More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1870 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1870  isochorismatase  100 
 
 		 221 aa  447  1e-125  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.408465  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20850  isochorismate hydrolase  56.02 
 
 		 221 aa  231  7.000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00852514 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2020  Isochorismatase  52.86 
 
 		 327 aa  229  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.745871 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2471  isochorismatase  47.71 
 
 		 295 aa  225  3e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000432607  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2178  isochorismatase  47.73 
 
 		 297 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00513339  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2401  isochorismatase  47.73 
 
 		 297 aa  224  9e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168949  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2207  isochorismatase  47.71 
 
 		 295 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2146  isochorismatase  47.71 
 
 		 295 aa  223  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.315852  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2371  isochorismatase  47.71 
 
 		 295 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2389  isochorismatase  47.71 
 
 		 295 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2130  isochorismatase  47.71 
 
 		 295 aa  223  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2336  isochorismatase  47.27 
 
 		 297 aa  223  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.134654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2989  isochorismatase  47.27 
 
 		 297 aa  223  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1027  Isochorismatase  50.94 
 
 		 212 aa  221  8e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.553092  decreased coverage  0.000215707 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1488  Isochorismatase  50.48 
 
 		 291 aa  217  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39925  phenazine biosynthesis protein PhzD  52.91 
 
 		 207 aa  216  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09450  phenazine biosynthesis protein PhzD  52.91 
 
 		 207 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1757  isochorismatase  45.91 
 
 		 297 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3684  isochorismatase hydrolase  51.18 
 
 		 207 aa  213  2.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0886  phenazine biosynthesis protein PhzD  51.92 
 
 		 207 aa  211  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3382  phenazine biosynthesis protein PhzD  51.92 
 
 		 207 aa  211  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.963565  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0014  isochorismatase  50.97 
 
 		 290 aa  209  2e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1804  isochorismatase  52.22 
 
 		 285 aa  209  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3619  isochorismatase  50.95 
 
 		 251 aa  209  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.501352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0011  isochorismatase  50.97 
 
 		 290 aa  209  3e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0639  Isochorismatase  49.54 
 
 		 216 aa  208  5e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.316933  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3419  isochorismatase  46.7 
 
 		 284 aa  206  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000498734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1316  Isochorismatase  47.62 
 
 		 291 aa  204  7e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0470712  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1623  isochorismatase  45.45 
 
 		 294 aa  202  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1569  isochorismatase  48.31 
 
 		 207 aa  201  6e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0910481  normal  0.0511098 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3737  Isochorismatase  45.54 
 
 		 287 aa  201  9e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248742  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01400  hypothetical protein  44.8 
 
 		 296 aa  199  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5030  Isochorismatase  49.52 
 
 		 207 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54727 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0464  Isochorismatase  44.88 
 
 		 291 aa  199  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.889964  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0300  vibriobactin-specific isochorismatase  47.09 
 
 		 293 aa  195  6e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1127  isochorismatase  43.46 
 
 		 284 aa  194  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.78155 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00562  isochorismatase  44.02 
 
 		 285 aa  190  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3031  Isochorismatase  44.02 
 
 		 285 aa  190  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0773694  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0646  isochorismatase  44.02 
 
 		 285 aa  190  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00551  hypothetical protein  44.02 
 
 		 285 aa  190  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3049  isochorismatase  44.02 
 
 		 285 aa  190  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0680  isochorismatase  44.02 
 
 		 285 aa  190  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.180051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0615  isochorismatase  44.02 
 
 		 285 aa  189  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2383  isochorismatase  49.05 
 
 		 218 aa  190  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.231944  normal  0.805423 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0615  isochorismatase  44.02 
 
 		 285 aa  190  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3075  Isochorismatase  44.93 
 
 		 283 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3398  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.89 
 
 		 319 aa  189  2.9999999999999997e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.877818 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1633  isochorismatase  45.05 
 
 		 299 aa  189  2.9999999999999997e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.741759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0497  isochorismatase  44.02 
 
 		 285 aa  188  5.999999999999999e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0709  isochorismatase  44.44 
 
 		 285 aa  185  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0650  isochorismatase  44.44 
 
 		 285 aa  185  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.394941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0755  isochorismatase  44.44 
 
 		 285 aa  185  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0693  isochorismatase  44.44 
 
 		 285 aa  185  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0544005 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0636  isochorismatase  44.44 
 
 		 285 aa  185  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.529222  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1688  isochorismatase  49.28 
 
 		 291 aa  184  7e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2274  Isochorismatase  46.45 
 
 		 211 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.412367  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21200  Isochorismatase (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  45.5 
 
 		 278 aa  181  6e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0178393  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2425  Isochorismatase  47.64 
 
 		 220 aa  180  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4467  Isochorismatase  45.19 
 
 		 201 aa  168  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.813691 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4517  Isochorismatase  46.53 
 
 		 270 aa  164  6.9999999999999995e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0854909  normal  0.417709 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0113  Isochorismatase  42.23 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.662986  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02097  hypothetical protein  41.99 
 
 		 264 aa  156  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  35.1 
 
 		 180 aa  87.4  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0815  isochorismatase hydrolase  33.5 
 
 		 194 aa  81.3  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0792  isochorismatase hydrolase  33.5 
 
 		 194 aa  81.3  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  35.2 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  29.79 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  27.57 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0032  isochorismatase hydrolase  29.51 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0481  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0430  isochorismatase hydrolase  27.42 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.650644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  31.05 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2026  isochorismatase hydrolase  34.83 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 193 aa  67.8  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  29.52 
 
 		 227 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  30.43 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  30.43 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  31.18 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  30.43 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  27.06 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  30.43 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  30.43 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02070  nicotinamidase-like amidase  30.43 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.450894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  30.49 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  27.87 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0460  isochorismatase hydrolase  30.12 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000118146  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  25.94 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  33.53 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0016  isochorismatase hydrolase  30.56 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  28.18 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0445  isochorismatase hydrolase  30.12 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000176183  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  31.36 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  32.43 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  31.53 
 
 		 195 aa  62  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  31.53 
 
 		 200 aa  62  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1712  putative isochorismatase hydrolase  30.27 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  31.49 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  34 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  30.95 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>