More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1721 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1721  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 185 aa  365  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2188  isochorismatase hydrolase  67.21 
 
 		 186 aa  256  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288867  normal  0.048401 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  68.51 
 
 		 186 aa  250  8.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1174  isochorismatase hydrolase  52.78 
 
 		 216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.910338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5659  isochorismatase hydrolase  43.65 
 
 		 177 aa  131  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.616311  normal  0.236437 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  39.64 
 
 		 359 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  38.69 
 
 		 174 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  38.69 
 
 		 359 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  38.1 
 
 		 176 aa  123  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  38.1 
 
 		 176 aa  123  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  37.5 
 
 		 176 aa  123  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  38.1 
 
 		 176 aa  123  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1847  isochorismatase hydrolase  38.24 
 
 		 177 aa  123  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.614848  hitchhiker  0.00000933231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5030  isochorismatase hydrolase  40.96 
 
 		 186 aa  122  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0593911  decreased coverage  0.00786893 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  36.31 
 
 		 176 aa  121  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0251  isochorismatase family protein  37.5 
 
 		 176 aa  119  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3564  isochorismatase hydrolase  40.76 
 
 		 177 aa  117  9e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247569 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  35.12 
 
 		 176 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2926  isochorismatase family protein  40.99 
 
 		 183 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3597  isochorismatase family protein  41.51 
 
 		 237 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3608  isochorismatase family protein  41.51 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0670  isochorismatase family protein  41.51 
 
 		 183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0966  isochorismatase family protein  41.51 
 
 		 183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.145103  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0508  isochorismatase family protein  41.51 
 
 		 183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.537066  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1936  isochorismatase family protein  41.51 
 
 		 183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1403  isochorismatase hydrolase  37.84 
 
 		 175 aa  112  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2135  isochorismatase hydrolase  41.21 
 
 		 177 aa  111  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.990188 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2701  isochorismatase  40.15 
 
 		 168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3583  isochorismatase family protein  40.25 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.46144  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2534  isochorismatase hydrolase  36.59 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.70955  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3069  isochorismatase hydrolase  39.43 
 
 		 173 aa  108  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000901159  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2838  isochorismatase hydrolase  36.59 
 
 		 174 aa  108  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102988  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1927  isochorismatase hydrolase  41.46 
 
 		 172 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.110403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0419  isochorismatase hydrolase  35.75 
 
 		 183 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.860585  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0445  isochorismatase hydrolase  35.75 
 
 		 183 aa  105  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.230544 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1224  isochorismatase hydrolase  38.92 
 
 		 181 aa  104  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1652  isochorismatase hydrolase  36.75 
 
 		 173 aa  103  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1153  isochorismatase hydrolase  38.92 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1978  isochorismatase hydrolase  37.1 
 
 		 185 aa  102  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3602  isochorismatase hydrolase  38.82 
 
 		 183 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.865119 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3421  isochorismatase hydrolase  35.14 
 
 		 176 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4435  isochorismatase hydrolase  40.61 
 
 		 180 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2589  isochorismatase hydrolase  38.24 
 
 		 183 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0515  isochorismatase hydrolase  38.24 
 
 		 183 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170108  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0487  isochorismatase hydrolase  37.65 
 
 		 183 aa  101  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.972949 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1154  isochorismatase hydrolase  37.72 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.399552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4942  isochorismatase hydrolase  37.1 
 
 		 186 aa  99  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0334336 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2883  isochorismatase hydrolase  36.31 
 
 		 183 aa  97.4  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226746  normal  0.142757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3819  isochorismatase hydrolase  40.61 
 
 		 180 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4549  isochorismatase hydrolase  40.61 
 
 		 180 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.524921 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5755  isochorismatase hydrolase  40.61 
 
 		 180 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.066854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2817  isochorismatase hydrolase  37.22 
 
 		 188 aa  95.9  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369083  hitchhiker  0.00306149 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1656  isochorismatase  35.33 
 
 		 186 aa  93.6  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2716  isochorismatase hydrolase  34.27 
 
 		 183 aa  94  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1508  isochorismatase hydrolase  35.33 
 
 		 186 aa  93.6  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3689  isochorismatase family protein  36.9 
 
 		 186 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2678  isochorismatase hydrolase  43.56 
 
 		 184 aa  93.2  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1711  isochorismatase family protein  35.71 
 
 		 186 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.08395  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0076  isochorismatase hydrolase  34.08 
 
 		 184 aa  92.8  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0489  isochorismatase hydrolase  34.76 
 
 		 184 aa  92  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  40 
 
 		 182 aa  92  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1688  isochorismatase family protein  35.71 
 
 		 186 aa  91.7  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1466  isochorismatase  34.73 
 
 		 186 aa  91.3  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0812  isochorismatase hydrolase  36.61 
 
 		 184 aa  91.3  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1761  isochorismatase family protein  34.52 
 
 		 186 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1504  isochorismatase family protein  35.12 
 
 		 186 aa  90.5  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1476  isochorismatase  35.12 
 
 		 186 aa  90.5  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.731816  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1620  isochorismatase family protein  35.12 
 
 		 186 aa  90.5  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4231  isochorismatase hydrolase  38.79 
 
 		 194 aa  90.1  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0539738  normal  0.306851 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1230  isochorismatase hydrolase  31.71 
 
 		 174 aa  87.8  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0845  isochorismatase hydrolase  42.34 
 
 		 177 aa  87.4  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0614531 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  36.88 
 
 		 185 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  35.22 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  33.1 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  32.03 
 
 		 180 aa  78.2  0.00000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3931  isochorismatase hydrolase  32.64 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.835033  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3990  isochorismatase hydrolase  32.64 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3916  isochorismatase hydrolase  32.64 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664242  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2448  isochorismatase hydrolase  34.62 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00167941  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  33.79 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  33.79 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  33.79 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1431  isochorismatase hydrolase  27.21 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  35.48 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  35.48 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3884  isochorismatase hydrolase  36 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  35.48 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  37.67 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  34.72 
 
 		 342 aa  75.1  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0675  putative isochorismatase  32.89 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0547  amidase  28.14 
 
 		 161 aa  73.9  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145331  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  33.11 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  34.84 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  38.36 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2121  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.29808  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  35.56 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4313  isochorismatase hydrolase  32.09 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  32.41 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4420  isochorismatase hydrolase  40.22 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>