More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2266 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 187 aa  390  1e-108  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  68.16 
 
 		 342 aa  267  5.9999999999999995e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  65.75 
 
 		 185 aa  266  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  64.09 
 
 		 182 aa  263  8e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8036  putative isochorismatase hydrolase  52.94 
 
 		 201 aa  199  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1332  hypothetical protein  48.35 
 
 		 209 aa  174  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4196  isochorismatase hydrolase  44.81 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4084  isochorismatase hydrolase  44.81 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3260  isochorismatase hydrolase  46.99 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2658  isochorismatase hydrolase  46.15 
 
 		 217 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2611  isochorismatase hydrolase  46.2 
 
 		 221 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2640  isochorismatase hydrolase  46.2 
 
 		 221 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2001  isochorismatase hydrolase  46.2 
 
 		 221 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5942  isochorismatase hydrolase  46.7 
 
 		 248 aa  161  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2531  isochorismatase hydrolase  46.15 
 
 		 240 aa  161  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.736138 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15140  hypothetical protein  48.35 
 
 		 209 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.163225  hitchhiker  0.0000214815 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0476  isochorismatase hydrolase  42.62 
 
 		 209 aa  153  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.531958  normal  0.0271328 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0706  putative isochorismatase hydrolase  45.36 
 
 		 210 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0488  isochorismatase hydrolase  45.65 
 
 		 209 aa  145  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4081  isochorismatase hydrolase  43.11 
 
 		 193 aa  140  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4138  isochorismatase hydrolase  40 
 
 		 211 aa  135  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  38.73 
 
 		 231 aa  111  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  38.73 
 
 		 231 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  38.73 
 
 		 231 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  37.57 
 
 		 231 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  32.22 
 
 		 180 aa  106  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  28.18 
 
 		 181 aa  105  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  36.93 
 
 		 228 aa  105  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  34.64 
 
 		 211 aa  104  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  34.64 
 
 		 211 aa  104  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  34.64 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2726  isochorismatase hydrolase  38.33 
 
 		 213 aa  102  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.312269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1488  isochorismatase hydrolase  32.04 
 
 		 182 aa  102  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151105 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  33.51 
 
 		 203 aa  101  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  32.78 
 
 		 184 aa  100  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  32.07 
 
 		 203 aa  99.4  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  33.8 
 
 		 174 aa  98.6  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  33.8 
 
 		 176 aa  97.8  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  33.57 
 
 		 359 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  30.73 
 
 		 187 aa  97.1  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  30.73 
 
 		 187 aa  97.1  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  30.73 
 
 		 187 aa  97.1  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0721  isochorismatase hydrolase  32.26 
 
 		 182 aa  97.1  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150785 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  30.17 
 
 		 187 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  29.61 
 
 		 181 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  32.87 
 
 		 176 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  30.17 
 
 		 187 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  30.17 
 
 		 187 aa  95.5  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  29.05 
 
 		 181 aa  95.5  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  30.17 
 
 		 187 aa  95.5  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  32.17 
 
 		 176 aa  95.5  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  30.29 
 
 		 218 aa  95.1  6e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  32.39 
 
 		 176 aa  94.7  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  32.39 
 
 		 176 aa  94.7  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  32.39 
 
 		 176 aa  94.7  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  36.99 
 
 		 289 aa  94.4  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  32.87 
 
 		 359 aa  94  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  31.32 
 
 		 182 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  29.61 
 
 		 181 aa  93.2  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 223 aa  93.2  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  32.09 
 
 		 185 aa  93.2  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  30.73 
 
 		 196 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  28.26 
 
 		 193 aa  92.8  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  30.39 
 
 		 181 aa  92  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  31.11 
 
 		 181 aa  91.7  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  32.95 
 
 		 234 aa  91.7  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  34.46 
 
 		 216 aa  91.3  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2676  isochorismatase hydrolase  31.55 
 
 		 182 aa  91.3  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  29.71 
 
 		 196 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  32.6 
 
 		 207 aa  90.5  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  29.71 
 
 		 196 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2236  isochorismatase hydrolase  32.08 
 
 		 199 aa  90.1  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 		 181 aa  90.1  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2121  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 174 aa  89.7  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.29808  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3430  isochorismatase hydrolase  30.43 
 
 		 184 aa  89.4  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128039 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  29.28 
 
 		 193 aa  89.4  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0158  isochorismatase hydrolase  32.26 
 
 		 179 aa  87.8  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  29.14 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  28.96 
 
 		 186 aa  85.9  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2962  isochorismatase hydrolase  33.11 
 
 		 172 aa  85.5  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.419394  normal  0.652284 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3421  isochorismatase hydrolase  35.58 
 
 		 176 aa  84.7  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12730  hypothetical protein  29.61 
 
 		 193 aa  84.3  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1155  hypothetical protein  30.17 
 
 		 193 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0863147  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2126  isochorismatase hydrolase  30.11 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.996682  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3069  isochorismatase hydrolase  30.34 
 
 		 173 aa  83.2  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000901159  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1849  isochorismatase hydrolase  30.11 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.605673 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3507  isochorismatase hydrolase  31.32 
 
 		 182 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2233  isochorismatase superfamily hydrolase  31.15 
 
 		 182 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  33.79 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  26.78 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2039  isochorismatase family protein  30.46 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2135  isochorismatase hydrolase  37.59 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.990188 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  28.57 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2188  isochorismatase hydrolase  32.41 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288867  normal  0.048401 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3208  isochorismatase hydrolase  30.28 
 
 		 195 aa  80.9  0.000000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.408182  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5030  isochorismatase hydrolase  33.81 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0593911  decreased coverage  0.00786893 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1917  isochorismatase hydrolase  32.22 
 
 		 190 aa  80.9  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1403  isochorismatase hydrolase  36.96 
 
 		 175 aa  80.1  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0481  isochorismatase hydrolase  36.62 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.694975  hitchhiker  0.0021355 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5659  isochorismatase hydrolase  35.42 
 
 		 177 aa  79  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.616311  normal  0.236437 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>