More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2817 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2817  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
188 aa  381  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369083  hitchhiker  0.00306149 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0076  isochorismatase hydrolase  68.13 
 
 
184 aa  258  3e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4942  isochorismatase hydrolase  60.66 
 
 
186 aa  233  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0334336 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1978  isochorismatase hydrolase  62.84 
 
 
185 aa  232  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0812  isochorismatase hydrolase  65.57 
 
 
184 aa  232  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0489  isochorismatase hydrolase  61.54 
 
 
184 aa  227  6e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2448  isochorismatase hydrolase  41.71 
 
 
191 aa  140  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00167941  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5030  isochorismatase hydrolase  41.48 
 
 
186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0593911  decreased coverage  0.00786893 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1936  isochorismatase family protein  38.07 
 
 
183 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0508  isochorismatase family protein  38.07 
 
 
183 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.537066  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0966  isochorismatase family protein  38.07 
 
 
183 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.145103  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3608  isochorismatase family protein  38.07 
 
 
237 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0670  isochorismatase family protein  38.07 
 
 
183 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3583  isochorismatase family protein  38.07 
 
 
183 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.46144  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2534  isochorismatase hydrolase  38.89 
 
 
174 aa  105  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.70955  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1230  isochorismatase hydrolase  39.77 
 
 
174 aa  105  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3597  isochorismatase family protein  37.5 
 
 
237 aa  104  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2926  isochorismatase family protein  37.95 
 
 
183 aa  103  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1174  isochorismatase hydrolase  33.69 
 
 
216 aa  100  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.910338  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2678  isochorismatase hydrolase  36.47 
 
 
184 aa  100  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1431  isochorismatase hydrolase  33.82 
 
 
164 aa  99.8  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0445  isochorismatase hydrolase  36.16 
 
 
183 aa  97.8  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.230544 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2838  isochorismatase hydrolase  35.67 
 
 
174 aa  97.4  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102988  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0419  isochorismatase hydrolase  37.95 
 
 
183 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.860585  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1721  isochorismatase hydrolase  37.22 
 
 
185 aa  95.9  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2347  amidase  36.36 
 
 
164 aa  95.5  5e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00237714  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0487  isochorismatase hydrolase  35.59 
 
 
183 aa  94.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.972949 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  37.27 
 
 
174 aa  94.4  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3602  isochorismatase hydrolase  37.35 
 
 
183 aa  94.4  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.865119 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  35.26 
 
 
359 aa  94  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2589  isochorismatase hydrolase  35.03 
 
 
183 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2188  isochorismatase hydrolase  35.91 
 
 
186 aa  92.8  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288867  normal  0.048401 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0515  isochorismatase hydrolase  35.03 
 
 
183 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170108  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3564  isochorismatase hydrolase  34.27 
 
 
177 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.247569 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2883  isochorismatase hydrolase  36.75 
 
 
183 aa  92.4  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226746  normal  0.142757 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  37.65 
 
 
186 aa  92.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2716  isochorismatase hydrolase  35.2 
 
 
183 aa  91.7  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  35.44 
 
 
176 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  35.44 
 
 
176 aa  90.1  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  35.44 
 
 
176 aa  90.1  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  35.26 
 
 
359 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4435  isochorismatase hydrolase  37.74 
 
 
180 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5659  isochorismatase hydrolase  35.03 
 
 
177 aa  89.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.616311  normal  0.236437 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4231  isochorismatase hydrolase  34.78 
 
 
194 aa  90.1  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0539738  normal  0.306851 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  34.81 
 
 
176 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0547  amidase  33.33 
 
 
161 aa  88.6  5e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145331  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2135  isochorismatase hydrolase  35.06 
 
 
177 aa  88.2  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.990188 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  37.59 
 
 
196 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  37.59 
 
 
196 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  37.59 
 
 
196 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5755  isochorismatase hydrolase  36.48 
 
 
180 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.066854  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3819  isochorismatase hydrolase  36.48 
 
 
180 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4549  isochorismatase hydrolase  36.48 
 
 
180 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.524921 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1153  isochorismatase hydrolase  35.22 
 
 
181 aa  84.7  8e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1403  isochorismatase hydrolase  36.16 
 
 
175 aa  84.3  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1652  isochorismatase hydrolase  34.18 
 
 
173 aa  84.3  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  37.59 
 
 
196 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0251  isochorismatase family protein  32.08 
 
 
176 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  36.36 
 
 
237 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  33.55 
 
 
176 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1847  isochorismatase hydrolase  38.41 
 
 
177 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.614848  hitchhiker  0.00000933231 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4391  isochorismatase family protein  32.58 
 
 
170 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  32.9 
 
 
176 aa  82  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4160  isochorismatase family protein  32.58 
 
 
153 aa  82  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3421  isochorismatase hydrolase  35.96 
 
 
176 aa  81.6  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3999  isochorismatase family protein  32.58 
 
 
169 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4009  isochorismatase family protein  32.58 
 
 
169 aa  82  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4278  isochorismatase family protein  32.58 
 
 
169 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1224  isochorismatase hydrolase  34.59 
 
 
181 aa  82  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4338  isochorismatase family protein  31.82 
 
 
170 aa  81.3  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4372  isochorismatase family protein  32.8 
 
 
170 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0862  isochorismatase family protein  31.1 
 
 
170 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1660  isochorismatase family protein  29.93 
 
 
173 aa  79.3  0.00000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000971288  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
193 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2540  isochorismatase hydrolase  35.71 
 
 
198 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.417405  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0367  amidase  31.82 
 
 
166 aa  78.6  0.00000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  29.78 
 
 
193 aa  77.8  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1927  isochorismatase hydrolase  33.55 
 
 
172 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.110403  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  35.26 
 
 
201 aa  76.3  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1154  isochorismatase hydrolase  32.08 
 
 
181 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.399552  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0845  isochorismatase hydrolase  33.93 
 
 
177 aa  75.5  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0614531 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2701  isochorismatase  31.91 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  36.96 
 
 
182 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  36.3 
 
 
185 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  29.21 
 
 
180 aa  73.2  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3689  isochorismatase family protein  28.85 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0675  putative isochorismatase  32.87 
 
 
200 aa  72.4  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  33.15 
 
 
207 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2126  isochorismatase hydrolase  35.66 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.996682  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0052  isochorismatase hydrolase  27.17 
 
 
201 aa  72.4  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1849  isochorismatase hydrolase  34.44 
 
 
196 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.605673 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0771  isochorismatase family protein  29.79 
 
 
316 aa  71.2  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2039  isochorismatase family protein  34.44 
 
 
196 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0044  isochorismatase hydrolase  26.63 
 
 
201 aa  71.2  0.000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8036  putative isochorismatase hydrolase  36.36 
 
 
201 aa  71.2  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4542  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  30.99 
 
 
181 aa  70.5  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0384  isochorismatase hydrolase  31.47 
 
 
313 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1656  isochorismatase  28.85 
 
 
186 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3990  isochorismatase hydrolase  33.56 
 
 
199 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>