More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0300 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0300  vibriobactin-specific isochorismatase  100 
 
 		 293 aa  600  1e-170  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1804  isochorismatase  49.12 
 
 		 285 aa  284  1.0000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01400  hypothetical protein  48.46 
 
 		 296 aa  284  1.0000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02097  hypothetical protein  52.12 
 
 		 264 aa  280  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1688  isochorismatase  50.52 
 
 		 291 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3398  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.32 
 
 		 319 aa  274  1.0000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.877818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2020  Isochorismatase  46.05 
 
 		 327 aa  268  8e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.745871 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2989  isochorismatase  45.08 
 
 		 297 aa  264  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2336  isochorismatase  45.08 
 
 		 297 aa  263  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.134654  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2401  isochorismatase  45.42 
 
 		 297 aa  263  3e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168949  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2178  isochorismatase  45.76 
 
 		 297 aa  263  3e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00513339  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3419  isochorismatase  45.61 
 
 		 284 aa  262  4e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000498734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1623  isochorismatase  46.92 
 
 		 294 aa  262  4.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2471  isochorismatase  47.54 
 
 		 295 aa  261  8e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000432607  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2207  isochorismatase  46.53 
 
 		 295 aa  259  3e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2371  isochorismatase  46.53 
 
 		 295 aa  259  3e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0464  Isochorismatase  47.4 
 
 		 291 aa  258  6e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.889964  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2146  isochorismatase  46.18 
 
 		 295 aa  257  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.315852  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2389  isochorismatase  46.18 
 
 		 295 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2130  isochorismatase  46.83 
 
 		 295 aa  256  3e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1127  isochorismatase  45.61 
 
 		 284 aa  256  4e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.78155 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1757  isochorismatase  45.67 
 
 		 297 aa  255  6e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1488  Isochorismatase  47.18 
 
 		 291 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21200  Isochorismatase (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  46.21 
 
 		 278 aa  253  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0178393  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0011  isochorismatase  44.83 
 
 		 290 aa  248  7e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0650  isochorismatase  44.76 
 
 		 285 aa  247  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.394941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0755  isochorismatase  44.76 
 
 		 285 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0693  isochorismatase  44.76 
 
 		 285 aa  247  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0544005 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0709  isochorismatase  44.76 
 
 		 285 aa  247  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00562  isochorismatase  44.29 
 
 		 285 aa  247  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0615  isochorismatase  44.79 
 
 		 285 aa  246  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00551  hypothetical protein  44.29 
 
 		 285 aa  247  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3049  isochorismatase  44.29 
 
 		 285 aa  246  3e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3031  Isochorismatase  44.29 
 
 		 285 aa  246  3e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0773694  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1316  Isochorismatase  45.49 
 
 		 291 aa  246  3e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0470712  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0646  isochorismatase  44.29 
 
 		 285 aa  246  3e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0680  isochorismatase  44.29 
 
 		 285 aa  246  3e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.180051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0615  isochorismatase  44.29 
 
 		 285 aa  246  3e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0636  isochorismatase  44.41 
 
 		 285 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.529222  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0497  isochorismatase  44.44 
 
 		 285 aa  244  9.999999999999999e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0014  isochorismatase  44.48 
 
 		 290 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1633  isochorismatase  47.44 
 
 		 299 aa  242  3.9999999999999997e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.741759  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3684  isochorismatase hydrolase  58.29 
 
 		 207 aa  236  4e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3737  Isochorismatase  42.25 
 
 		 287 aa  235  8e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248742  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4517  Isochorismatase  44.6 
 
 		 270 aa  223  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0854909  normal  0.417709 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3075  Isochorismatase  42.71 
 
 		 283 aa  222  7e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1027  Isochorismatase  50 
 
 		 212 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.553092  decreased coverage  0.000215707 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20850  isochorismate hydrolase  47.22 
 
 		 221 aa  204  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00852514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3619  isochorismatase  49.75 
 
 		 251 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.501352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1569  isochorismatase  49.05 
 
 		 207 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0910481  normal  0.0511098 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1870  isochorismatase  47.09 
 
 		 221 aa  195  9e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.408465  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0639  Isochorismatase  46.57 
 
 		 216 aa  195  9e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.316933  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2274  Isochorismatase  45.24 
 
 		 211 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.412367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2425  Isochorismatase  41.71 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0886  phenazine biosynthesis protein PhzD  42.58 
 
 		 207 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3382  phenazine biosynthesis protein PhzD  42.58 
 
 		 207 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.963565  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09450  phenazine biosynthesis protein PhzD  42.58 
 
 		 207 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39925  phenazine biosynthesis protein PhzD  42.58 
 
 		 207 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5030  Isochorismatase  44.12 
 
 		 207 aa  176  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54727 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2383  isochorismatase  44.19 
 
 		 218 aa  172  5e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.231944  normal  0.805423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4467  Isochorismatase  40 
 
 		 201 aa  152  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.813691 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0113  Isochorismatase  39.22 
 
 		 260 aa  152  5.9999999999999996e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.662986  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  30.94 
 
 		 180 aa  71.2  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  28.18 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  33.1 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  32.4 
 
 		 188 aa  68.6  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  31.32 
 
 		 209 aa  68.2  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  31.76 
 
 		 201 aa  67  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  33.92 
 
 		 204 aa  67  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1849  isochorismatase hydrolase  28.81 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  27.57 
 
 		 227 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  33.57 
 
 		 201 aa  65.5  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  30.85 
 
 		 201 aa  65.1  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  26.98 
 
 		 192 aa  64.7  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  28.96 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  28.96 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  30.06 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3931  isochorismatase hydrolase  27.87 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  30.11 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  30.6 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  27.49 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2511  isochorismatase hydrolase  27.47 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446078  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  26.37 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0815  isochorismatase hydrolase  29.28 
 
 		 194 aa  62  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  30 
 
 		 195 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0792  isochorismatase hydrolase  29.28 
 
 		 194 aa  62  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0430  isochorismatase hydrolase  28.83 
 
 		 184 aa  61.6  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.650644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  28.42 
 
 		 187 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  27.33 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0606  isochorismatase hydrolase  28.04 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2821  amino acid adenylation domain-containing protein  37.04 
 
 		 2174 aa  60.5  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  29.85 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  23.81 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  29.07 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0482  isochorismatase hydrolase  30.87 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.717591  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  25.56 
 
 		 224 aa  58.5  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4294  isochorismatase hydrolase  30.63 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  28.5 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1059  isochorismatase hydrolase  30.72 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0989042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2403  isochorismatase hydrolase  25.86 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>