More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2403 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2403  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 185 aa  363  1e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  66.3 
 
 		 187 aa  247  8e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1272  isochorismatase hydrolase  66.3 
 
 		 187 aa  246  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2021  isochorismatase hydrolase  66.3 
 
 		 187 aa  246  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.128296  normal  0.0227718 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4001  isochorismatase hydrolase  65.22 
 
 		 187 aa  245  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  65.22 
 
 		 187 aa  244  4e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4714  isochorismatase hydrolase  66.67 
 
 		 191 aa  235  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5812  isochorismatase hydrolase  63.59 
 
 		 187 aa  235  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241433  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  63.59 
 
 		 187 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3796  isochorismatase hydrolase  63.59 
 
 		 187 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525922  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4572  isochorismatase hydrolase  63.59 
 
 		 187 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2950  isochorismatase hydrolase  62.37 
 
 		 188 aa  231  5e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1712  putative isochorismatase hydrolase  58.7 
 
 		 187 aa  227  9e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2816  isochorismatase hydrolase  60.99 
 
 		 187 aa  224  4e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.978539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2306  isochorismatase hydrolase  55.74 
 
 		 185 aa  197  7e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.978441  normal  0.33888 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  52.38 
 
 		 193 aa  179  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0276  isochorismatase hydrolase  50.25 
 
 		 204 aa  176  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  43.98 
 
 		 195 aa  141  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  42.25 
 
 		 190 aa  141  7e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  43.98 
 
 		 200 aa  140  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  43.68 
 
 		 195 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  43.18 
 
 		 190 aa  136  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  41.44 
 
 		 188 aa  125  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3277  hypothetical protein  41.97 
 
 		 199 aa  125  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  40.56 
 
 		 188 aa  124  7e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  40.56 
 
 		 188 aa  124  7e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  40.56 
 
 		 188 aa  124  7e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  40.56 
 
 		 188 aa  124  7e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  40.56 
 
 		 188 aa  124  7e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  40.56 
 
 		 188 aa  124  7e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3599  hypothetical protein  41.45 
 
 		 199 aa  123  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  40 
 
 		 188 aa  122  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  40 
 
 		 188 aa  121  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  41.11 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  41.11 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  45.51 
 
 		 190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  41.11 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  41.11 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  41.11 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  40.78 
 
 		 192 aa  118  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1477  isochorismatase hydrolase  40 
 
 		 198 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0542  isochorismatase hydrolase  42.39 
 
 		 199 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1769  isochorismatase hydrolase  42.37 
 
 		 189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1016  amidase  36.02 
 
 		 200 aa  104  9e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0177  isochorismatase hydrolase  30.56 
 
 		 185 aa  96.7  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0172  isochorismatase hydrolase  30.56 
 
 		 185 aa  96.7  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1678  isochorismatase hydrolase  38.64 
 
 		 166 aa  92  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000210474  normal  0.105079 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20850  isochorismate hydrolase  33.51 
 
 		 221 aa  87.8  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00852514 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2152  isochorismatase hydrolase  30.17 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2383  isochorismatase  30.39 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.231944  normal  0.805423 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3684  isochorismatase hydrolase  32.24 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1936  isochorismatase hydrolase  33.7 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  35.29 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3069  isochorismatase hydrolase  34.83 
 
 		 173 aa  72  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000901159  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3564  isochorismatase hydrolase  31.47 
 
 		 177 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247569 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  33.91 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1023  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.228804  normal  0.0648547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  32.95 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0815  isochorismatase hydrolase  28.18 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0792  isochorismatase hydrolase  28.18 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  30.98 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2178  isochorismatase  28.74 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00513339  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2207  isochorismatase  27.57 
 
 		 295 aa  67  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2371  isochorismatase  27.57 
 
 		 295 aa  67  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0032  isochorismatase hydrolase  26.2 
 
 		 184 aa  67  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2401  isochorismatase  27.57 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168949  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2336  isochorismatase  27.57 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.134654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2989  isochorismatase  27.57 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2471  isochorismatase  27.57 
 
 		 295 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000432607  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2146  isochorismatase  27.57 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.315852  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2389  isochorismatase  27.57 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2130  isochorismatase  27.57 
 
 		 295 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  31.43 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  32.69 
 
 		 185 aa  64.7  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0430  isochorismatase hydrolase  28.32 
 
 		 184 aa  64.7  0.0000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.650644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1721  isochorismatase hydrolase  35.33 
 
 		 185 aa  64.7  0.0000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  29.95 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  29.44 
 
 		 244 aa  64.3  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  32.03 
 
 		 176 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 172 aa  63.9  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  28.36 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4467  Isochorismatase  31.58 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.813691 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  37.96 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  31.01 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2534  isochorismatase hydrolase  32.95 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.70955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  31.37 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1200  isochorismatase family protein  36.94 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.474191  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2306  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  32.43 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1316  Isochorismatase  24.73 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0470712  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  33.56 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  32.41 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4275  isochorismatase hydrolase  30.35 
 
 		 227 aa  62  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.41702  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  30.86 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  27.59 
 
 		 213 aa  61.2  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0300  vibriobactin-specific isochorismatase  25.86 
 
 		 293 aa  61.2  0.000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  30 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  35.16 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>