More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0419 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_0419  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
183 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.860585  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0445  isochorismatase hydrolase  96.17 
 
 
183 aa  348  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.230544 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3602  isochorismatase hydrolase  91.8 
 
 
183 aa  330  6e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.865119 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0487  isochorismatase hydrolase  89.62 
 
 
183 aa  327  6e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.972949 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2589  isochorismatase hydrolase  89.07 
 
 
183 aa  326  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0515  isochorismatase hydrolase  89.07 
 
 
183 aa  326  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170108  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2883  isochorismatase hydrolase  86.34 
 
 
183 aa  299  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226746  normal  0.142757 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2926  isochorismatase family protein  78.14 
 
 
183 aa  284  4e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0670  isochorismatase family protein  76.5 
 
 
183 aa  281  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0966  isochorismatase family protein  76.5 
 
 
183 aa  281  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.145103  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0508  isochorismatase family protein  76.5 
 
 
183 aa  281  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.537066  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1936  isochorismatase family protein  76.5 
 
 
183 aa  281  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3583  isochorismatase family protein  75.96 
 
 
183 aa  280  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.46144  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3608  isochorismatase family protein  75.96 
 
 
237 aa  280  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3597  isochorismatase family protein  75.41 
 
 
237 aa  277  6e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2716  isochorismatase hydrolase  54.1 
 
 
183 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3421  isochorismatase hydrolase  42.29 
 
 
176 aa  132  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2135  isochorismatase hydrolase  43.67 
 
 
177 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.990188 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1652  isochorismatase hydrolase  41.29 
 
 
173 aa  125  4.0000000000000003e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1847  isochorismatase hydrolase  41.77 
 
 
177 aa  124  5e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.614848  hitchhiker  0.00000933231 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5659  isochorismatase hydrolase  39.88 
 
 
177 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.616311  normal  0.236437 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1403  isochorismatase hydrolase  36.78 
 
 
175 aa  117  7.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3069  isochorismatase hydrolase  36.02 
 
 
173 aa  115  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000901159  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2188  isochorismatase hydrolase  34.44 
 
 
186 aa  115  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288867  normal  0.048401 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  36.11 
 
 
186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  36.77 
 
 
359 aa  112  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1153  isochorismatase hydrolase  36.87 
 
 
181 aa  111  5e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1721  isochorismatase hydrolase  35.75 
 
 
185 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  36.13 
 
 
359 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  36.13 
 
 
174 aa  110  9e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  36.36 
 
 
176 aa  110  9e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  35.48 
 
 
176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  35.48 
 
 
176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  35.48 
 
 
176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  35.48 
 
 
176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1174  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.910338  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1224  isochorismatase hydrolase  36.87 
 
 
181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  35.71 
 
 
176 aa  109  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1154  isochorismatase hydrolase  35.75 
 
 
181 aa  108  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.399552  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0251  isochorismatase family protein  34.44 
 
 
176 aa  108  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3999  isochorismatase family protein  33.75 
 
 
169 aa  107  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4009  isochorismatase family protein  33.75 
 
 
169 aa  107  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4278  isochorismatase family protein  33.75 
 
 
169 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4338  isochorismatase family protein  31.68 
 
 
170 aa  105  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2534  isochorismatase hydrolase  36 
 
 
174 aa  105  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.70955  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2678  isochorismatase hydrolase  39.51 
 
 
184 aa  104  7e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4391  isochorismatase family protein  31.87 
 
 
170 aa  104  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0862  isochorismatase family protein  31.25 
 
 
170 aa  103  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3564  isochorismatase hydrolase  32.18 
 
 
177 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.247569 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4372  isochorismatase family protein  31.87 
 
 
170 aa  102  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2817  isochorismatase hydrolase  37.95 
 
 
188 aa  101  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369083  hitchhiker  0.00306149 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1230  isochorismatase hydrolase  39.02 
 
 
174 aa  101  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0367  amidase  32.93 
 
 
166 aa  101  6e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4160  isochorismatase family protein  34.69 
 
 
153 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4231  isochorismatase hydrolase  38.04 
 
 
194 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0539738  normal  0.306851 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2838  isochorismatase hydrolase  34.29 
 
 
174 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102988  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1431  isochorismatase hydrolase  27.88 
 
 
164 aa  97.4  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2701  isochorismatase  34 
 
 
168 aa  97.4  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4435  isochorismatase hydrolase  38.2 
 
 
180 aa  96.3  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0547  amidase  32.69 
 
 
161 aa  95.9  3e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145331  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1927  isochorismatase hydrolase  33.13 
 
 
172 aa  94.4  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.110403  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5030  isochorismatase hydrolase  35.2 
 
 
186 aa  92.8  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0593911  decreased coverage  0.00786893 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5755  isochorismatase hydrolase  35.39 
 
 
180 aa  87.8  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.066854  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3819  isochorismatase hydrolase  35.39 
 
 
180 aa  87.8  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4549  isochorismatase hydrolase  35.39 
 
 
180 aa  87.8  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.524921 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0076  isochorismatase hydrolase  32.34 
 
 
184 aa  86.7  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4942  isochorismatase hydrolase  32.93 
 
 
186 aa  84.7  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0334336 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0489  isochorismatase hydrolase  32.34 
 
 
184 aa  83.6  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0812  isochorismatase hydrolase  32.93 
 
 
184 aa  83.2  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1504  isochorismatase family protein  30.82 
 
 
186 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3689  isochorismatase family protein  30.72 
 
 
186 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1476  isochorismatase  30.82 
 
 
186 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.731816  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1620  isochorismatase family protein  30.82 
 
 
186 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  36.31 
 
 
187 aa  82.4  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1656  isochorismatase  30.12 
 
 
186 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1466  isochorismatase  30.19 
 
 
186 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1508  isochorismatase hydrolase  30.72 
 
 
186 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2347  amidase  27.38 
 
 
164 aa  80.9  0.000000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00237714  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1688  isochorismatase family protein  30.19 
 
 
186 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1761  isochorismatase family protein  28.93 
 
 
186 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2962  isochorismatase hydrolase  33.56 
 
 
172 aa  80.1  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.419394  normal  0.652284 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1711  isochorismatase family protein  29.52 
 
 
186 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.08395  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4590  isochorismatase family protein  31.69 
 
 
177 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2169  isochorismatase hydrolase  32.77 
 
 
211 aa  73.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0845  isochorismatase hydrolase  29.75 
 
 
177 aa  72  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0614531 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  28.89 
 
 
180 aa  71.6  0.000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  32.09 
 
 
182 aa  71.2  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1978  isochorismatase hydrolase  33.13 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  31.93 
 
 
228 aa  70.9  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  31.06 
 
 
181 aa  70.1  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  30.94 
 
 
184 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2126  isochorismatase hydrolase  30.82 
 
 
182 aa  68.9  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.996682  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  29.58 
 
 
196 aa  67.8  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  32.09 
 
 
185 aa  67.8  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1660  isochorismatase family protein  26.11 
 
 
173 aa  67.4  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000971288  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2640  isochorismatase hydrolase  34.55 
 
 
221 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  32.14 
 
 
231 aa  67  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5942  isochorismatase hydrolase  35.33 
 
 
248 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6128  isochorismatase hydrolase  32.4 
 
 
176 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12730  hypothetical protein  33.33 
 
 
193 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673629  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>