More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5030 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5030  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
186 aa  375  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0593911  decreased coverage  0.00786893 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  41.88 
 
 
186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2188  isochorismatase hydrolase  41.27 
 
 
186 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288867  normal  0.048401 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0812  isochorismatase hydrolase  44.07 
 
 
184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1721  isochorismatase hydrolase  40.96 
 
 
185 aa  122  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4942  isochorismatase hydrolase  43.93 
 
 
186 aa  121  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0334336 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0076  isochorismatase hydrolase  41.48 
 
 
184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1174  isochorismatase hydrolase  38.54 
 
 
216 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.910338  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0489  isochorismatase hydrolase  39.66 
 
 
184 aa  111  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2817  isochorismatase hydrolase  41.48 
 
 
188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369083  hitchhiker  0.00306149 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2534  isochorismatase hydrolase  40.12 
 
 
174 aa  108  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.70955  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3421  isochorismatase hydrolase  39.89 
 
 
176 aa  107  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5659  isochorismatase hydrolase  38.46 
 
 
177 aa  105  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.616311  normal  0.236437 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2838  isochorismatase hydrolase  38.37 
 
 
174 aa  105  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102988  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1978  isochorismatase hydrolase  40.7 
 
 
185 aa  105  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  36.81 
 
 
359 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  36.81 
 
 
174 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  36.81 
 
 
176 aa  101  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  36.81 
 
 
176 aa  101  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  36.81 
 
 
176 aa  101  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1403  isochorismatase hydrolase  39.33 
 
 
175 aa  101  8e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  36.2 
 
 
359 aa  100  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  34.97 
 
 
176 aa  100  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  34.97 
 
 
176 aa  98.2  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3564  isochorismatase hydrolase  36.11 
 
 
177 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.247569 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1847  isochorismatase hydrolase  37.06 
 
 
177 aa  96.7  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.614848  hitchhiker  0.00000933231 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2448  isochorismatase hydrolase  34.38 
 
 
191 aa  95.9  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00167941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2701  isochorismatase  35.71 
 
 
168 aa  95.1  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3069  isochorismatase hydrolase  35.58 
 
 
173 aa  94.7  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000901159  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  36.43 
 
 
176 aa  94.7  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0251  isochorismatase family protein  34.59 
 
 
176 aa  93.6  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3597  isochorismatase family protein  37.02 
 
 
237 aa  91.7  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3608  isochorismatase family protein  37.02 
 
 
237 aa  90.9  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1936  isochorismatase family protein  37.02 
 
 
183 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0508  isochorismatase family protein  37.02 
 
 
183 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.537066  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0966  isochorismatase family protein  37.02 
 
 
183 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.145103  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0670  isochorismatase family protein  37.02 
 
 
183 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3583  isochorismatase family protein  37.02 
 
 
183 aa  89.4  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.46144  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0487  isochorismatase hydrolase  35.2 
 
 
183 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.972949 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3602  isochorismatase hydrolase  35.2 
 
 
183 aa  87.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.865119 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0445  isochorismatase hydrolase  35.2 
 
 
183 aa  86.7  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.230544 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2678  isochorismatase hydrolase  33.14 
 
 
184 aa  86.7  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2926  isochorismatase family protein  37.28 
 
 
183 aa  86.3  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0419  isochorismatase hydrolase  35.2 
 
 
183 aa  86.7  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.860585  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2589  isochorismatase hydrolase  34.64 
 
 
183 aa  85.9  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0515  isochorismatase hydrolase  34.64 
 
 
183 aa  85.9  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170108  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1230  isochorismatase hydrolase  32.22 
 
 
174 aa  85.5  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1652  isochorismatase hydrolase  31.01 
 
 
173 aa  84  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  39.16 
 
 
214 aa  82.8  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2135  isochorismatase hydrolase  35.26 
 
 
177 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.990188 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  33.81 
 
 
187 aa  80.5  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2883  isochorismatase hydrolase  34.64 
 
 
183 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226746  normal  0.142757 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  37.84 
 
 
201 aa  79  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1224  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 
181 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 
239 aa  78.2  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1431  isochorismatase hydrolase  25.79 
 
 
164 aa  77.8  0.00000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1153  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 
181 aa  77.8  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1927  isochorismatase hydrolase  31.72 
 
 
172 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.110403  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  31.65 
 
 
182 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2275  isochorismatase hydrolase  42.86 
 
 
199 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  40.29 
 
 
199 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3990  isochorismatase hydrolase  40.15 
 
 
199 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  30.67 
 
 
239 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3916  isochorismatase hydrolase  40.15 
 
 
199 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664242  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3931  isochorismatase hydrolase  40.15 
 
 
199 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.835033  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  37.04 
 
 
239 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  42.2 
 
 
223 aa  75.9  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  40.38 
 
 
231 aa  75.9  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1154  isochorismatase hydrolase  29.67 
 
 
181 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.399552  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4420  isochorismatase hydrolase  42.64 
 
 
199 aa  75.1  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  32.23 
 
 
247 aa  73.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  39.58 
 
 
196 aa  73.6  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0547  amidase  30.3 
 
 
161 aa  73.6  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145331  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  42.67 
 
 
227 aa  72.8  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  35.33 
 
 
188 aa  73.6  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  38.28 
 
 
201 aa  73.6  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0845  isochorismatase hydrolase  29.2 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0614531 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  36.94 
 
 
233 aa  72  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  36.81 
 
 
199 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  35.64 
 
 
227 aa  72.4  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  29.24 
 
 
240 aa  72  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4313  isochorismatase hydrolase  40 
 
 
199 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168777  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  37.5 
 
 
201 aa  72  0.000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  33.9 
 
 
241 aa  72  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  35.86 
 
 
201 aa  71.6  0.000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  36.81 
 
 
199 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0675  putative isochorismatase  35.92 
 
 
200 aa  71.6  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  37.5 
 
 
230 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  36.54 
 
 
234 aa  71.2  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  37.5 
 
 
230 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 
228 aa  70.9  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4714  isochorismatase hydrolase  37.87 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  30.37 
 
 
185 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  30.94 
 
 
181 aa  69.7  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2236  isochorismatase hydrolase  35.04 
 
 
199 aa  70.1  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3884  isochorismatase hydrolase  36.81 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  30.72 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  35.67 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1272  isochorismatase hydrolase  35.62 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107065  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1761  isochorismatase family protein  27.54 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>