More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2383 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2383  isochorismatase  100 
 
 		 218 aa  448  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.231944  normal  0.805423 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2274  Isochorismatase  67.14 
 
 		 211 aa  285  4e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.412367  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1316  Isochorismatase  52.13 
 
 		 291 aa  218  3.9999999999999997e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0470712  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1488  Isochorismatase  50.24 
 
 		 291 aa  212  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3419  isochorismatase  48.11 
 
 		 284 aa  210  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000498734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3737  Isochorismatase  46.92 
 
 		 287 aa  208  4e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248742  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20850  isochorismate hydrolase  53.27 
 
 		 221 aa  205  4e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00852514 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1127  isochorismatase  47.83 
 
 		 284 aa  204  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.78155 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2020  Isochorismatase  48.6 
 
 		 327 aa  202  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.745871 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2989  isochorismatase  48.1 
 
 		 297 aa  203  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1027  Isochorismatase  50.24 
 
 		 212 aa  202  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.553092  decreased coverage  0.000215707 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2336  isochorismatase  47.62 
 
 		 297 aa  202  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.134654  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2471  isochorismatase  47.14 
 
 		 295 aa  201  6e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000432607  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1804  isochorismatase  49.31 
 
 		 285 aa  200  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2207  isochorismatase  47.14 
 
 		 295 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2146  isochorismatase  47.14 
 
 		 295 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.315852  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2130  isochorismatase  47.14 
 
 		 295 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2371  isochorismatase  47.14 
 
 		 295 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2389  isochorismatase  47.14 
 
 		 295 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2401  isochorismatase  47.14 
 
 		 297 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168949  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0014  isochorismatase  50 
 
 		 290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0011  isochorismatase  50 
 
 		 290 aa  199  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1688  isochorismatase  52.71 
 
 		 291 aa  197  9e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2178  isochorismatase  46.19 
 
 		 297 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00513339  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00562  isochorismatase  45.45 
 
 		 285 aa  192  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00551  hypothetical protein  45.45 
 
 		 285 aa  192  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3031  Isochorismatase  45.45 
 
 		 285 aa  192  3e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0773694  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0615  isochorismatase  45.45 
 
 		 285 aa  192  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3049  isochorismatase  45.45 
 
 		 285 aa  192  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0615  isochorismatase  45.45 
 
 		 285 aa  192  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0646  isochorismatase  45.45 
 
 		 285 aa  192  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0680  isochorismatase  45.45 
 
 		 285 aa  192  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.180051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1757  isochorismatase  46.86 
 
 		 297 aa  192  4e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0636  isochorismatase  46.38 
 
 		 285 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.529222  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0709  isochorismatase  46.38 
 
 		 285 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0650  isochorismatase  46.38 
 
 		 285 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.394941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0693  isochorismatase  46.38 
 
 		 285 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0544005 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0497  isochorismatase  44.98 
 
 		 285 aa  192  5e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4517  Isochorismatase  48.56 
 
 		 270 aa  191  9e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0854909  normal  0.417709 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0755  isochorismatase  45.89 
 
 		 285 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1870  isochorismatase  49.05 
 
 		 221 aa  190  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.408465  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01400  hypothetical protein  45.97 
 
 		 296 aa  188  5e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5030  Isochorismatase  47.55 
 
 		 207 aa  187  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54727 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0464  Isochorismatase  46.8 
 
 		 291 aa  187  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.889964  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1623  isochorismatase  44.98 
 
 		 294 aa  186  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3684  isochorismatase hydrolase  51.87 
 
 		 207 aa  185  4e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21200  Isochorismatase (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  48.74 
 
 		 278 aa  185  4e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0178393  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3075  Isochorismatase  46.46 
 
 		 283 aa  185  5e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1569  isochorismatase  44.5 
 
 		 207 aa  180  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0910481  normal  0.0511098 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09450  phenazine biosynthesis protein PhzD  47.32 
 
 		 207 aa  179  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39925  phenazine biosynthesis protein PhzD  47.32 
 
 		 207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0886  phenazine biosynthesis protein PhzD  46.57 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3382  phenazine biosynthesis protein PhzD  46.57 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.963565  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3619  isochorismatase  47.98 
 
 		 251 aa  175  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.501352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0300  vibriobactin-specific isochorismatase  44.19 
 
 		 293 aa  172  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3398  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.47 
 
 		 319 aa  171  5e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.877818 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2425  Isochorismatase  46.84 
 
 		 220 aa  170  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1633  isochorismatase  42.71 
 
 		 299 aa  170  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.741759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4467  Isochorismatase  45.41 
 
 		 201 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.813691 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0639  Isochorismatase  43.26 
 
 		 216 aa  165  5.9999999999999996e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.316933  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0113  Isochorismatase  43.28 
 
 		 260 aa  156  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.662986  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02097  hypothetical protein  38.76 
 
 		 264 aa  142  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  32.07 
 
 		 227 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  34.91 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  33.9 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  33.93 
 
 		 190 aa  79.3  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  31.55 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  28.81 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  31.15 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  28.88 
 
 		 190 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  27.17 
 
 		 190 aa  74.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 		 190 aa  74.7  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  27.47 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  31.11 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  30.29 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  29.08 
 
 		 197 aa  72  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1712  putative isochorismatase hydrolase  29.45 
 
 		 187 aa  72  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  29.82 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  33.17 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  27.42 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2403  isochorismatase hydrolase  30.39 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  28.31 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  29.78 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3796  isochorismatase hydrolase  30.63 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525922  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4572  isochorismatase hydrolase  30.63 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  30.63 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2058  isochorismatase hydrolase  29 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  34.04 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  29.63 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  35.46 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2717  isochorismatase hydrolase  32.26 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4714  isochorismatase hydrolase  31.17 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0460  isochorismatase hydrolase  28.74 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000118146  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0445  isochorismatase hydrolase  29.31 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000176183  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  26.01 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  26.59 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  26.01 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0815  isochorismatase hydrolase  31.85 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0792  isochorismatase hydrolase  31.85 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  29.94 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>