More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_39925 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_09450  phenazine biosynthesis protein PhzD  99.52 
 
 		 207 aa  423  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39925  phenazine biosynthesis protein PhzD  100 
 
 		 207 aa  425  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0886  phenazine biosynthesis protein PhzD  95.63 
 
 		 207 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3382  phenazine biosynthesis protein PhzD  95.63 
 
 		 207 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.963565  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1569  isochorismatase  62.14 
 
 		 207 aa  291  5e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0910481  normal  0.0511098 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5030  Isochorismatase  66.99 
 
 		 207 aa  286  2e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54727 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3619  isochorismatase  55.83 
 
 		 251 aa  237  8e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.501352  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2207  isochorismatase  50.49 
 
 		 295 aa  235  4e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2371  isochorismatase  50.49 
 
 		 295 aa  235  4e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2146  isochorismatase  50 
 
 		 295 aa  234  8e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.315852  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2389  isochorismatase  50 
 
 		 295 aa  234  8e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2471  isochorismatase  50.49 
 
 		 295 aa  234  9e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000432607  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2130  isochorismatase  50 
 
 		 295 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2178  isochorismatase  49.76 
 
 		 297 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00513339  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2336  isochorismatase  50 
 
 		 297 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.134654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2989  isochorismatase  50 
 
 		 297 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2401  isochorismatase  50 
 
 		 297 aa  231  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168949  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1757  isochorismatase  50.97 
 
 		 297 aa  228  4e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1316  Isochorismatase  49.76 
 
 		 291 aa  223  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0470712  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3419  isochorismatase  50.73 
 
 		 284 aa  222  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000498734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0011  isochorismatase  51.98 
 
 		 290 aa  222  3e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1488  Isochorismatase  50.24 
 
 		 291 aa  221  4.9999999999999996e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0014  isochorismatase  51.49 
 
 		 290 aa  221  7e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1870  isochorismatase  52.91 
 
 		 221 aa  216  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.408465  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1027  Isochorismatase  53.17 
 
 		 212 aa  216  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.553092  decreased coverage  0.000215707 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3737  Isochorismatase  47.57 
 
 		 287 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248742  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1127  isochorismatase  48.06 
 
 		 284 aa  211  9e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.78155 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2020  Isochorismatase  50 
 
 		 327 aa  209  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.745871 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00562  isochorismatase  46.12 
 
 		 285 aa  206  1e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00551  hypothetical protein  46.12 
 
 		 285 aa  206  1e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3031  Isochorismatase  46.12 
 
 		 285 aa  206  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0773694  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1633  isochorismatase  46.83 
 
 		 299 aa  206  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.741759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0615  isochorismatase  46.12 
 
 		 285 aa  206  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0680  isochorismatase  46.12 
 
 		 285 aa  206  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.180051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3049  isochorismatase  46.12 
 
 		 285 aa  206  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0615  isochorismatase  46.12 
 
 		 285 aa  206  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0646  isochorismatase  46.12 
 
 		 285 aa  206  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0464  Isochorismatase  46.89 
 
 		 291 aa  205  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.889964  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0650  isochorismatase  47.12 
 
 		 285 aa  203  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.394941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0636  isochorismatase  47.12 
 
 		 285 aa  203  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.529222  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0693  isochorismatase  47.12 
 
 		 285 aa  203  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0544005 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0709  isochorismatase  47.12 
 
 		 285 aa  203  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1623  isochorismatase  46.34 
 
 		 294 aa  202  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0755  isochorismatase  46.63 
 
 		 285 aa  202  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3684  isochorismatase hydrolase  50.24 
 
 		 207 aa  201  6e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0497  isochorismatase  45.15 
 
 		 285 aa  201  8e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01400  hypothetical protein  45.63 
 
 		 296 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1804  isochorismatase  47.8 
 
 		 285 aa  196  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20850  isochorismate hydrolase  47.83 
 
 		 221 aa  192  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00852514 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3075  Isochorismatase  44.39 
 
 		 283 aa  192  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1688  isochorismatase  48.34 
 
 		 291 aa  189  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2425  Isochorismatase  49.73 
 
 		 220 aa  188  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0113  Isochorismatase  48.4 
 
 		 260 aa  185  5e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.662986  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4517  Isochorismatase  47.32 
 
 		 270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0854909  normal  0.417709 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21200  Isochorismatase (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  45.05 
 
 		 278 aa  181  6e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0178393  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2383  isochorismatase  47.32 
 
 		 218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.231944  normal  0.805423 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2274  Isochorismatase  46.63 
 
 		 211 aa  179  4e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.412367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0639  Isochorismatase  43.14 
 
 		 216 aa  176  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.316933  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0300  vibriobactin-specific isochorismatase  42.58 
 
 		 293 aa  176  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4467  Isochorismatase  45.89 
 
 		 201 aa  170  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.813691 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3398  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.9 
 
 		 319 aa  170  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.877818 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02097  hypothetical protein  39.34 
 
 		 264 aa  138  4.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  30.81 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  29.57 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  30.52 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  31.43 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  26.06 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  27.57 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  29.07 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  29.24 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  26.75 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  27.94 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  36.63 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  25.48 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  31 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0792  isochorismatase hydrolase  26.98 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0815  isochorismatase hydrolase  26.98 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  21.11 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  30.41 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  32.5 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0690  isochorismatase  30.17 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0385693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  25.12 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3766  isochorismatase hydrolase  30.46 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.716861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  37.04 
 
 		 189 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  28.85 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1477  isochorismatase hydrolase  25.64 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0177  isochorismatase hydrolase  31.52 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0172  isochorismatase hydrolase  31.52 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  26.8 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  25.76 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  34 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  32.43 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  26.92 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  26.47 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19830  nicotinamidase-like amidase  37.08 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4001  isochorismatase hydrolase  32.73 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  29.8 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0460  isochorismatase hydrolase  31.65 
 
 		 174 aa  54.7  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000118146  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2717  isochorismatase hydrolase  31.08 
 
 		 189 aa  54.3  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7953  isochorismatase hydrolase  34.43 
 
 		 227 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>