More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3684 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3684  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 207 aa  418  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0300  vibriobactin-specific isochorismatase  58.29 
 
 		 293 aa  236  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0014  isochorismatase  54.59 
 
 		 290 aa  227  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0011  isochorismatase  54.59 
 
 		 290 aa  226  2e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1623  isochorismatase  52.43 
 
 		 294 aa  226  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1027  Isochorismatase  54.03 
 
 		 212 aa  223  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.553092  decreased coverage  0.000215707 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1488  Isochorismatase  53.81 
 
 		 291 aa  220  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2389  isochorismatase  48.82 
 
 		 295 aa  217  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2207  isochorismatase  48.82 
 
 		 295 aa  217  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2146  isochorismatase  48.82 
 
 		 295 aa  216  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.315852  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3419  isochorismatase  53.69 
 
 		 284 aa  217  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000498734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2371  isochorismatase  48.82 
 
 		 295 aa  217  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01400  hypothetical protein  53.54 
 
 		 296 aa  216  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2130  isochorismatase  48.82 
 
 		 295 aa  216  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0615  isochorismatase  52.91 
 
 		 285 aa  215  4e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3031  Isochorismatase  52.91 
 
 		 285 aa  215  4e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0773694  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2471  isochorismatase  48.34 
 
 		 295 aa  215  4e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000432607  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1633  isochorismatase  52.13 
 
 		 299 aa  215  4e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.741759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0680  isochorismatase  52.91 
 
 		 285 aa  215  4e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.180051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3049  isochorismatase  52.91 
 
 		 285 aa  215  4e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0646  isochorismatase  52.91 
 
 		 285 aa  215  4e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2178  isochorismatase  48.34 
 
 		 297 aa  214  5.9999999999999996e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00513339  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3398  alkylhydroperoxidase AhpD core  50 
 
 		 319 aa  214  8e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.877818 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00562  isochorismatase  52.43 
 
 		 285 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00551  hypothetical protein  52.43 
 
 		 285 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2336  isochorismatase  49.02 
 
 		 297 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.134654  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0615  isochorismatase  52.43 
 
 		 285 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2989  isochorismatase  49.02 
 
 		 297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2401  isochorismatase  49.75 
 
 		 297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168949  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1870  isochorismatase  51.18 
 
 		 221 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.408465  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1804  isochorismatase  51.2 
 
 		 285 aa  211  3.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1316  Isochorismatase  52.61 
 
 		 291 aa  211  5.999999999999999e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0470712  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0636  isochorismatase  52.43 
 
 		 285 aa  211  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.529222  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0693  isochorismatase  52.43 
 
 		 285 aa  211  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0544005 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0650  isochorismatase  52.43 
 
 		 285 aa  211  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.394941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0709  isochorismatase  52.43 
 
 		 285 aa  211  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1127  isochorismatase  51.46 
 
 		 284 aa  211  9e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.78155 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0755  isochorismatase  51.94 
 
 		 285 aa  209  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0497  isochorismatase  51.94 
 
 		 285 aa  209  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1757  isochorismatase  49.03 
 
 		 297 aa  207  9e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2020  Isochorismatase  48.57 
 
 		 327 aa  207  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.745871 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1688  isochorismatase  54.41 
 
 		 291 aa  206  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20850  isochorismate hydrolase  53.62 
 
 		 221 aa  205  4e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00852514 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3737  Isochorismatase  50 
 
 		 287 aa  204  6e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248742  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5030  Isochorismatase  54.97 
 
 		 207 aa  203  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54727 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0464  Isochorismatase  50.74 
 
 		 291 aa  203  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.889964  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2425  Isochorismatase  51.06 
 
 		 220 aa  202  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0886  phenazine biosynthesis protein PhzD  50.73 
 
 		 207 aa  202  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09450  phenazine biosynthesis protein PhzD  50.24 
 
 		 207 aa  202  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3382  phenazine biosynthesis protein PhzD  50.73 
 
 		 207 aa  202  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.963565  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1569  isochorismatase  48.77 
 
 		 207 aa  201  6e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0910481  normal  0.0511098 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39925  phenazine biosynthesis protein PhzD  50.24 
 
 		 207 aa  201  6e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21200  Isochorismatase (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  53.44 
 
 		 278 aa  200  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0178393  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3619  isochorismatase  51.79 
 
 		 251 aa  195  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.501352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02097  hypothetical protein  48.6 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0639  Isochorismatase  51.47 
 
 		 216 aa  188  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.316933  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2383  isochorismatase  51.87 
 
 		 218 aa  185  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.231944  normal  0.805423 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2274  Isochorismatase  46.45 
 
 		 211 aa  183  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.412367  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3075  Isochorismatase  47 
 
 		 283 aa  178  4e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4517  Isochorismatase  47.83 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0854909  normal  0.417709 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4467  Isochorismatase  47.06 
 
 		 201 aa  166  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.813691 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0113  Isochorismatase  41.26 
 
 		 260 aa  155  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.662986  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  34.15 
 
 		 180 aa  90.1  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  34.39 
 
 		 201 aa  81.6  0.000000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  33.93 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  30.98 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  32.16 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  28.93 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  34.18 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  33.84 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  26.42 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  30.94 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  36.55 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  31.11 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  31.87 
 
 		 193 aa  72  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  29.44 
 
 		 224 aa  71.6  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0430  isochorismatase hydrolase  28.24 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.650644  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  30.11 
 
 		 203 aa  71.2  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1023  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.228804  normal  0.0648547 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6174  isochorismatase hydrolase  24.44 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.122012 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  30.73 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  29.57 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2306  isochorismatase hydrolase  30.94 
 
 		 185 aa  68.2  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.978441  normal  0.33888 
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  31.09 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2403  isochorismatase hydrolase  32.24 
 
 		 185 aa  67.8  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  30 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  30 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  30 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  30 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  30 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  30.69 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  31.15 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0815  isochorismatase hydrolase  29.35 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2717  isochorismatase hydrolase  33.55 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0792  isochorismatase hydrolase  29.35 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  28.72 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1936  isochorismatase hydrolase  32.16 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1828  isochorismatase hydrolase  24.86 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0120591  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>