More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C0709 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C0709  isochorismatase  100 
 
 
285 aa  591  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0693  isochorismatase  100 
 
 
285 aa  591  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0544005 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0650  isochorismatase  100 
 
 
285 aa  591  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.394941  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0636  isochorismatase  99.65 
 
 
285 aa  588  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.529222  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0755  isochorismatase  99.65 
 
 
285 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00562  isochorismatase  88.42 
 
 
285 aa  534  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3031  Isochorismatase  88.42 
 
 
285 aa  533  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0773694  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0615  isochorismatase  88.77 
 
 
285 aa  534  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0680  isochorismatase  88.42 
 
 
285 aa  533  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.180051  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00551  hypothetical protein  88.42 
 
 
285 aa  534  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3049  isochorismatase  88.42 
 
 
285 aa  533  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0646  isochorismatase  88.42 
 
 
285 aa  533  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0615  isochorismatase  88.42 
 
 
285 aa  533  1e-150  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0497  isochorismatase  87.72 
 
 
285 aa  527  1e-149  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1127  isochorismatase  85.61 
 
 
284 aa  521  1e-147  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.78155 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3419  isochorismatase  72.89 
 
 
284 aa  436  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000498734  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3075  Isochorismatase  62.77 
 
 
283 aa  384  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1316  Isochorismatase  66.32 
 
 
291 aa  367  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0470712  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3737  Isochorismatase  61.4 
 
 
287 aa  364  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248742  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0464  Isochorismatase  64.56 
 
 
291 aa  364  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.889964  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1488  Isochorismatase  62.46 
 
 
291 aa  352  5e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1623  isochorismatase  51.55 
 
 
294 aa  310  2e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0011  isochorismatase  53.36 
 
 
290 aa  294  9e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0014  isochorismatase  52.65 
 
 
290 aa  288  5.0000000000000004e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01400  hypothetical protein  48.14 
 
 
296 aa  288  7e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1688  isochorismatase  50.68 
 
 
291 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1633  isochorismatase  50 
 
 
299 aa  281  7.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.741759  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1804  isochorismatase  48.56 
 
 
285 aa  273  3e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2401  isochorismatase  46.74 
 
 
297 aa  267  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168949  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2207  isochorismatase  47.1 
 
 
295 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2371  isochorismatase  47.1 
 
 
295 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2336  isochorismatase  46.39 
 
 
297 aa  266  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.134654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2989  isochorismatase  46.39 
 
 
297 aa  266  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2178  isochorismatase  46.39 
 
 
297 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00513339  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1757  isochorismatase  44.22 
 
 
297 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21200  Isochorismatase (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  48.2 
 
 
278 aa  264  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0178393  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2471  isochorismatase  46.76 
 
 
295 aa  263  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000432607  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2389  isochorismatase  46.08 
 
 
295 aa  261  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2130  isochorismatase  46.42 
 
 
295 aa  261  8e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2146  isochorismatase  46.08 
 
 
295 aa  261  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.315852  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2020  Isochorismatase  46.51 
 
 
327 aa  256  3e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.745871 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0300  vibriobactin-specific isochorismatase  44.76 
 
 
293 aa  247  1e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3398  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.43 
 
 
319 aa  240  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.877818 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4517  Isochorismatase  46.43 
 
 
270 aa  239  5e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0854909  normal  0.417709 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3619  isochorismatase  50.72 
 
 
251 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.501352  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20850  isochorismate hydrolase  50.47 
 
 
221 aa  219  5e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00852514 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1027  Isochorismatase  48.31 
 
 
212 aa  218  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.553092  decreased coverage  0.000215707 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1569  isochorismatase  49.03 
 
 
207 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0910481  normal  0.0511098 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3684  isochorismatase hydrolase  52.43 
 
 
207 aa  211  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2274  Isochorismatase  48.56 
 
 
211 aa  207  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.412367  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09450  phenazine biosynthesis protein PhzD  47.6 
 
 
207 aa  205  8e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39925  phenazine biosynthesis protein PhzD  47.12 
 
 
207 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3382  phenazine biosynthesis protein PhzD  47.12 
 
 
207 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.963565  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0886  phenazine biosynthesis protein PhzD  47.12 
 
 
207 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02097  hypothetical protein  40.55 
 
 
264 aa  196  3e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2425  Isochorismatase  48.66 
 
 
220 aa  195  6e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0639  Isochorismatase  48.08 
 
 
216 aa  195  8.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.316933  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5030  Isochorismatase  45.15 
 
 
207 aa  193  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.54727 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2383  isochorismatase  46.38 
 
 
218 aa  192  7e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.231944  normal  0.805423 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1870  isochorismatase  44.44 
 
 
221 aa  185  8e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.408465  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4467  Isochorismatase  40.58 
 
 
201 aa  155  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.813691 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0113  Isochorismatase  36.41 
 
 
260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.662986  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  30.17 
 
 
180 aa  84.3  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  29.14 
 
 
188 aa  76.3  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  30.56 
 
 
192 aa  75.1  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  31.11 
 
 
190 aa  74.7  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  31.87 
 
 
201 aa  73.9  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  28.42 
 
 
201 aa  74.3  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0815  isochorismatase hydrolase  31.55 
 
 
194 aa  73.6  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0792  isochorismatase hydrolase  31.55 
 
 
194 aa  73.6  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  31.65 
 
 
201 aa  72  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  26.09 
 
 
201 aa  71.6  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  29.28 
 
 
193 aa  70.5  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 
209 aa  69.7  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0606  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 
200 aa  69.3  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  25.7 
 
 
190 aa  68.9  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  27.32 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  27.32 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0016  isochorismatase hydrolase  27.04 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  27.57 
 
 
190 aa  65.5  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0032  isochorismatase hydrolase  30 
 
 
184 aa  64.3  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  25.41 
 
 
192 aa  63.9  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0430  isochorismatase hydrolase  26.63 
 
 
184 aa  63.9  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.650644  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  26.97 
 
 
203 aa  63.5  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  25.15 
 
 
227 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  26.99 
 
 
212 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  28.82 
 
 
204 aa  63.2  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  31.74 
 
 
237 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  26.23 
 
 
224 aa  60.8  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  26.55 
 
 
213 aa  60.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5297  isochorismatase family protein  27.27 
 
 
179 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000537015  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0023  isochorismatase family protein  25.38 
 
 
179 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000151833  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  25.77 
 
 
179 aa  59.7  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  26.29 
 
 
179 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.382444  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0016  isochorismatase hydrolase  26.32 
 
 
179 aa  59.7  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.392436  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  23.98 
 
 
188 aa  60.1  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0021  isochorismatase family protein  25.77 
 
 
179 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  27.92 
 
 
190 aa  59.7  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0019  isochorismatase family protein  25.77 
 
 
179 aa  59.7  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0016  isochorismatase family protein  25.77 
 
 
179 aa  59.7  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>