More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2603 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 193 aa  395  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2831  isochorismatase hydrolase  44.44 
 
 		 176 aa  160  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  38.2 
 
 		 180 aa  137  8.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  38.82 
 
 		 196 aa  133  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  38.86 
 
 		 172 aa  132  3.9999999999999996e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  38.15 
 
 		 174 aa  131  5e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0445  isochorismatase hydrolase  38.73 
 
 		 174 aa  123  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000176183  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0460  isochorismatase hydrolase  36.99 
 
 		 174 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000118146  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0073  isochorismatase hydrolase  36.42 
 
 		 176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  36.78 
 
 		 201 aa  117  7.999999999999999e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  35.06 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  34.48 
 
 		 199 aa  115  3.9999999999999997e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  35.39 
 
 		 204 aa  114  6.9999999999999995e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  35.09 
 
 		 203 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  34.12 
 
 		 214 aa  108  7.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1454  isochorismatase family protein  30.56 
 
 		 184 aa  107  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0526786  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0248  isochorismatase hydrolase  36.76 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3082  isochorismatase family protein  35.88 
 
 		 182 aa  105  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000597737 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2043  pyrazinamidase  36.47 
 
 		 182 aa  104  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00201028  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2370  isochorismatase family protein  36.47 
 
 		 182 aa  105  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.108087  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2285  isochorismatase family protein  36.47 
 
 		 182 aa  104  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.21607e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2241  isochorismatase family protein  35.88 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.025604  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2288  isochorismatase family protein  35.88 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0832099  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2083  isochorismatase hydrolase  35.88 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0890304  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2041  pyrazinamidase  35.88 
 
 		 182 aa  101  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.228157  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1085  amidase  31.11 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1242  isochorismatase family protein  32.95 
 
 		 184 aa  99.8  2e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000303599 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  37.21 
 
 		 201 aa  99  4e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  37.21 
 
 		 201 aa  97.4  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1537  isochorismatase hydrolase  32.6 
 
 		 183 aa  96.3  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1974  isochorismatase hydrolase  31.67 
 
 		 186 aa  95.1  6e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2008  isochorismatase hydrolase  31.67 
 
 		 186 aa  95.1  6e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0368  amidase  33.52 
 
 		 185 aa  94  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2628  isochorismatase hydrolase  32.6 
 
 		 183 aa  93.6  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0156  isochorismatase hydrolase  30.56 
 
 		 182 aa  91.3  9e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  34.27 
 
 		 188 aa  90.9  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1659  isochorismatase hydrolase  31.85 
 
 		 180 aa  89.7  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.262359  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  29.28 
 
 		 193 aa  89.7  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  31.66 
 
 		 215 aa  89  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  30.81 
 
 		 213 aa  87.8  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  31.03 
 
 		 190 aa  87  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0871  isochorismatase hydrolase  29.05 
 
 		 178 aa  85.1  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.317325  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  32.91 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  33 
 
 		 329 aa  82.4  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2761  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  35.11 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1908  isochorismatase hydrolase  31.43 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.460102 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  30.43 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  31.44 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0023  isochorismatase family protein  26.7 
 
 		 179 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000151833  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3089  N-carbamoylsarcosine amidase  31.58 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109998  hitchhiker  0.000000410333 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5297  isochorismatase family protein  25.57 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000537015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  28.72 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3491  N-carbamoylsarcosine amidase  32.04 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3549  isochorismatase hydrolase  30.51 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3544  isochorismatase hydrolase  30.51 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3617  isochorismatase hydrolase  30.51 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.644685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0021  isochorismatase family protein  25.57 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00499035  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0017  isochorismatase family protein  26.7 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0209161  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  27.51 
 
 		 228 aa  78.2  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  28.09 
 
 		 189 aa  77.8  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  26.14 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.382444  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  28.04 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0019  isochorismatase family protein  25.57 
 
 		 179 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  29.95 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0016  isochorismatase family protein  25.57 
 
 		 179 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191123  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0016  isochorismatase hydrolase  28.11 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0828  isochorismatase hydrolase  31.38 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  25.57 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0021  isochorismatase family protein  25.57 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0016  isochorismatase hydrolase  25.57 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.392436  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  29.95 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  31.22 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  31.22 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 		 222 aa  74.7  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4294  isochorismatase hydrolase  29.71 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  28 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  30.16 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0906  isochorismatase hydrolase  30.56 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.312292  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1674  isochorismatase family protein  28.73 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000489002  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  30.06 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0606  isochorismatase hydrolase  26.86 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1739  isochorismatase hydrolase  30.26 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00170664  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  27.91 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1936  isochorismatase hydrolase  30.93 
 
 		 207 aa  71.2  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  32.14 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2142  isochorismatase hydrolase  29.55 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3317  isochorismatase hydrolase  28.95 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1739  isochorismatase hydrolase  30.95 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0101718 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  26.52 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2976  isochorismatase hydrolase  29.73 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391176  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1859  isochorismatase hydrolase  31.64 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2765  isochorismatase hydrolase  28.04 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2809  isochorismatase hydrolase  28.04 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.168317 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1242  isochorismatase hydrolase  28.73 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  26.46 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1598  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  30.77 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0241286  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  27.81 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0464  Isochorismatase  30.89 
 
 		 291 aa  68.6  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.889964  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  27.22 
 
 		 236 aa  68.2  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1849  isochorismatase hydrolase  27.22 
 
 		 231 aa  68.2  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>