More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2473 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 192 aa  389  1e-107  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  74.07 
 
 		 190 aa  292  2e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  70.9 
 
 		 190 aa  291  5e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  67.2 
 
 		 192 aa  281  4.0000000000000003e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  69.68 
 
 		 193 aa  279  2e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  43.98 
 
 		 199 aa  163  2.0000000000000002e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  41.49 
 
 		 203 aa  150  1e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  42.94 
 
 		 201 aa  144  1e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  40 
 
 		 196 aa  141  7e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  42.16 
 
 		 201 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  43.65 
 
 		 201 aa  138  6e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  43.09 
 
 		 201 aa  137  8.999999999999999e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  37.7 
 
 		 204 aa  127  7.000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  37.78 
 
 		 214 aa  125  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 		 172 aa  99.4  3e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  31.52 
 
 		 212 aa  99  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  32.07 
 
 		 227 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  35.36 
 
 		 213 aa  94.4  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0460  isochorismatase hydrolase  29.14 
 
 		 174 aa  89.4  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000118146  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  28.92 
 
 		 180 aa  89  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0073  isochorismatase hydrolase  31.72 
 
 		 176 aa  88.2  7e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  35.62 
 
 		 188 aa  88.2  7e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0445  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 174 aa  86.3  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000176183  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  35.48 
 
 		 226 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  34.95 
 
 		 226 aa  85.1  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  28.23 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  28.64 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  29.58 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  35.48 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  28.64 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 329 aa  82  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03716  conserved hypothetical protein  30.65 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4203  isochorismatase family protein  30.65 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000421381 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2058  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03665  hypothetical protein  30.65 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22170  nicotinamidase-like amidase  30.59 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000776565  normal  0.0158237 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  31.64 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  28.72 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  27.88 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3684  isochorismatase hydrolase  30.98 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  33.99 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  27.96 
 
 		 274 aa  78.2  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  31.07 
 
 		 231 aa  77.8  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  31.07 
 
 		 231 aa  77.8  0.00000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  31.07 
 
 		 231 aa  77.8  0.00000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  31.07 
 
 		 231 aa  77.8  0.00000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  31.07 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  28.87 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  31.07 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1316  Isochorismatase  28.49 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0470712  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  27.41 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1804  isochorismatase  31.03 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  26.44 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  27.81 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  30.51 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  29.65 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  29.57 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2306  isochorismatase hydrolase  29.14 
 
 		 246 aa  75.5  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  29.94 
 
 		 244 aa  74.7  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  31.03 
 
 		 228 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1569  isochorismatase  28.02 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0910481  normal  0.0511098 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  30.88 
 
 		 230 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0016  isochorismatase hydrolase  27.22 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.392436  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  31.94 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  26.67 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0481  isochorismatase hydrolase  28.48 
 
 		 186 aa  74.3  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1085  amidase  28.73 
 
 		 181 aa  73.9  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5297  isochorismatase family protein  26.75 
 
 		 179 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000537015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1477  isochorismatase hydrolase  31.38 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3737  Isochorismatase  27.78 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248742  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0792  isochorismatase hydrolase  28.48 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  28.14 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0815  isochorismatase hydrolase  28.48 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  28.07 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0023  isochorismatase family protein  26.75 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000151833  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0871  isochorismatase hydrolase  32.41 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.317325  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2383  isochorismatase  30.29 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.231944  normal  0.805423 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0606  isochorismatase hydrolase  25.82 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0021  isochorismatase family protein  27.85 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00499035  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  29.8 
 
 		 266 aa  72  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  26.9 
 
 		 230 aa  72  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  27.73 
 
 		 231 aa  71.6  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  26.29 
 
 		 230 aa  71.2  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  31.33 
 
 		 233 aa  71.2  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3430  nicotinamidase  29.29 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.498347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  27.5 
 
 		 236 aa  71.2  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  28.57 
 
 		 233 aa  71.2  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4541  isochorismatase hydrolase  30.54 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.366879  normal  0.78546 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4851  isochorismatase hydrolase  31.55 
 
 		 224 aa  71.2  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  26.87 
 
 		 240 aa  71.2  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1368  pyrazinamidase/nicotinamidase  30.77 
 
 		 201 aa  71.2  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0036  nicotinamidase  30.77 
 
 		 201 aa  71.2  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21200  Isochorismatase (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  32.74 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0178393  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0017  isochorismatase family protein  26.75 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0209161  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  29.05 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0019  isochorismatase family protein  26.75 
 
 		 179 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  26.75 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0016  isochorismatase family protein  26.75 
 
 		 179 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191123  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0021  isochorismatase family protein  26.75 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  28.1 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>