More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2534 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2534  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 174 aa  363  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.70955  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2838  isochorismatase hydrolase  90.12 
 
 		 174 aa  328  3e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102988  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1230  isochorismatase hydrolase  64.33 
 
 		 174 aa  233  8e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2678  isochorismatase hydrolase  62.43 
 
 		 184 aa  226  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0845  isochorismatase hydrolase  55.76 
 
 		 177 aa  184  5e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0614531 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0966  isochorismatase family protein  37.14 
 
 		 183 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.145103  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0508  isochorismatase family protein  37.14 
 
 		 183 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.537066  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0670  isochorismatase family protein  37.14 
 
 		 183 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1936  isochorismatase family protein  37.14 
 
 		 183 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3608  isochorismatase family protein  37.14 
 
 		 237 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1403  isochorismatase hydrolase  38.31 
 
 		 175 aa  111  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3583  isochorismatase family protein  37.14 
 
 		 183 aa  111  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.46144  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2926  isochorismatase family protein  37.14 
 
 		 183 aa  111  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1721  isochorismatase hydrolase  36.59 
 
 		 185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3597  isochorismatase family protein  36.57 
 
 		 237 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5030  isochorismatase hydrolase  40.12 
 
 		 186 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0593911  decreased coverage  0.00786893 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2716  isochorismatase hydrolase  35.84 
 
 		 183 aa  108  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2135  isochorismatase hydrolase  41.18 
 
 		 177 aa  108  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.990188 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0076  isochorismatase hydrolase  36.69 
 
 		 184 aa  108  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  35.93 
 
 		 186 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2589  isochorismatase hydrolase  35.43 
 
 		 183 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0515  isochorismatase hydrolase  35.43 
 
 		 183 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170108  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2817  isochorismatase hydrolase  38.89 
 
 		 188 aa  105  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369083  hitchhiker  0.00306149 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0487  isochorismatase hydrolase  34.86 
 
 		 183 aa  104  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.972949 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3602  isochorismatase hydrolase  34.86 
 
 		 183 aa  103  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.865119 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2883  isochorismatase hydrolase  37.14 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226746  normal  0.142757 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0489  isochorismatase hydrolase  38.61 
 
 		 184 aa  103  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0419  isochorismatase hydrolase  36 
 
 		 183 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.860585  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4942  isochorismatase hydrolase  34.32 
 
 		 186 aa  102  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0334336 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0445  isochorismatase hydrolase  35.43 
 
 		 183 aa  101  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.230544 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1431  isochorismatase hydrolase  34.42 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2188  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 186 aa  99.4  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288867  normal  0.048401 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3564  isochorismatase hydrolase  37.25 
 
 		 177 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247569 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  32.7 
 
 		 359 aa  98.2  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  32.7 
 
 		 176 aa  98.2  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1652  isochorismatase hydrolase  35.57 
 
 		 173 aa  98.2  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  32.08 
 
 		 174 aa  96.7  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  32.08 
 
 		 176 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1978  isochorismatase hydrolase  32.54 
 
 		 185 aa  95.5  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  31.45 
 
 		 176 aa  95.1  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  31.45 
 
 		 176 aa  95.1  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5659  isochorismatase hydrolase  40.13 
 
 		 177 aa  94.7  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.616311  normal  0.236437 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  31.45 
 
 		 176 aa  95.1  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  33.96 
 
 		 176 aa  95.1  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  30.51 
 
 		 359 aa  94.7  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1847  isochorismatase hydrolase  37.42 
 
 		 177 aa  94  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.614848  hitchhiker  0.00000933231 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0812  isochorismatase hydrolase  36.2 
 
 		 184 aa  94  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1174  isochorismatase hydrolase  30.9 
 
 		 216 aa  94  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.910338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2347  amidase  36.18 
 
 		 164 aa  90.5  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00237714  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2701  isochorismatase  36.75 
 
 		 168 aa  89  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3999  isochorismatase family protein  32.28 
 
 		 169 aa  89  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4009  isochorismatase family protein  32.28 
 
 		 169 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4278  isochorismatase family protein  32.28 
 
 		 169 aa  89  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3069  isochorismatase hydrolase  35.44 
 
 		 173 aa  87.4  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000901159  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0367  amidase  33.33 
 
 		 166 aa  87.4  9e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4372  isochorismatase family protein  31.41 
 
 		 170 aa  87  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3421  isochorismatase hydrolase  34.5 
 
 		 176 aa  84.7  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1761  isochorismatase family protein  34.65 
 
 		 186 aa  84.3  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1466  isochorismatase  35.64 
 
 		 186 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4391  isochorismatase family protein  30.26 
 
 		 170 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1504  isochorismatase family protein  34.65 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1476  isochorismatase  34.65 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.731816  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0862  isochorismatase family protein  30.26 
 
 		 170 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1656  isochorismatase  30.43 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1620  isochorismatase family protein  34.65 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1688  isochorismatase family protein  34.65 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4338  isochorismatase family protein  30.26 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1508  isochorismatase hydrolase  34.65 
 
 		 186 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3689  isochorismatase family protein  34.69 
 
 		 186 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1711  isochorismatase family protein  34.41 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.08395  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4160  isochorismatase family protein  32.21 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0547  amidase  29.41 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145331  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1153  isochorismatase hydrolase  35.29 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1224  isochorismatase hydrolase  35.29 
 
 		 181 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2448  isochorismatase hydrolase  38.71 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00167941  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1154  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.399552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1927  isochorismatase hydrolase  35.06 
 
 		 172 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.110403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4231  isochorismatase hydrolase  33.13 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0539738  normal  0.306851 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  31.61 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  30.32 
 
 		 201 aa  67.4  0.00000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  32.89 
 
 		 181 aa  67  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1660  isochorismatase family protein  25.17 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000971288  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  30.15 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4435  isochorismatase hydrolase  33.97 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2403  isochorismatase hydrolase  32.95 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2058  isochorismatase hydrolase  35.78 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  31.17 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0251  isochorismatase family protein  34.62 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  29.58 
 
 		 180 aa  61.2  0.000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4372  isochorismatase hydrolase  32.37 
 
 		 199 aa  61.2  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0306857  normal  0.52694 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  28.87 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1272  isochorismatase hydrolase  31.07 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  32.26 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  28.68 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  32.95 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5755  isochorismatase hydrolase  29.87 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.066854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8036  putative isochorismatase hydrolase  32.96 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3819  isochorismatase hydrolase  29.87 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4549  isochorismatase hydrolase  29.87 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.524921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2816  isochorismatase hydrolase  34.03 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.978539  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>