More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3421 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3421  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 176 aa  362  2e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1403  isochorismatase hydrolase  58.19 
 
 		 175 aa  194  7e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1847  isochorismatase hydrolase  55.88 
 
 		 177 aa  187  7e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.614848  hitchhiker  0.00000933231 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5659  isochorismatase hydrolase  50.28 
 
 		 177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.616311  normal  0.236437 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2135  isochorismatase hydrolase  48.82 
 
 		 177 aa  147  7e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.990188 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1652  isochorismatase hydrolase  44.59 
 
 		 173 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3583  isochorismatase family protein  43.18 
 
 		 183 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.46144  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2926  isochorismatase family protein  46.34 
 
 		 183 aa  128  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1936  isochorismatase family protein  43.18 
 
 		 183 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0966  isochorismatase family protein  43.18 
 
 		 183 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.145103  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0508  isochorismatase family protein  43.18 
 
 		 183 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.537066  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0670  isochorismatase family protein  43.18 
 
 		 183 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3608  isochorismatase family protein  43.18 
 
 		 237 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3602  isochorismatase hydrolase  41.14 
 
 		 183 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.865119 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0445  isochorismatase hydrolase  42.29 
 
 		 183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.230544 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3597  isochorismatase family protein  42.61 
 
 		 237 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2716  isochorismatase hydrolase  39.77 
 
 		 183 aa  124  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0419  isochorismatase hydrolase  42.29 
 
 		 183 aa  123  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.860585  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0487  isochorismatase hydrolase  40 
 
 		 183 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.972949 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2589  isochorismatase hydrolase  39.43 
 
 		 183 aa  121  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0515  isochorismatase hydrolase  39.43 
 
 		 183 aa  121  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170108  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3564  isochorismatase hydrolase  38.76 
 
 		 177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247569 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1153  isochorismatase hydrolase  39.66 
 
 		 181 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1224  isochorismatase hydrolase  39.66 
 
 		 181 aa  115  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  35.22 
 
 		 174 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  35.22 
 
 		 176 aa  112  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1154  isochorismatase hydrolase  37.99 
 
 		 181 aa  111  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.399552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2883  isochorismatase hydrolase  40.57 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226746  normal  0.142757 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  33.96 
 
 		 176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5030  isochorismatase hydrolase  39.89 
 
 		 186 aa  107  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0593911  decreased coverage  0.00786893 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  35.22 
 
 		 176 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  35.68 
 
 		 186 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  33.96 
 
 		 359 aa  105  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  33.96 
 
 		 359 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  32.7 
 
 		 176 aa  105  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  32.7 
 
 		 176 aa  105  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  32.7 
 
 		 176 aa  105  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1721  isochorismatase hydrolase  35.14 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1174  isochorismatase hydrolase  35.52 
 
 		 216 aa  102  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.910338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5755  isochorismatase hydrolase  38.36 
 
 		 180 aa  101  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.066854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3819  isochorismatase hydrolase  38.36 
 
 		 180 aa  101  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4549  isochorismatase hydrolase  38.36 
 
 		 180 aa  101  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.524921 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4435  isochorismatase hydrolase  38.99 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4231  isochorismatase hydrolase  37.74 
 
 		 194 aa  99.4  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0539738  normal  0.306851 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1927  isochorismatase hydrolase  35.9 
 
 		 172 aa  97.4  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.110403  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2188  isochorismatase hydrolase  33.51 
 
 		 186 aa  97.1  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288867  normal  0.048401 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2701  isochorismatase  31.79 
 
 		 168 aa  94.7  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1431  isochorismatase hydrolase  30.34 
 
 		 164 aa  92  4e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0251  isochorismatase family protein  29.94 
 
 		 176 aa  89  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0547  amidase  31.58 
 
 		 161 aa  87.8  6e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145331  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0812  isochorismatase hydrolase  35.03 
 
 		 184 aa  87  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1978  isochorismatase hydrolase  41.3 
 
 		 185 aa  85.9  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  35.58 
 
 		 187 aa  84.7  6e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2534  isochorismatase hydrolase  34.5 
 
 		 174 aa  84.7  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.70955  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3069  isochorismatase hydrolase  31.06 
 
 		 173 aa  83.6  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000901159  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  36.77 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2838  isochorismatase hydrolase  33.92 
 
 		 174 aa  82.4  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102988  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2817  isochorismatase hydrolase  35.96 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369083  hitchhiker  0.00306149 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1230  isochorismatase hydrolase  34.78 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0367  amidase  32.62 
 
 		 166 aa  78.6  0.00000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2347  amidase  33.56 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00237714  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 185 aa  74.7  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  31.25 
 
 		 180 aa  74.7  0.0000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4160  isochorismatase family protein  29.08 
 
 		 153 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3999  isochorismatase family protein  29.08 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4009  isochorismatase family protein  29.08 
 
 		 169 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4278  isochorismatase family protein  29.08 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0845  isochorismatase hydrolase  32.03 
 
 		 177 aa  73.2  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0614531 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4338  isochorismatase family protein  28.17 
 
 		 170 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4372  isochorismatase family protein  27.66 
 
 		 170 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4942  isochorismatase hydrolase  37.86 
 
 		 186 aa  72  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0334336 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0862  isochorismatase family protein  27.66 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4391  isochorismatase family protein  27.66 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1660  isochorismatase family protein  26.32 
 
 		 173 aa  71.2  0.000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000971288  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0489  isochorismatase hydrolase  32.02 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2026  isochorismatase hydrolase  31.61 
 
 		 218 aa  71.2  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2678  isochorismatase hydrolase  32.92 
 
 		 184 aa  70.9  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0076  isochorismatase hydrolase  34.53 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2021  isochorismatase hydrolase  32.65 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.128296  normal  0.0227718 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3689  isochorismatase family protein  28.75 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1761  isochorismatase family protein  28.75 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  30.41 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255569 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  31.51 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  31.51 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  31.51 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  31.51 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1508  isochorismatase hydrolase  28.75 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  31.51 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  31.51 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1656  isochorismatase  28.12 
 
 		 186 aa  67.8  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  32.64 
 
 		 187 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  31.16 
 
 		 182 aa  67  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1504  isochorismatase family protein  28.12 
 
 		 186 aa  67  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1476  isochorismatase  28.12 
 
 		 186 aa  67  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.731816  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1620  isochorismatase family protein  28.12 
 
 		 186 aa  67  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  30.18 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  31.51 
 
 		 188 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12730  hypothetical protein  29.71 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673629  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1466  isochorismatase  27.5 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  31.08 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>