286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0464 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0464  Isochorismatase  100 
 
 		 291 aa  607  1e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.889964  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00562  isochorismatase  63.64 
 
 		 285 aa  381  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00551  hypothetical protein  63.64 
 
 		 285 aa  381  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3031  Isochorismatase  63.64 
 
 		 285 aa  380  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0773694  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3419  isochorismatase  61.05 
 
 		 284 aa  380  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000498734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0646  isochorismatase  63.64 
 
 		 285 aa  380  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0755  isochorismatase  64.56 
 
 		 285 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3049  isochorismatase  63.64 
 
 		 285 aa  380  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0680  isochorismatase  63.64 
 
 		 285 aa  380  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.180051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0615  isochorismatase  63.64 
 
 		 285 aa  380  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0693  isochorismatase  64.91 
 
 		 285 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0544005 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0615  isochorismatase  63.64 
 
 		 285 aa  379  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0709  isochorismatase  64.91 
 
 		 285 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1127  isochorismatase  63.29 
 
 		 284 aa  379  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.78155 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0650  isochorismatase  64.91 
 
 		 285 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.394941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0636  isochorismatase  64.56 
 
 		 285 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.529222  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0497  isochorismatase  62.59 
 
 		 285 aa  372  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1623  isochorismatase  56.8 
 
 		 294 aa  360  1e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3737  Isochorismatase  57.49 
 
 		 287 aa  359  2e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248742  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1316  Isochorismatase  60 
 
 		 291 aa  346  3e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0470712  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1488  Isochorismatase  60.7 
 
 		 291 aa  337  9.999999999999999e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3075  Isochorismatase  54.9 
 
 		 283 aa  337  9.999999999999999e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0011  isochorismatase  57.53 
 
 		 290 aa  328  6e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0014  isochorismatase  57.19 
 
 		 290 aa  323  2e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01400  hypothetical protein  51.85 
 
 		 296 aa  315  7e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1633  isochorismatase  52.78 
 
 		 299 aa  303  2.0000000000000002e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.741759  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2207  isochorismatase  47.93 
 
 		 295 aa  294  1e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2371  isochorismatase  47.93 
 
 		 295 aa  294  1e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2471  isochorismatase  47.93 
 
 		 295 aa  291  7e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000432607  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2401  isochorismatase  46.58 
 
 		 297 aa  290  2e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168949  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2146  isochorismatase  47.24 
 
 		 295 aa  290  2e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.315852  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2989  isochorismatase  46.58 
 
 		 297 aa  290  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2130  isochorismatase  47.59 
 
 		 295 aa  289  3e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2389  isochorismatase  47.24 
 
 		 295 aa  289  3e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2178  isochorismatase  46.23 
 
 		 297 aa  288  1e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00513339  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1757  isochorismatase  46.08 
 
 		 297 aa  287  2e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2336  isochorismatase  46.58 
 
 		 297 aa  286  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.134654  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2020  Isochorismatase  47.67 
 
 		 327 aa  286  2e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.745871 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1688  isochorismatase  50.68 
 
 		 291 aa  286  4e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1804  isochorismatase  47.5 
 
 		 285 aa  276  3e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21200  Isochorismatase (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  46.57 
 
 		 278 aa  267  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0178393  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0300  vibriobactin-specific isochorismatase  47.75 
 
 		 293 aa  267  2e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3398  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.71 
 
 		 319 aa  255  5e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.877818 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4517  Isochorismatase  43.36 
 
 		 270 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0854909  normal  0.417709 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1027  Isochorismatase  50.24 
 
 		 212 aa  232  5e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.553092  decreased coverage  0.000215707 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3619  isochorismatase  51.44 
 
 		 251 aa  222  6e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.501352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1569  isochorismatase  51.92 
 
 		 207 aa  218  7e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0910481  normal  0.0511098 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20850  isochorismate hydrolase  50.24 
 
 		 221 aa  214  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00852514 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09450  phenazine biosynthesis protein PhzD  47.8 
 
 		 207 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39925  phenazine biosynthesis protein PhzD  47.32 
 
 		 207 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0639  Isochorismatase  50.24 
 
 		 216 aa  206  5e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.316933  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3382  phenazine biosynthesis protein PhzD  47.8 
 
 		 207 aa  205  7e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.963565  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0886  phenazine biosynthesis protein PhzD  47.8 
 
 		 207 aa  205  7e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3684  isochorismatase hydrolase  50.74 
 
 		 207 aa  202  5e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2425  Isochorismatase  49.74 
 
 		 220 aa  202  5e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02097  hypothetical protein  41.34 
 
 		 264 aa  199  3.9999999999999996e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1870  isochorismatase  44.5 
 
 		 221 aa  199  5e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.408465  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5030  Isochorismatase  45.37 
 
 		 207 aa  190  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54727 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2274  Isochorismatase  44.66 
 
 		 211 aa  189  2.9999999999999997e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.412367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2383  isochorismatase  46.8 
 
 		 218 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.231944  normal  0.805423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4467  Isochorismatase  41.67 
 
 		 201 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.813691 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0113  Isochorismatase  38.35 
 
 		 260 aa  159  7e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.662986  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  29.05 
 
 		 180 aa  87.8  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  30.85 
 
 		 190 aa  84  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  28.42 
 
 		 193 aa  81.6  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  29.76 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0815  isochorismatase hydrolase  31.82 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0792  isochorismatase hydrolase  31.82 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  27.6 
 
 		 188 aa  74.7  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0016  isochorismatase hydrolase  30.41 
 
 		 185 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  26.5 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  26.98 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0016  isochorismatase hydrolase  27.22 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.392436  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  27.22 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5297  isochorismatase family protein  26.78 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000537015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1868  isochorismatase  43.06 
 
 		 84 aa  69.7  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.032258  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  28.28 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  27 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  30.89 
 
 		 193 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  24.34 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0019  isochorismatase family protein  26.67 
 
 		 179 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  26.67 
 
 		 179 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  27.22 
 
 		 179 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.382444  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0016  isochorismatase family protein  26.67 
 
 		 179 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191123  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0021  isochorismatase family protein  26.67 
 
 		 179 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0606  isochorismatase hydrolase  25.67 
 
 		 200 aa  67  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  24.68 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0021  isochorismatase family protein  26.55 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00499035  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0017  isochorismatase family protein  26.9 
 
 		 179 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0209161  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  25.93 
 
 		 188 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  25.93 
 
 		 188 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0023  isochorismatase family protein  25.68 
 
 		 179 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000151833  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  25.93 
 
 		 188 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  25.93 
 
 		 188 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  25.93 
 
 		 188 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3470  amino acid adenylation  40 
 
 		 1167 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3533  amino acid adenylation domain-containing protein  40 
 
 		 1167 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.639197 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  26.04 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3481  amino acid adenylation domain-containing protein  40 
 
 		 1167 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10847  normal  0.233561 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  28.96 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>