More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2838 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2838  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 174 aa  362  1e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102988  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2534  isochorismatase hydrolase  90.12 
 
 		 174 aa  328  3e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.70955  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1230  isochorismatase hydrolase  63.16 
 
 		 174 aa  230  6e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2678  isochorismatase hydrolase  58.72 
 
 		 184 aa  218  5e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0845  isochorismatase hydrolase  55.09 
 
 		 177 aa  190  7e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0614531 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  38.32 
 
 		 186 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1403  isochorismatase hydrolase  39.05 
 
 		 175 aa  115  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2135  isochorismatase hydrolase  42 
 
 		 177 aa  112  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.990188 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1721  isochorismatase hydrolase  36.59 
 
 		 185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4942  isochorismatase hydrolase  34.91 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0334336 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2188  isochorismatase hydrolase  34.44 
 
 		 186 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288867  normal  0.048401 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3597  isochorismatase family protein  35.43 
 
 		 237 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5030  isochorismatase hydrolase  38.37 
 
 		 186 aa  105  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0593911  decreased coverage  0.00786893 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0076  isochorismatase hydrolase  36.09 
 
 		 184 aa  105  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2926  isochorismatase family protein  36.59 
 
 		 183 aa  104  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1936  isochorismatase family protein  34.86 
 
 		 183 aa  104  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0508  isochorismatase family protein  34.86 
 
 		 183 aa  104  8e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.537066  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0670  isochorismatase family protein  34.86 
 
 		 183 aa  104  8e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0966  isochorismatase family protein  34.86 
 
 		 183 aa  104  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.145103  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3608  isochorismatase family protein  34.86 
 
 		 237 aa  103  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  34.34 
 
 		 176 aa  103  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3583  isochorismatase family protein  34.86 
 
 		 183 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.46144  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3564  isochorismatase hydrolase  39.22 
 
 		 177 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247569 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0489  isochorismatase hydrolase  36.09 
 
 		 184 aa  102  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  33.76 
 
 		 174 aa  101  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1652  isochorismatase hydrolase  36.24 
 
 		 173 aa  100  7e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  32.57 
 
 		 359 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  33.12 
 
 		 176 aa  99.8  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2716  isochorismatase hydrolase  32.95 
 
 		 183 aa  99.8  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  33.12 
 
 		 176 aa  99.8  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  33.12 
 
 		 176 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2589  isochorismatase hydrolase  34.86 
 
 		 183 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1431  isochorismatase hydrolase  33.12 
 
 		 164 aa  99.8  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0515  isochorismatase hydrolase  34.86 
 
 		 183 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170108  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  32.48 
 
 		 176 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0487  isochorismatase hydrolase  34.29 
 
 		 183 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.972949 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2883  isochorismatase hydrolase  35.43 
 
 		 183 aa  98.2  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226746  normal  0.142757 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3602  isochorismatase hydrolase  34.29 
 
 		 183 aa  98.2  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.865119 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  34.39 
 
 		 176 aa  98.2  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1847  isochorismatase hydrolase  38.71 
 
 		 177 aa  98.2  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.614848  hitchhiker  0.00000933231 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  30.86 
 
 		 359 aa  97.8  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2817  isochorismatase hydrolase  35.67 
 
 		 188 aa  97.4  8e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369083  hitchhiker  0.00306149 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1978  isochorismatase hydrolase  33.73 
 
 		 185 aa  96.7  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0419  isochorismatase hydrolase  34.29 
 
 		 183 aa  96.7  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.860585  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0445  isochorismatase hydrolase  33.71 
 
 		 183 aa  95.1  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.230544 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5659  isochorismatase hydrolase  39.74 
 
 		 177 aa  95.1  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.616311  normal  0.236437 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0367  amidase  33.99 
 
 		 166 aa  93.6  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1174  isochorismatase hydrolase  30.9 
 
 		 216 aa  93.2  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.910338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3069  isochorismatase hydrolase  36.31 
 
 		 173 aa  92.4  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000901159  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2701  isochorismatase  37.61 
 
 		 168 aa  92  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0812  isochorismatase hydrolase  34.88 
 
 		 184 aa  89.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2347  amidase  34.87 
 
 		 164 aa  89.7  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00237714  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4009  isochorismatase family protein  30.52 
 
 		 169 aa  89  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4372  isochorismatase family protein  31.58 
 
 		 170 aa  88.6  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4278  isochorismatase family protein  30.52 
 
 		 169 aa  88.6  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3999  isochorismatase family protein  30.52 
 
 		 169 aa  88.6  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1466  isochorismatase  30.77 
 
 		 186 aa  87.8  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1656  isochorismatase  31.85 
 
 		 186 aa  87.4  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3689  isochorismatase family protein  31.21 
 
 		 186 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1761  isochorismatase family protein  29.49 
 
 		 186 aa  87  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1711  isochorismatase family protein  30.92 
 
 		 186 aa  85.5  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.08395  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4391  isochorismatase family protein  30.92 
 
 		 170 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1688  isochorismatase family protein  28.21 
 
 		 186 aa  85.5  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1504  isochorismatase family protein  30.13 
 
 		 186 aa  85.1  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1476  isochorismatase  30.13 
 
 		 186 aa  85.1  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.731816  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1620  isochorismatase family protein  30.13 
 
 		 186 aa  85.1  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1508  isochorismatase hydrolase  29.22 
 
 		 186 aa  85.1  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0547  amidase  30.07 
 
 		 161 aa  84.7  6e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0862  isochorismatase family protein  30.92 
 
 		 170 aa  84.3  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4338  isochorismatase family protein  29.61 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3421  isochorismatase hydrolase  33.92 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1224  isochorismatase hydrolase  34.29 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1153  isochorismatase hydrolase  34.29 
 
 		 181 aa  80.9  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4160  isochorismatase family protein  30.34 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1154  isochorismatase hydrolase  32.57 
 
 		 181 aa  77.4  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.399552  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1660  isochorismatase family protein  25.83 
 
 		 173 aa  73.9  0.0000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000971288  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2448  isochorismatase hydrolase  37.63 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00167941  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1927  isochorismatase hydrolase  35.06 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.110403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0251  isochorismatase family protein  27.16 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4231  isochorismatase hydrolase  33.54 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0539738  normal  0.306851 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  31.78 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  30.56 
 
 		 180 aa  64.7  0.0000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  35.44 
 
 		 223 aa  64.3  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  30.92 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  36.71 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  36.71 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  36.71 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  31.65 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4435  isochorismatase hydrolase  33.77 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  30.39 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  38.46 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  30.32 
 
 		 201 aa  62  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  35.56 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  34.44 
 
 		 222 aa  61.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4372  isochorismatase hydrolase  31.65 
 
 		 199 aa  60.8  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0306857  normal  0.52694 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  31.16 
 
 		 193 aa  60.8  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  34.62 
 
 		 247 aa  60.8  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2816  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.978539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  31.65 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  31.16 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>