217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0113 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0113  Isochorismatase  100 
 
 		 260 aa  517  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.662986  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3619  isochorismatase  50.53 
 
 		 251 aa  188  8e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.501352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09450  phenazine biosynthesis protein PhzD  48.4 
 
 		 207 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39925  phenazine biosynthesis protein PhzD  48.4 
 
 		 207 aa  185  7e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0886  phenazine biosynthesis protein PhzD  47.34 
 
 		 207 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3382  phenazine biosynthesis protein PhzD  47.34 
 
 		 207 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.963565  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1569  isochorismatase  43.28 
 
 		 207 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0910481  normal  0.0511098 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5030  Isochorismatase  46.81 
 
 		 207 aa  176  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54727 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0014  isochorismatase  43.84 
 
 		 290 aa  172  5.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0011  isochorismatase  43.84 
 
 		 290 aa  171  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2401  isochorismatase  38.83 
 
 		 297 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168949  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2471  isochorismatase  38.83 
 
 		 295 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000432607  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2146  isochorismatase  38.83 
 
 		 295 aa  164  9e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.315852  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2389  isochorismatase  38.83 
 
 		 295 aa  164  9e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2207  isochorismatase  38.83 
 
 		 295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2130  isochorismatase  38.83 
 
 		 295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2371  isochorismatase  38.83 
 
 		 295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1757  isochorismatase  41.92 
 
 		 297 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1870  isochorismatase  42.23 
 
 		 221 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.408465  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2336  isochorismatase  38.35 
 
 		 297 aa  163  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.134654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2989  isochorismatase  37.86 
 
 		 297 aa  160  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2178  isochorismatase  38.83 
 
 		 297 aa  161  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00513339  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01400  hypothetical protein  40.58 
 
 		 296 aa  160  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1316  Isochorismatase  40.78 
 
 		 291 aa  159  4e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0470712  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0464  Isochorismatase  38.39 
 
 		 291 aa  159  5e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.889964  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2383  isochorismatase  43.28 
 
 		 218 aa  156  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.231944  normal  0.805423 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3684  isochorismatase hydrolase  41.26 
 
 		 207 aa  155  6e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1027  Isochorismatase  42.08 
 
 		 212 aa  155  8e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.553092  decreased coverage  0.000215707 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2020  Isochorismatase  40.32 
 
 		 327 aa  154  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.745871 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1623  isochorismatase  40 
 
 		 294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1633  isochorismatase  39.32 
 
 		 299 aa  152  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.741759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0300  vibriobactin-specific isochorismatase  39.22 
 
 		 293 aa  152  5e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1127  isochorismatase  38.42 
 
 		 284 aa  152  7e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.78155 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3737  Isochorismatase  36.63 
 
 		 287 aa  150  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248742  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3419  isochorismatase  35.92 
 
 		 284 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000498734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1488  Isochorismatase  39.68 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1804  isochorismatase  40 
 
 		 285 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1688  isochorismatase  40.49 
 
 		 291 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3031  Isochorismatase  36.41 
 
 		 285 aa  148  7e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0773694  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3049  isochorismatase  36.41 
 
 		 285 aa  148  7e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0615  isochorismatase  36.41 
 
 		 285 aa  148  7e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0680  isochorismatase  36.41 
 
 		 285 aa  148  7e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.180051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0646  isochorismatase  36.41 
 
 		 285 aa  148  7e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00562  isochorismatase  36.89 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00551  hypothetical protein  36.89 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0615  isochorismatase  36.89 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0636  isochorismatase  36.41 
 
 		 285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.529222  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0650  isochorismatase  36.41 
 
 		 285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.394941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0693  isochorismatase  36.41 
 
 		 285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0544005 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0709  isochorismatase  36.41 
 
 		 285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3398  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.84 
 
 		 319 aa  145  5e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.877818 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0755  isochorismatase  35.92 
 
 		 285 aa  145  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0497  isochorismatase  35.44 
 
 		 285 aa  142  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20850  isochorismate hydrolase  41.58 
 
 		 221 aa  142  7e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00852514 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2425  Isochorismatase  39.18 
 
 		 220 aa  140  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2274  Isochorismatase  38.83 
 
 		 211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.412367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02097  hypothetical protein  41.81 
 
 		 264 aa  139  4.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21200  Isochorismatase (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  40.22 
 
 		 278 aa  138  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0178393  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0639  Isochorismatase  36.36 
 
 		 216 aa  135  5e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.316933  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3075  Isochorismatase  33.98 
 
 		 283 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4467  Isochorismatase  37.77 
 
 		 201 aa  133  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.813691 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4517  Isochorismatase  38.22 
 
 		 270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0854909  normal  0.417709 
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  32.43 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  31.05 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 		 189 aa  68.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  33.68 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  28.19 
 
 		 187 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  31.19 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  27.93 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3421  isochorismatase hydrolase  28.42 
 
 		 217 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4947  isochorismatase hydrolase  28.42 
 
 		 217 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000317708 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5339  isochorismatase hydrolase  28.42 
 
 		 217 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.472338  normal  0.0895037 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  35.71 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  29.94 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  29.69 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  23.75 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2113  isochorismatase hydrolase  36.46 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0439307  normal  0.165313 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2403  isochorismatase hydrolase  30.81 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  31.82 
 
 		 209 aa  58.5  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6956  isochorismatase-family hydrolase  27.42 
 
 		 198 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0402515  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  29.48 
 
 		 215 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5812  isochorismatase hydrolase  30.39 
 
 		 187 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241433  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3865  isochorismatase hydrolase  26.8 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368607  normal  0.282134 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2021  isochorismatase hydrolase  29.67 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.128296  normal  0.0227718 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3979  isochorismatase hydrolase  26.8 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2950  isochorismatase hydrolase  29.44 
 
 		 188 aa  57  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5107  isochorismatase hydrolase  31.98 
 
 		 226 aa  57  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321359  normal  0.0633461 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6682  isochorismatase hydrolase  29.7 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3941  isochorismatase superfamily hydrolase  32.61 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2143  isochorismatase hydrolase  33.68 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.14833 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1896  isochorismatase hydrolase  32.61 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.404618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  25.25 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  25.73 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3576  isochorismatase hydrolase  32.61 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360022 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  26.75 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  26.78 
 
 		 190 aa  55.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7953  isochorismatase hydrolase  29.71 
 
 		 227 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315447  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  26.11 
 
 		 200 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  26.92 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  26.11 
 
 		 195 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>