More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2038 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 224 aa  460  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2306  isochorismatase hydrolase  41.96 
 
 		 246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2058  isochorismatase hydrolase  41.46 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4275  isochorismatase hydrolase  39.01 
 
 		 227 aa  149  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.41702  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2026  isochorismatase hydrolase  39.09 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0906  isochorismatase hydrolase  32.83 
 
 		 222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00114508  normal  0.390187 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1766  isochorismatase hydrolase  31.98 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  32.54 
 
 		 224 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  31.75 
 
 		 213 aa  94  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 		 212 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  30.65 
 
 		 190 aa  90.1  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  31.28 
 
 		 227 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  29.5 
 
 		 193 aa  87.4  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  33.18 
 
 		 264 aa  87.8  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  32.86 
 
 		 266 aa  84.7  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  30.69 
 
 		 189 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  35.4 
 
 		 204 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  30.96 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  32.97 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  30.37 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  30.35 
 
 		 188 aa  80.9  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0464  Isochorismatase  29.76 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.889964  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  32.09 
 
 		 274 aa  79  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  27.5 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  27.5 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  27.5 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  27.5 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  27.5 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3766  isochorismatase hydrolase  34.43 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.716861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  29.36 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0606  isochorismatase hydrolase  27.6 
 
 		 200 aa  77.8  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  28.44 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  28.79 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  28.44 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  27.41 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5340  isochorismatase hydrolase  29.82 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  28.44 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  28.77 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  28.77 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  30.06 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  31.11 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  27.72 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  27.72 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  27.36 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  27.72 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  26.53 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  27.72 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  27.72 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  27.72 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0481  isochorismatase hydrolase  24.5 
 
 		 186 aa  74.3  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  27.98 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3737  Isochorismatase  26.7 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248742  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  31 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  28.17 
 
 		 227 aa  72  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3576  isochorismatase hydrolase  26.63 
 
 		 213 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360022 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  27.23 
 
 		 188 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3684  isochorismatase hydrolase  29.44 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  26.55 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20850  isochorismate hydrolase  27.98 
 
 		 221 aa  71.6  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00852514 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 232 aa  72  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  27.23 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1896  isochorismatase hydrolase  26.63 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.404618  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3941  isochorismatase superfamily hydrolase  26.63 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  27.64 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  29.31 
 
 		 191 aa  71.6  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1488  Isochorismatase  27.86 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  30.09 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1870  isochorismatase  27.57 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.408465  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  27.59 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0690  isochorismatase  33.33 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0385693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  31.19 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3317  isochorismatase hydrolase  27.17 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  26.7 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0639  Isochorismatase  29.95 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.316933  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1316  Isochorismatase  27.67 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0470712  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0780  isochorismatase hydrolase  26.17 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.473619  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  28 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  29.8 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  25.93 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  27.94 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  28.41 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  28.5 
 
 		 533 aa  68.9  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  31.16 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  25.52 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1936  isochorismatase hydrolase  31.55 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1569  isochorismatase  26.42 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0910481  normal  0.0511098 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0542  isochorismatase hydrolase  29.44 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17210  nicotinamidase-like amidase  29.95 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0014  isochorismatase  27.27 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  25.93 
 
 		 190 aa  67.8  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  23.86 
 
 		 190 aa  67.8  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  28.02 
 
 		 203 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0181  isochorismatase hydrolase  26.52 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  29.06 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  29.06 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2641  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  23.83 
 
 		 187 aa  67.8  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1793  isochorismatase hydrolase  29.83 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.130883 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  27.98 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>