More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5659 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5659  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 177 aa  360  4e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.616311  normal  0.236437 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1403  isochorismatase hydrolase  51.98 
 
 		 175 aa  168  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3421  isochorismatase hydrolase  50.28 
 
 		 176 aa  163  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1847  isochorismatase hydrolase  48.24 
 
 		 177 aa  162  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.614848  hitchhiker  0.00000933231 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2135  isochorismatase hydrolase  51.74 
 
 		 177 aa  155  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.990188 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3564  isochorismatase hydrolase  44.63 
 
 		 177 aa  152  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247569 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  43.78 
 
 		 186 aa  138  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2188  isochorismatase hydrolase  41.08 
 
 		 186 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288867  normal  0.048401 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  40.24 
 
 		 176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1652  isochorismatase hydrolase  42.41 
 
 		 173 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1721  isochorismatase hydrolase  43.65 
 
 		 185 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  40.25 
 
 		 359 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  39.63 
 
 		 359 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  40.88 
 
 		 174 aa  127  9.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  39.62 
 
 		 176 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  39.62 
 
 		 176 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  39.62 
 
 		 176 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1174  isochorismatase hydrolase  40.33 
 
 		 216 aa  124  6e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.910338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  38.61 
 
 		 176 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  39.87 
 
 		 176 aa  123  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3597  isochorismatase family protein  42.35 
 
 		 237 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3608  isochorismatase family protein  42.35 
 
 		 237 aa  121  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0508  isochorismatase family protein  42.35 
 
 		 183 aa  121  6e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.537066  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0966  isochorismatase family protein  42.35 
 
 		 183 aa  121  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.145103  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0670  isochorismatase family protein  42.35 
 
 		 183 aa  121  6e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1936  isochorismatase family protein  42.35 
 
 		 183 aa  121  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1153  isochorismatase hydrolase  41.24 
 
 		 181 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1224  isochorismatase hydrolase  41.24 
 
 		 181 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3583  isochorismatase family protein  42.35 
 
 		 183 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.46144  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2926  isochorismatase family protein  41.72 
 
 		 183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0487  isochorismatase hydrolase  41.04 
 
 		 183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.972949 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0547  amidase  39.22 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145331  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2589  isochorismatase hydrolase  40.46 
 
 		 183 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0515  isochorismatase hydrolase  40.46 
 
 		 183 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170108  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2701  isochorismatase  40.3 
 
 		 168 aa  117  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0445  isochorismatase hydrolase  39.88 
 
 		 183 aa  117  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.230544 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1431  isochorismatase hydrolase  36.91 
 
 		 164 aa  117  9e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0419  isochorismatase hydrolase  39.88 
 
 		 183 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.860585  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1154  isochorismatase hydrolase  39.55 
 
 		 181 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.399552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3602  isochorismatase hydrolase  39.31 
 
 		 183 aa  115  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.865119 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0251  isochorismatase family protein  37.91 
 
 		 176 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1927  isochorismatase hydrolase  37.71 
 
 		 172 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.110403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2716  isochorismatase hydrolase  38.15 
 
 		 183 aa  108  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2883  isochorismatase hydrolase  40.8 
 
 		 183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226746  normal  0.142757 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5030  isochorismatase hydrolase  38.46 
 
 		 186 aa  105  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0593911  decreased coverage  0.00786893 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4231  isochorismatase hydrolase  41.77 
 
 		 194 aa  103  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0539738  normal  0.306851 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3069  isochorismatase hydrolase  35 
 
 		 173 aa  99  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000901159  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1508  isochorismatase hydrolase  36.81 
 
 		 186 aa  98.6  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1656  isochorismatase  36.2 
 
 		 186 aa  98.2  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3689  isochorismatase family protein  36.2 
 
 		 186 aa  98.2  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1504  isochorismatase family protein  36.14 
 
 		 186 aa  97.8  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1476  isochorismatase  36.14 
 
 		 186 aa  97.8  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.731816  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1620  isochorismatase family protein  36.14 
 
 		 186 aa  97.8  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1761  isochorismatase family protein  35.58 
 
 		 186 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1711  isochorismatase family protein  35.58 
 
 		 186 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.08395  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1466  isochorismatase  35.54 
 
 		 186 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1688  isochorismatase family protein  35.54 
 
 		 186 aa  95.1  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4435  isochorismatase hydrolase  40.25 
 
 		 180 aa  95.1  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2534  isochorismatase hydrolase  40.13 
 
 		 174 aa  94.7  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.70955  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2838  isochorismatase hydrolase  39.74 
 
 		 174 aa  95.1  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102988  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0489  isochorismatase hydrolase  38.33 
 
 		 184 aa  95.1  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0367  amidase  34.64 
 
 		 166 aa  94.7  6e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4391  isochorismatase family protein  32.88 
 
 		 170 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4009  isochorismatase family protein  32.21 
 
 		 169 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5755  isochorismatase hydrolase  37.34 
 
 		 180 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.066854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3819  isochorismatase hydrolase  37.34 
 
 		 180 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4549  isochorismatase hydrolase  37.34 
 
 		 180 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.524921 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4278  isochorismatase family protein  32.21 
 
 		 169 aa  92  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4338  isochorismatase family protein  32.65 
 
 		 170 aa  92  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3999  isochorismatase family protein  32.21 
 
 		 169 aa  92  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4160  isochorismatase family protein  32.88 
 
 		 153 aa  91.7  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2817  isochorismatase hydrolase  35.03 
 
 		 188 aa  89.7  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369083  hitchhiker  0.00306149 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0076  isochorismatase hydrolase  34.46 
 
 		 184 aa  89  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1230  isochorismatase hydrolase  37.09 
 
 		 174 aa  88.2  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4372  isochorismatase family protein  32.19 
 
 		 170 aa  88.2  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0862  isochorismatase family protein  30.92 
 
 		 170 aa  87  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  33.92 
 
 		 181 aa  86.3  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0845  isochorismatase hydrolase  38.1 
 
 		 177 aa  85.5  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0614531 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2678  isochorismatase hydrolase  34.67 
 
 		 184 aa  84.7  6e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0812  isochorismatase hydrolase  34.44 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  34.36 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  34.36 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1978  isochorismatase hydrolase  36.31 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2347  amidase  34 
 
 		 164 aa  82  0.000000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00237714  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  33.74 
 
 		 231 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  33.33 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1660  isochorismatase family protein  30.52 
 
 		 173 aa  79.7  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000971288  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4942  isochorismatase hydrolase  32.02 
 
 		 186 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0334336 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  33.13 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  35.42 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  29.73 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  29.73 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  29.73 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  29.73 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  29.73 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  36.36 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  28.65 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  28.65 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  28.65 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>