More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0430 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0430  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
184 aa  376  1e-104  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.650644  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1023  isochorismatase hydrolase  67.78 
 
 
191 aa  258  5.0000000000000005e-68  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.228804  normal  0.0648547 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2152  isochorismatase hydrolase  51.91 
 
 
185 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1017  isochorismatase hydrolase  28.33 
 
 
222 aa  88.2  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5128  isochorismatase hydrolase  27.07 
 
 
220 aa  88.2  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  31.82 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  30.22 
 
 
187 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3796  isochorismatase hydrolase  30.22 
 
 
187 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525922  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4572  isochorismatase hydrolase  30.22 
 
 
187 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608605  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4001  isochorismatase hydrolase  29.28 
 
 
187 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  29.14 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  29.14 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  29.14 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  29.14 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  29.14 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 
187 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1272  isochorismatase hydrolase  28.89 
 
 
187 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107065  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  29.28 
 
 
187 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  37.61 
 
 
184 aa  74.3  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1280  isochorismatase family protein  37.27 
 
 
184 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  30.86 
 
 
190 aa  73.2  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1382  isochorismatase family protein  37.27 
 
 
184 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.030054  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1454  isochorismatase family protein  37.27 
 
 
184 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.40872 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5812  isochorismatase hydrolase  28.34 
 
 
187 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241433  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  27.86 
 
 
244 aa  72.4  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  31.43 
 
 
193 aa  72.8  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  28.35 
 
 
195 aa  72  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  29.34 
 
 
359 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  29.41 
 
 
176 aa  72  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  28.35 
 
 
200 aa  72  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  29.41 
 
 
176 aa  72  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  30.07 
 
 
174 aa  72  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  29.41 
 
 
176 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5346  isochorismatase hydrolase  29.03 
 
 
217 aa  71.6  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708564  normal  0.524133 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3684  isochorismatase hydrolase  28.24 
 
 
207 aa  71.6  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02070  nicotinamidase-like amidase  27.32 
 
 
258 aa  71.2  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.450894  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  28.05 
 
 
190 aa  71.2  0.000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  27.92 
 
 
188 aa  70.9  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1252  isochorismatase family protein  36.36 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425084  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  28.76 
 
 
176 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  29.34 
 
 
359 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2021  isochorismatase hydrolase  29.12 
 
 
187 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.128296  normal  0.0227718 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3927  isochorismatase family protein  37.27 
 
 
184 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1416  isochorismatase family protein  37.27 
 
 
184 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  28.06 
 
 
188 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  28.06 
 
 
188 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  28.06 
 
 
188 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  35.45 
 
 
185 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  28.06 
 
 
188 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3277  hypothetical protein  27.93 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  28.06 
 
 
188 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  28.35 
 
 
195 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4714  isochorismatase hydrolase  29.49 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  28.06 
 
 
188 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1870  isochorismatase  27.42 
 
 
221 aa  69.7  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.408465  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3599  hypothetical protein  27.37 
 
 
199 aa  68.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  29.73 
 
 
176 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  28.11 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1287  isochorismatase hydrolase  29.03 
 
 
184 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 
221 aa  68.9  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  28.07 
 
 
188 aa  68.2  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  35.51 
 
 
190 aa  68.2  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1477  isochorismatase hydrolase  39.36 
 
 
198 aa  67.8  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131824  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  28.4 
 
 
197 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  27.5 
 
 
224 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2540  isochorismatase hydrolase  25.26 
 
 
198 aa  67  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.417405  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0649  isochorismatase family protein  30.64 
 
 
179 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.671  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  29.05 
 
 
176 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1127  isochorismatase  29.41 
 
 
284 aa  66.2  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.78155 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0172  isochorismatase hydrolase  26.6 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0177  isochorismatase hydrolase  26.6 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2058  isochorismatase hydrolase  28.29 
 
 
214 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  39.08 
 
 
192 aa  65.5  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  26.46 
 
 
237 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  25.37 
 
 
248 aa  64.7  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0709  isochorismatase  26.63 
 
 
285 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  35.87 
 
 
246 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0755  isochorismatase  26.63 
 
 
285 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0636  isochorismatase  26.63 
 
 
285 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.529222  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0650  isochorismatase  26.63 
 
 
285 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.394941  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0693  isochorismatase  26.63 
 
 
285 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0544005 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 
190 aa  64.3  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21200  Isochorismatase (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  25.6 
 
 
278 aa  63.2  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0178393  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2816  isochorismatase hydrolase  27.37 
 
 
187 aa  63.2  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.978539  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4517  Isochorismatase  28.32 
 
 
270 aa  63.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0854909  normal  0.417709 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2950  isochorismatase hydrolase  28.19 
 
 
188 aa  62.8  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0542  isochorismatase hydrolase  28.75 
 
 
199 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  25.65 
 
 
201 aa  62.8  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  28.57 
 
 
195 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5659  isochorismatase hydrolase  25.57 
 
 
177 aa  62  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.616311  normal  0.236437 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2403  isochorismatase hydrolase  28.32 
 
 
185 aa  62  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
172 aa  61.6  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1712  putative isochorismatase hydrolase  27.37 
 
 
187 aa  62  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1027  Isochorismatase  26.63 
 
 
212 aa  62  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.553092  decreased coverage  0.000215707 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  26.19 
 
 
189 aa  61.6  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0529  isochorismatase hydrolase  24.71 
 
 
180 aa  61.6  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  28.92 
 
 
204 aa  61.6  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0300  vibriobactin-specific isochorismatase  28.83 
 
 
293 aa  61.6  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2083  isochorismatase hydrolase  37.8 
 
 
182 aa  61.2  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0890304  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2401  isochorismatase  25.67 
 
 
297 aa  60.8  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168949  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>