More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3564 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3564  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 177 aa  367  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247569 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5659  isochorismatase hydrolase  44.63 
 
 		 177 aa  152  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.616311  normal  0.236437 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1403  isochorismatase hydrolase  42.94 
 
 		 175 aa  137  7e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  37.93 
 
 		 174 aa  136  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  38.01 
 
 		 359 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  37.36 
 
 		 176 aa  131  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  37.36 
 
 		 176 aa  131  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  37.36 
 
 		 176 aa  131  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  38.01 
 
 		 176 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  39.35 
 
 		 359 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2135  isochorismatase hydrolase  44.16 
 
 		 177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.990188 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  38.92 
 
 		 186 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  36.21 
 
 		 176 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  37.36 
 
 		 176 aa  125  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2188  isochorismatase hydrolase  35.68 
 
 		 186 aa  120  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288867  normal  0.048401 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1224  isochorismatase hydrolase  41.32 
 
 		 181 aa  120  7e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1847  isochorismatase hydrolase  36.9 
 
 		 177 aa  120  8e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.614848  hitchhiker  0.00000933231 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3421  isochorismatase hydrolase  38.76 
 
 		 176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1153  isochorismatase hydrolase  41.32 
 
 		 181 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1154  isochorismatase hydrolase  40.72 
 
 		 181 aa  119  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.399552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2716  isochorismatase hydrolase  34.68 
 
 		 183 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1721  isochorismatase hydrolase  40.76 
 
 		 185 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1431  isochorismatase hydrolase  37.42 
 
 		 164 aa  114  7.999999999999999e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2701  isochorismatase  34.94 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1652  isochorismatase hydrolase  37.01 
 
 		 173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3069  isochorismatase hydrolase  39.22 
 
 		 173 aa  108  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000901159  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1978  isochorismatase hydrolase  39.62 
 
 		 185 aa  105  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3597  isochorismatase family protein  34.91 
 
 		 237 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2926  isochorismatase family protein  36.42 
 
 		 183 aa  104  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3608  isochorismatase family protein  34.91 
 
 		 237 aa  104  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0508  isochorismatase family protein  34.91 
 
 		 183 aa  103  9e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.537066  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0670  isochorismatase family protein  34.91 
 
 		 183 aa  103  9e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0966  isochorismatase family protein  34.91 
 
 		 183 aa  103  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.145103  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1936  isochorismatase family protein  34.91 
 
 		 183 aa  103  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3602  isochorismatase hydrolase  33.91 
 
 		 183 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.865119 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0367  amidase  31.21 
 
 		 166 aa  103  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2838  isochorismatase hydrolase  39.22 
 
 		 174 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102988  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0251  isochorismatase family protein  36.84 
 
 		 176 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3583  isochorismatase family protein  34.32 
 
 		 183 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.46144  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0487  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 183 aa  101  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.972949 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2589  isochorismatase hydrolase  32.76 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0515  isochorismatase hydrolase  32.76 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170108  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4372  isochorismatase family protein  31.61 
 
 		 170 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4391  isochorismatase family protein  32.26 
 
 		 170 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2534  isochorismatase hydrolase  37.25 
 
 		 174 aa  99.8  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.70955  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1230  isochorismatase hydrolase  37.25 
 
 		 174 aa  99.4  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4942  isochorismatase hydrolase  35.62 
 
 		 186 aa  99  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0334336 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4009  isochorismatase family protein  31.37 
 
 		 169 aa  97.4  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3999  isochorismatase family protein  31.37 
 
 		 169 aa  97.1  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4278  isochorismatase family protein  31.37 
 
 		 169 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5030  isochorismatase hydrolase  36.11 
 
 		 186 aa  96.7  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0593911  decreased coverage  0.00786893 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1927  isochorismatase hydrolase  35.15 
 
 		 172 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.110403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0862  isochorismatase family protein  31.01 
 
 		 170 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0419  isochorismatase hydrolase  32.18 
 
 		 183 aa  96.3  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.860585  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4338  isochorismatase family protein  30.77 
 
 		 170 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4160  isochorismatase family protein  32.19 
 
 		 153 aa  95.5  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4435  isochorismatase hydrolase  39.22 
 
 		 180 aa  95.5  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0445  isochorismatase hydrolase  31.03 
 
 		 183 aa  95.5  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.230544 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0547  amidase  32.34 
 
 		 161 aa  95.1  4e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145331  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2347  amidase  36.73 
 
 		 164 aa  94.7  6e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00237714  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4231  isochorismatase hydrolase  37.35 
 
 		 194 aa  93.6  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0539738  normal  0.306851 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2817  isochorismatase hydrolase  34.27 
 
 		 188 aa  92.8  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369083  hitchhiker  0.00306149 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5755  isochorismatase hydrolase  38.22 
 
 		 180 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.066854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1688  isochorismatase family protein  35.22 
 
 		 186 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3819  isochorismatase hydrolase  38.22 
 
 		 180 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2883  isochorismatase hydrolase  34.12 
 
 		 183 aa  93.2  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226746  normal  0.142757 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4549  isochorismatase hydrolase  38.22 
 
 		 180 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.524921 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3689  isochorismatase family protein  34.59 
 
 		 186 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1504  isochorismatase family protein  34.59 
 
 		 186 aa  92  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1476  isochorismatase  34.59 
 
 		 186 aa  92  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.731816  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1656  isochorismatase  33.96 
 
 		 186 aa  92  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1620  isochorismatase family protein  34.59 
 
 		 186 aa  92  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2678  isochorismatase hydrolase  35.93 
 
 		 184 aa  91.3  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1174  isochorismatase hydrolase  31.35 
 
 		 216 aa  90.1  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.910338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0076  isochorismatase hydrolase  34.27 
 
 		 184 aa  90.5  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1466  isochorismatase  33.33 
 
 		 186 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1761  isochorismatase family protein  32.7 
 
 		 186 aa  89  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1508  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 186 aa  89  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0489  isochorismatase hydrolase  35.62 
 
 		 184 aa  88.2  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1711  isochorismatase family protein  32.7 
 
 		 186 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.08395  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0812  isochorismatase hydrolase  35.67 
 
 		 184 aa  86.3  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  35.26 
 
 		 182 aa  85.9  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0845  isochorismatase hydrolase  35.14 
 
 		 177 aa  83.2  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0614531 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1660  isochorismatase family protein  26.79 
 
 		 173 aa  80.1  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000971288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8036  putative isochorismatase hydrolase  34.57 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2101  isochorismatase hydrolase  33.53 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.682407  normal  0.139759 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  32.56 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1332  hypothetical protein  35.06 
 
 		 209 aa  77.8  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1454  isochorismatase family protein  33.14 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.40872 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2126  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.996682  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15140  hypothetical protein  34.42 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.163225  hitchhiker  0.0000214815 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1280  isochorismatase family protein  32.56 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  31.21 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1382  isochorismatase family protein  32.56 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.030054  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0338  isochorismatase hydrolase  32.56 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3927  isochorismatase family protein  31.4 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2448  isochorismatase hydrolase  33.61 
 
 		 191 aa  74.7  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00167941  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  30.57 
 
 		 180 aa  74.7  0.0000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  35.71 
 
 		 211 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  35.71 
 
 		 211 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>