 
 		 194 aa  202  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820956  normal  0.361806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2169  isochorismatase hydrolase  55.67 
 
 		 211 aa  194  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3939  isochorismatase hydrolase  44.44 
 
 		 186 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.136156 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0095  isochorismatase hydrolase  43.58 
 
 		 183 aa  132  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1968  isochorismatase hydrolase  45.86 
 
 		 197 aa  130  7.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.357759  normal  0.0178408 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0757  isochorismatase hydrolase  46.15 
 
 		 188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.000750492  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0076  isochorismatase hydrolase  42.46 
 
 		 182 aa  123  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5057  isochorismatase hydrolase  42.78 
 
 		 188 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.136743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4299  isochorismatase hydrolase  42.78 
 
 		 188 aa  119  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0158  isochorismatase hydrolase  41.81 
 
 		 179 aa  117  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1463  isochorismatase hydrolase  41.99 
 
 		 194 aa  115  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2922  hydrolase  42.54 
 
 		 188 aa  115  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.126039  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2619  isochorismatase hydrolase  40.56 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3001  isochorismatase hydrolase  39.56 
 
 		 202 aa  112  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.951978 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2520  isochorismatase hydrolase  36.67 
 
 		 188 aa  102  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.152946  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  32.02 
 
 		 182 aa  90.9  9e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  33.71 
 
 		 185 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  34.95 
 
 		 212 aa  88.2  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3001  isochorismatase hydrolase  36.62 
 
 		 185 aa  87  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0439517  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2225  isochorismatase hydrolase  34.91 
 
 		 202 aa  87  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19915  normal  0.0825967 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3927  isochorismatase family protein  33.15 
 
 		 184 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1454  isochorismatase family protein  33.71 
 
 		 184 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.40872 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4750  isochorismatase hydrolase  30.11 
 
 		 186 aa  86.7  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1280  isochorismatase family protein  33.71 
 
 		 184 aa  85.9  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1382  isochorismatase family protein  33.71 
 
 		 184 aa  85.9  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.030054  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  32.4 
 
 		 184 aa  84.7  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1416  isochorismatase family protein  32.02 
 
 		 184 aa  84.3  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  31.84 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1252  isochorismatase family protein  33.15 
 
 		 185 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425084  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1914  isochorismatase hydrolase  37.31 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1846  isochorismatase hydrolase  30.73 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  30.43 
 
 		 181 aa  81.3  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1856  isochorismatase hydrolase  35.66 
 
 		 182 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16857 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2233  isochorismatase superfamily hydrolase  35.66 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42820  isochorismatase family hydrolase  35.43 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3507  isochorismatase hydrolase  34.97 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2658  isochorismatase hydrolase  30.22 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1155  hypothetical protein  35.25 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0863147  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3595  hypothetical protein  36 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2531  isochorismatase hydrolase  29.67 
 
 		 240 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.736138 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1287  isochorismatase hydrolase  31.21 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3208  isochorismatase hydrolase  32.37 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.408182  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2126  isochorismatase hydrolase  30.43 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.996682  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3564  isochorismatase hydrolase  32.56 
 
 		 177 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247569 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1488  isochorismatase hydrolase  26.95 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151105 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1200  isochorismatase family protein  31.07 
 
 		 191 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.474191  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12730  hypothetical protein  31.36 
 
 		 193 aa  74.3  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  30.71 
 
 		 184 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  34.27 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  35.21 
 
 		 342 aa  73.6  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  28.57 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0721  isochorismatase hydrolase  27.66 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150785 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  35.86 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  33.57 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  27.86 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  28.96 
 
 		 359 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  33.57 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  30.11 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  28.91 
 
 		 222 aa  72  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  28.41 
 
 		 176 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  28.41 
 
 		 176 aa  72  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  28.41 
 
 		 176 aa  72  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8036  putative isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 201 aa  71.2  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2640  isochorismatase hydrolase  28.8 
 
 		 221 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0688  isochorismatase hydrolase  28.18 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  29.82 
 
 		 176 aa  70.9  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  35.66 
 
 		 182 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  28.41 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  28.37 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2101  isochorismatase hydrolase  29.71 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.682407  normal  0.139759 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1893  isochorismatase hydrolase  33.57 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.173425  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0044  isochorismatase hydrolase  28.25 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  29.38 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6128  isochorismatase hydrolase  32.6 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2001  isochorismatase hydrolase  28.8 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0032  isochorismatase hydrolase  31.16 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2611  isochorismatase hydrolase  28.8 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1718  isochorismatase hydrolase  31.95 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.854731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0675  putative isochorismatase  31.33 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  34.25 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  29.69 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  29.48 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  31.08 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  31.08 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  32.58 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  27.32 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0052  isochorismatase hydrolase  28.89 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5755  isochorismatase hydrolase  30.9 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.066854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3819  isochorismatase hydrolase  30.9 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4549  isochorismatase hydrolase  30.9 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.524921 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0481  isochorismatase hydrolase  42.27 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.694975  hitchhiker  0.0021355 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  34.97 
 
 		 185 aa  67.8  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  29.07 
 
 		 223 aa  67.8  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1174  isochorismatase hydrolase  33.09 
 
 		 216 aa  67.8  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.910338  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>