More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1927 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1927  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 172 aa  356  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.110403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5755  isochorismatase hydrolase  57.31 
 
 		 180 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.066854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3819  isochorismatase hydrolase  57.31 
 
 		 180 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4549  isochorismatase hydrolase  57.31 
 
 		 180 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.524921 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4435  isochorismatase hydrolase  55.56 
 
 		 180 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4231  isochorismatase hydrolase  52.63 
 
 		 194 aa  179  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0539738  normal  0.306851 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1224  isochorismatase hydrolase  50.88 
 
 		 181 aa  177  8e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1153  isochorismatase hydrolase  50.88 
 
 		 181 aa  175  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1154  isochorismatase hydrolase  49.71 
 
 		 181 aa  174  7e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.399552  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  39.88 
 
 		 176 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  37.13 
 
 		 174 aa  127  8.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  38.32 
 
 		 176 aa  125  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  38.32 
 
 		 176 aa  125  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  38.32 
 
 		 176 aa  125  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  38.1 
 
 		 359 aa  124  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  37.72 
 
 		 359 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  36.53 
 
 		 176 aa  120  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2701  isochorismatase  39.88 
 
 		 168 aa  120  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  35.93 
 
 		 176 aa  120  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1174  isochorismatase hydrolase  38.65 
 
 		 216 aa  120  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.910338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0251  isochorismatase family protein  34.34 
 
 		 176 aa  119  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3069  isochorismatase hydrolase  37.65 
 
 		 173 aa  118  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000901159  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  42.07 
 
 		 186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2188  isochorismatase hydrolase  40.24 
 
 		 186 aa  112  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288867  normal  0.048401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5659  isochorismatase hydrolase  37.71 
 
 		 177 aa  110  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.616311  normal  0.236437 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1721  isochorismatase hydrolase  41.46 
 
 		 185 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2716  isochorismatase hydrolase  35.53 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1656  isochorismatase  35.19 
 
 		 186 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3689  isochorismatase family protein  35.19 
 
 		 186 aa  98.6  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1711  isochorismatase family protein  36.2 
 
 		 186 aa  97.8  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.08395  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2135  isochorismatase hydrolase  32.95 
 
 		 177 aa  97.4  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.990188 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3421  isochorismatase hydrolase  35.9 
 
 		 176 aa  97.4  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1761  isochorismatase family protein  34.57 
 
 		 186 aa  97.4  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1688  isochorismatase family protein  35.19 
 
 		 186 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3564  isochorismatase hydrolase  35.15 
 
 		 177 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247569 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1508  isochorismatase hydrolase  34.57 
 
 		 186 aa  97.1  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1403  isochorismatase hydrolase  36.54 
 
 		 175 aa  95.5  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1504  isochorismatase family protein  34.57 
 
 		 186 aa  95.1  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1476  isochorismatase  34.57 
 
 		 186 aa  95.1  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.731816  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1466  isochorismatase  34.57 
 
 		 186 aa  94.7  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1620  isochorismatase family protein  34.57 
 
 		 186 aa  95.1  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1652  isochorismatase hydrolase  31.41 
 
 		 173 aa  92  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1847  isochorismatase hydrolase  31.61 
 
 		 177 aa  91.7  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.614848  hitchhiker  0.00000933231 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0547  amidase  31.29 
 
 		 161 aa  90.1  1e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145331  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1718  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 		 196 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.854731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1431  isochorismatase hydrolase  28.38 
 
 		 164 aa  86.3  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0419  isochorismatase hydrolase  33.13 
 
 		 183 aa  85.1  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.860585  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3884  isochorismatase hydrolase  36.17 
 
 		 199 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  36.88 
 
 		 180 aa  85.1  5e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  35 
 
 		 199 aa  84.7  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2926  isochorismatase family protein  36.18 
 
 		 183 aa  84  9e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1849  isochorismatase hydrolase  32.14 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.605673 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2039  isochorismatase family protein  33.57 
 
 		 196 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0445  isochorismatase hydrolase  32.53 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.230544 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1846  isochorismatase hydrolase  36.42 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2589  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 183 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0515  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 183 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170108  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3597  isochorismatase family protein  34.87 
 
 		 237 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0508  isochorismatase family protein  34.87 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.537066  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3602  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 183 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.865119 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1936  isochorismatase family protein  34.87 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0966  isochorismatase family protein  34.87 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.145103  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0670  isochorismatase family protein  34.87 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  34.12 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0487  isochorismatase hydrolase  32.72 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.972949 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3583  isochorismatase family protein  34.87 
 
 		 183 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.46144  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  34.57 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3608  isochorismatase family protein  34.87 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  35.21 
 
 		 181 aa  79  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2883  isochorismatase hydrolase  33.13 
 
 		 183 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226746  normal  0.142757 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2817  isochorismatase hydrolase  33.55 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369083  hitchhiker  0.00306149 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  31.65 
 
 		 199 aa  77.4  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5030  isochorismatase hydrolase  31.72 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0593911  decreased coverage  0.00786893 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3999  isochorismatase family protein  23.64 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4278  isochorismatase family protein  23.64 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4009  isochorismatase family protein  23.64 
 
 		 169 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4420  isochorismatase hydrolase  33.54 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4313  isochorismatase hydrolase  33.6 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  30.94 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  31.68 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  31.68 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  31.68 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  31.68 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2678  isochorismatase hydrolase  30.38 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12730  hypothetical protein  30.64 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673629  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  29.71 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  29.71 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1287  isochorismatase hydrolase  28.89 
 
 		 184 aa  74.3  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3595  hypothetical protein  32.43 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  30.2 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0052  isochorismatase hydrolase  33.85 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4338  isochorismatase family protein  22.89 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  30.29 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4391  isochorismatase family protein  23.03 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4160  isochorismatase family protein  25.17 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1230  isochorismatase hydrolase  30.52 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2838  isochorismatase hydrolase  35.06 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102988  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1660  isochorismatase family protein  27.71 
 
 		 173 aa  72  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000971288  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  27.59 
 
 		 181 aa  72  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2534  isochorismatase hydrolase  35.06 
 
 		 174 aa  72  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.70955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>