More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B1221 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  387  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  387  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  387  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  387  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  387  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  80.85 
 
 
188 aa  323  8.000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  80.85 
 
 
188 aa  320  8e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  80.85 
 
 
188 aa  320  8e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  80.85 
 
 
188 aa  320  8e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  80.85 
 
 
188 aa  320  8e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  80.85 
 
 
188 aa  320  8e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  80.85 
 
 
188 aa  320  8e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  80.32 
 
 
188 aa  318  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  79.79 
 
 
188 aa  316  1e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  66.32 
 
 
192 aa  261  4.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3277  hypothetical protein  56.68 
 
 
199 aa  225  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3599  hypothetical protein  57.75 
 
 
199 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1477  isochorismatase hydrolase  48.92 
 
 
198 aa  181  8.000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131824  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  47.34 
 
 
190 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  50.56 
 
 
190 aa  171  3.9999999999999995e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  44.92 
 
 
190 aa  169  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  46.41 
 
 
200 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  46.41 
 
 
195 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0542  isochorismatase hydrolase  47.89 
 
 
199 aa  158  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  46.11 
 
 
193 aa  156  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  45.86 
 
 
195 aa  156  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1769  isochorismatase hydrolase  45.7 
 
 
189 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0177  isochorismatase hydrolase  40.54 
 
 
185 aa  150  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0172  isochorismatase hydrolase  40.54 
 
 
185 aa  150  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0276  isochorismatase hydrolase  40.86 
 
 
204 aa  139  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5812  isochorismatase hydrolase  42.62 
 
 
187 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241433  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1016  amidase  39.69 
 
 
200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2021  isochorismatase hydrolase  41.53 
 
 
187 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.128296  normal  0.0227718 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2816  isochorismatase hydrolase  39.78 
 
 
187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.978539  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  40.76 
 
 
187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2306  isochorismatase hydrolase  39.15 
 
 
185 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.978441  normal  0.33888 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  40.76 
 
 
187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3796  isochorismatase hydrolase  40.76 
 
 
187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525922  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4572  isochorismatase hydrolase  40.76 
 
 
187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608605  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1272  isochorismatase hydrolase  40.76 
 
 
187 aa  125  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107065  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4001  isochorismatase hydrolase  39.56 
 
 
187 aa  124  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  39.56 
 
 
187 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4714  isochorismatase hydrolase  40.33 
 
 
191 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1678  isochorismatase hydrolase  37.78 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000210474  normal  0.105079 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1105  isochorismatase  80.56 
 
 
84 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1712  putative isochorismatase hydrolase  39.89 
 
 
187 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2950  isochorismatase hydrolase  37.7 
 
 
188 aa  117  7.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2403  isochorismatase hydrolase  41.44 
 
 
185 aa  111  6e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  40.69 
 
 
204 aa  93.6  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  34.86 
 
 
197 aa  93.2  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  31.98 
 
 
244 aa  90.1  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2152  isochorismatase hydrolase  32.54 
 
 
185 aa  87  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  34.25 
 
 
189 aa  87.4  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  27.5 
 
 
201 aa  87  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  33.16 
 
 
189 aa  85.5  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2026  isochorismatase hydrolase  33.9 
 
 
218 aa  82.4  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  31.75 
 
 
204 aa  82  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  29.59 
 
 
197 aa  81.3  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  30.33 
 
 
241 aa  80.1  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  29.84 
 
 
195 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  27.5 
 
 
224 aa  78.6  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 
213 aa  78.6  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2306  isochorismatase hydrolase  30.33 
 
 
246 aa  78.2  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5659  isochorismatase hydrolase  29.73 
 
 
177 aa  77.8  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.616311  normal  0.236437 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3307  isochorismatase hydrolase  35.71 
 
 
174 aa  77  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323098  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  31.91 
 
 
187 aa  77.4  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0430  isochorismatase hydrolase  29.14 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.650644  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  25.5 
 
 
213 aa  76.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 
213 aa  76.6  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  31.75 
 
 
189 aa  77  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  32.5 
 
 
231 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  32.5 
 
 
231 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1316  Isochorismatase  31.22 
 
 
291 aa  75.1  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0470712  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  34.18 
 
 
207 aa  74.7  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  31.87 
 
 
231 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  31.87 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1023  isochorismatase hydrolase  28.81 
 
 
191 aa  73.6  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.228804  normal  0.0648547 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  26.6 
 
 
217 aa  72.8  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 
192 aa  72.8  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  30.2 
 
 
289 aa  72.4  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  33.16 
 
 
212 aa  72.4  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  32.4 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  27.22 
 
 
180 aa  71.6  0.000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  28.25 
 
 
172 aa  71.6  0.000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1488  Isochorismatase  28.79 
 
 
291 aa  71.6  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1200  isochorismatase family protein  32.29 
 
 
191 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.474191  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1936  isochorismatase hydrolase  34.03 
 
 
207 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 
248 aa  70.5  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  27.96 
 
 
233 aa  70.5  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1242  isochorismatase hydrolase  39.47 
 
 
192 aa  70.9  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  28.57 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  25.93 
 
 
228 aa  70.5  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  30.18 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0804  isochorismatase hydrolase  42.11 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  28.17 
 
 
389 aa  69.3  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  28.1 
 
 
245 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  27.01 
 
 
228 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3597  isochorismatase family protein  34.25 
 
 
237 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0508  isochorismatase family protein  34.25 
 
 
183 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.537066  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2589  isochorismatase family protein  38.64 
 
 
190 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>