More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_2589 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0487  isochorismatase hydrolase  99.45 
 
 		 183 aa  370  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.972949 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2589  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 183 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0515  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 183 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170108  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3602  isochorismatase hydrolase  93.44 
 
 		 183 aa  338  2.9999999999999998e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.865119 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0445  isochorismatase hydrolase  89.62 
 
 		 183 aa  328  3e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.230544 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0419  isochorismatase hydrolase  89.07 
 
 		 183 aa  326  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.860585  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2883  isochorismatase hydrolase  89.07 
 
 		 183 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226746  normal  0.142757 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2926  isochorismatase family protein  78.69 
 
 		 183 aa  283  8e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0508  isochorismatase family protein  78.69 
 
 		 183 aa  282  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.537066  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1936  isochorismatase family protein  78.69 
 
 		 183 aa  282  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0670  isochorismatase family protein  78.69 
 
 		 183 aa  282  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0966  isochorismatase family protein  78.69 
 
 		 183 aa  282  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.145103  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3608  isochorismatase family protein  78.14 
 
 		 237 aa  282  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3583  isochorismatase family protein  78.14 
 
 		 183 aa  282  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.46144  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3597  isochorismatase family protein  77.6 
 
 		 237 aa  279  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2716  isochorismatase hydrolase  53.01 
 
 		 183 aa  199  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3421  isochorismatase hydrolase  39.43 
 
 		 176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2135  isochorismatase hydrolase  42.41 
 
 		 177 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.990188 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5659  isochorismatase hydrolase  40.46 
 
 		 177 aa  125  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.616311  normal  0.236437 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1847  isochorismatase hydrolase  40.49 
 
 		 177 aa  125  3e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.614848  hitchhiker  0.00000933231 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1652  isochorismatase hydrolase  38.36 
 
 		 173 aa  122  3e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1403  isochorismatase hydrolase  36.21 
 
 		 175 aa  117  9e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  34.29 
 
 		 359 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3069  isochorismatase hydrolase  36.65 
 
 		 173 aa  114  8.999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000901159  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  35.48 
 
 		 176 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  36.36 
 
 		 176 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  36.13 
 
 		 359 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  35.48 
 
 		 176 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  35.48 
 
 		 176 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  35.67 
 
 		 174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  35.56 
 
 		 186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  35.48 
 
 		 176 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2188  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 186 aa  112  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288867  normal  0.048401 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  35.71 
 
 		 176 aa  112  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1174  isochorismatase hydrolase  32.79 
 
 		 216 aa  109  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.910338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2534  isochorismatase hydrolase  35.43 
 
 		 174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.70955  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1230  isochorismatase hydrolase  40.85 
 
 		 174 aa  108  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4338  isochorismatase family protein  30.43 
 
 		 170 aa  107  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4009  isochorismatase family protein  31.25 
 
 		 169 aa  107  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1721  isochorismatase hydrolase  38.24 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3999  isochorismatase family protein  31.25 
 
 		 169 aa  106  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3564  isochorismatase hydrolase  32.76 
 
 		 177 aa  106  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247569 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4391  isochorismatase family protein  31.25 
 
 		 170 aa  106  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1153  isochorismatase hydrolase  34.08 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4278  isochorismatase family protein  31.25 
 
 		 169 aa  106  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1224  isochorismatase hydrolase  34.08 
 
 		 181 aa  105  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1154  isochorismatase hydrolase  34.08 
 
 		 181 aa  104  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.399552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0862  isochorismatase family protein  30 
 
 		 170 aa  104  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0251  isochorismatase family protein  31.79 
 
 		 176 aa  104  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2838  isochorismatase hydrolase  34.86 
 
 		 174 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102988  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2678  isochorismatase hydrolase  35.84 
 
 		 184 aa  103  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0367  amidase  31.71 
 
 		 166 aa  103  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4372  isochorismatase family protein  30.63 
 
 		 170 aa  102  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1431  isochorismatase hydrolase  29.09 
 
 		 164 aa  102  3e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2701  isochorismatase  34.67 
 
 		 168 aa  99.8  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4231  isochorismatase hydrolase  36.81 
 
 		 194 aa  99.8  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0539738  normal  0.306851 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2817  isochorismatase hydrolase  35.03 
 
 		 188 aa  97.8  8e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369083  hitchhiker  0.00306149 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4160  isochorismatase family protein  30.61 
 
 		 153 aa  97.1  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5030  isochorismatase hydrolase  34.64 
 
 		 186 aa  92  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0593911  decreased coverage  0.00786893 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4435  isochorismatase hydrolase  36.52 
 
 		 180 aa  91.3  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0547  amidase  32.26 
 
 		 161 aa  91.3  8e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145331  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1927  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 172 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.110403  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1466  isochorismatase  32.08 
 
 		 186 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3689  isochorismatase family protein  31.33 
 
 		 186 aa  85.1  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1504  isochorismatase family protein  31.45 
 
 		 186 aa  84.7  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1476  isochorismatase  31.45 
 
 		 186 aa  84.7  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.731816  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1620  isochorismatase family protein  31.45 
 
 		 186 aa  84.7  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1761  isochorismatase family protein  30.82 
 
 		 186 aa  84.3  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1656  isochorismatase  30.72 
 
 		 186 aa  84.3  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1711  isochorismatase family protein  31.33 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.08395  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5755  isochorismatase hydrolase  33.71 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.066854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1508  isochorismatase hydrolase  31.33 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4549  isochorismatase hydrolase  33.71 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.524921 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3819  isochorismatase hydrolase  33.71 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1688  isochorismatase family protein  30.82 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4942  isochorismatase hydrolase  32.93 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0334336 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0076  isochorismatase hydrolase  30.54 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2347  amidase  27.81 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00237714  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0812  isochorismatase hydrolase  31.14 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0489  isochorismatase hydrolase  29.94 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4590  isochorismatase family protein  31.69 
 
 		 177 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  33.12 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0845  isochorismatase hydrolase  34.21 
 
 		 177 aa  75.5  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0614531 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2962  isochorismatase hydrolase  32.19 
 
 		 172 aa  75.1  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.419394  normal  0.652284 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2169  isochorismatase hydrolase  31.64 
 
 		 211 aa  74.3  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  28.15 
 
 		 180 aa  71.6  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  30.32 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  33.09 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  32.28 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  29.29 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12730  hypothetical protein  35.56 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673629  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  28.39 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3277  hypothetical protein  32.05 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  29.79 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  29.79 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  28.39 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  29.79 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  29.79 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  33.56 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>