More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0972 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
190 aa  389  1e-107  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  74.21 
 
 
190 aa  297  8e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  74.07 
 
 
192 aa  292  2e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  68.42 
 
 
192 aa  283  1.0000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  64.21 
 
 
193 aa  263  1e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  43.09 
 
 
199 aa  152  2e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  43.32 
 
 
201 aa  144  6e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  42.49 
 
 
201 aa  144  9e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  37.89 
 
 
203 aa  142  3e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  45.74 
 
 
201 aa  141  5e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  45.7 
 
 
201 aa  141  5e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  38.8 
 
 
196 aa  134  6.0000000000000005e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  42.05 
 
 
214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  40.68 
 
 
204 aa  128  5.0000000000000004e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  30.73 
 
 
212 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  30.73 
 
 
227 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  29.09 
 
 
180 aa  90.1  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 
172 aa  89.4  3e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0073  isochorismatase hydrolase  29.61 
 
 
176 aa  85.9  3e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1085  amidase  32.07 
 
 
181 aa  83.6  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  31.64 
 
 
213 aa  81.6  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  30.37 
 
 
213 aa  81.3  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  27.69 
 
 
213 aa  81.3  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  30.73 
 
 
329 aa  81.3  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0460  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 
174 aa  80.5  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000118146  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 
174 aa  79  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
205 aa  78.2  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0445  isochorismatase hydrolase  28 
 
 
174 aa  78.2  0.00000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000176183  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  29.21 
 
 
244 aa  76.6  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  25.77 
 
 
213 aa  75.5  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2383  isochorismatase  31.58 
 
 
218 aa  74.7  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.231944  normal  0.805423 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  28.16 
 
 
264 aa  74.3  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  28 
 
 
193 aa  73.9  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3075  Isochorismatase  30.12 
 
 
283 aa  73.9  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0016  isochorismatase hydrolase  25.67 
 
 
179 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.392436  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  29.19 
 
 
274 aa  73.2  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5297  isochorismatase family protein  24.6 
 
 
179 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000537015  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22170  nicotinamidase-like amidase  29.03 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000776565  normal  0.0158237 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  28.37 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1316  Isochorismatase  29.61 
 
 
291 aa  72.4  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0470712  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1127  isochorismatase  29.7 
 
 
284 aa  72.4  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.78155 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1804  isochorismatase  30.99 
 
 
285 aa  72  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  29.73 
 
 
217 aa  72  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03716  conserved hypothetical protein  29.21 
 
 
222 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03665  hypothetical protein  29.21 
 
 
222 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4203  isochorismatase family protein  29.21 
 
 
222 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000421381 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0021  isochorismatase family protein  25.48 
 
 
179 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00499035  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  28.3 
 
 
248 aa  71.2  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  27.88 
 
 
231 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  27.88 
 
 
231 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  27.75 
 
 
231 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  27.23 
 
 
201 aa  70.5  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0464  Isochorismatase  27.07 
 
 
291 aa  70.5  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.889964  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  27.88 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  27.4 
 
 
231 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2207  isochorismatase  29.82 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2146  isochorismatase  29.24 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.315852  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07780  nicotinamidase, putative  27.65 
 
 
225 aa  69.7  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  31.19 
 
 
224 aa  70.5  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1757  isochorismatase  27.84 
 
 
297 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2371  isochorismatase  29.82 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  31.38 
 
 
221 aa  70.1  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2336  isochorismatase  29.82 
 
 
297 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.134654  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2389  isochorismatase  29.24 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2471  isochorismatase  29.82 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000432607  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0368  amidase  29.26 
 
 
185 aa  69.7  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  27.88 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4541  isochorismatase hydrolase  26.18 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.366879  normal  0.78546 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  27.4 
 
 
231 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  28.11 
 
 
247 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0019  isochorismatase family protein  24.6 
 
 
179 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0016  isochorismatase family protein  24.6 
 
 
179 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191123  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2178  isochorismatase  29.24 
 
 
297 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00513339  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2989  isochorismatase  29.82 
 
 
297 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0156  isochorismatase hydrolase  28.26 
 
 
182 aa  69.3  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  24.6 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2130  isochorismatase  29.24 
 
 
295 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0021  isochorismatase family protein  24.6 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3737  Isochorismatase  27.22 
 
 
287 aa  68.6  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248742  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  25.13 
 
 
179 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.382444  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0017  isochorismatase family protein  26.11 
 
 
179 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0209161  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2058  isochorismatase hydrolase  29.03 
 
 
225 aa  68.6  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  30.65 
 
 
226 aa  68.2  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  25.99 
 
 
213 aa  67.8  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  30.65 
 
 
226 aa  67.8  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  27.18 
 
 
204 aa  67  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  27.46 
 
 
214 aa  67.4  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  26.92 
 
 
231 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0023  isochorismatase family protein  24.06 
 
 
179 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000151833  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2401  isochorismatase  29.24 
 
 
297 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168949  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0016  isochorismatase hydrolase  25.48 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  29.38 
 
 
224 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2026  isochorismatase hydrolase  29.89 
 
 
218 aa  66.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  27.44 
 
 
248 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0690  isochorismatase  30.95 
 
 
200 aa  67  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0385693  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  26.77 
 
 
230 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  29.21 
 
 
266 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2425  Isochorismatase  30.81 
 
 
220 aa  66.2  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0606  isochorismatase hydrolase  25.41 
 
 
200 aa  66.2  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>