More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4467 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4467  Isochorismatase  100 
 
 		 201 aa  404  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.813691 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2146  isochorismatase  48.08 
 
 		 295 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.315852  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2389  isochorismatase  48.08 
 
 		 295 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2130  isochorismatase  48.08 
 
 		 295 aa  197  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2178  isochorismatase  48.08 
 
 		 297 aa  197  9e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00513339  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2207  isochorismatase  48.08 
 
 		 295 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2371  isochorismatase  48.08 
 
 		 295 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2401  isochorismatase  48.08 
 
 		 297 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168949  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2336  isochorismatase  47.6 
 
 		 297 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.134654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2989  isochorismatase  47.6 
 
 		 297 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2471  isochorismatase  47.6 
 
 		 295 aa  194  7e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000432607  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1757  isochorismatase  43.69 
 
 		 297 aa  184  8e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3419  isochorismatase  43.4 
 
 		 284 aa  184  9e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000498734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2020  Isochorismatase  47.89 
 
 		 327 aa  182  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.745871 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1027  Isochorismatase  49.76 
 
 		 212 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.553092  decreased coverage  0.000215707 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3619  isochorismatase  50.25 
 
 		 251 aa  181  6e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.501352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1804  isochorismatase  46.6 
 
 		 285 aa  181  7e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3382  phenazine biosynthesis protein PhzD  47.83 
 
 		 207 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.963565  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0886  phenazine biosynthesis protein PhzD  47.83 
 
 		 207 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1488  Isochorismatase  45.54 
 
 		 291 aa  177  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3737  Isochorismatase  41.86 
 
 		 287 aa  175  4e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248742  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5030  Isochorismatase  48 
 
 		 207 aa  174  9e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54727 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1316  Isochorismatase  45.24 
 
 		 291 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0470712  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3075  Isochorismatase  44.85 
 
 		 283 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01400  hypothetical protein  43.87 
 
 		 296 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09450  phenazine biosynthesis protein PhzD  46.38 
 
 		 207 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39925  phenazine biosynthesis protein PhzD  45.89 
 
 		 207 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1870  isochorismatase  45.19 
 
 		 221 aa  168  4e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.408465  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1127  isochorismatase  43 
 
 		 284 aa  168  4e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.78155 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2383  isochorismatase  45.41 
 
 		 218 aa  167  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.231944  normal  0.805423 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21200  Isochorismatase (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  45.59 
 
 		 278 aa  167  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0178393  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3684  isochorismatase hydrolase  47.06 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1623  isochorismatase  41.15 
 
 		 294 aa  165  5e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2274  Isochorismatase  45.37 
 
 		 211 aa  162  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.412367  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0464  Isochorismatase  41.67 
 
 		 291 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.889964  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1633  isochorismatase  40.85 
 
 		 299 aa  161  6e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.741759  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0014  isochorismatase  41.35 
 
 		 290 aa  160  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1569  isochorismatase  42.51 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0910481  normal  0.0511098 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0011  isochorismatase  41.35 
 
 		 290 aa  160  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20850  isochorismate hydrolase  43.33 
 
 		 221 aa  157  8e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00852514 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1688  isochorismatase  46.12 
 
 		 291 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0755  isochorismatase  40.58 
 
 		 285 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00562  isochorismatase  39.13 
 
 		 285 aa  155  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3031  Isochorismatase  39.13 
 
 		 285 aa  155  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0773694  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3049  isochorismatase  39.13 
 
 		 285 aa  155  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0709  isochorismatase  40.58 
 
 		 285 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0650  isochorismatase  40.58 
 
 		 285 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.394941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0646  isochorismatase  39.13 
 
 		 285 aa  155  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0636  isochorismatase  40.58 
 
 		 285 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.529222  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0693  isochorismatase  40.58 
 
 		 285 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0544005 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00551  hypothetical protein  39.13 
 
 		 285 aa  155  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0680  isochorismatase  39.13 
 
 		 285 aa  155  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.180051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0615  isochorismatase  39.13 
 
 		 285 aa  155  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0615  isochorismatase  39.13 
 
 		 285 aa  155  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0639  Isochorismatase  39.9 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.316933  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0300  vibriobactin-specific isochorismatase  40 
 
 		 293 aa  152  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2425  Isochorismatase  43.37 
 
 		 220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0497  isochorismatase  38.16 
 
 		 285 aa  150  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3398  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.15 
 
 		 319 aa  145  5e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.877818 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4517  Isochorismatase  41.58 
 
 		 270 aa  144  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0854909  normal  0.417709 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0113  Isochorismatase  37.77 
 
 		 260 aa  133  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.662986  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02097  hypothetical protein  33.69 
 
 		 264 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  30.22 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  28 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  29.86 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3796  isochorismatase hydrolase  32.31 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525922  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4572  isochorismatase hydrolase  32.31 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  32.31 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  37.78 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  37.78 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  31.62 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  32.65 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2113  isochorismatase hydrolase  29.38 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0439307  normal  0.165313 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2306  isochorismatase hydrolase  31.34 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.978441  normal  0.33888 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2403  isochorismatase hydrolase  29.55 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  28.81 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  34.21 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1614  isochorismatase hydrolase  31.3 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  27.6 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  32.46 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  29.19 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  31.31 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1712  putative isochorismatase hydrolase  30.6 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  37.78 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  33.64 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  28.7 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  33.82 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7953  isochorismatase hydrolase  37.25 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315447  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  23.63 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  32.22 
 
 		 228 aa  54.7  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  33.04 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3668  isochorismatase hydrolase  29.73 
 
 		 243 aa  53.9  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.856402 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  25.41 
 
 		 227 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0815  isochorismatase hydrolase  26.86 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0792  isochorismatase hydrolase  26.86 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3421  isochorismatase hydrolase  29.19 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5339  isochorismatase hydrolase  29.19 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.472338  normal  0.0895037 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4947  isochorismatase hydrolase  29.19 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000317708 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  29.71 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>