More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4001 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4001  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 187 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  96.79 
 
 		 187 aa  362  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1272  isochorismatase hydrolase  89.25 
 
 		 187 aa  338  2.9999999999999998e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  88.77 
 
 		 187 aa  338  2.9999999999999998e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  87.7 
 
 		 187 aa  332  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3796  isochorismatase hydrolase  87.7 
 
 		 187 aa  332  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525922  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4572  isochorismatase hydrolase  87.7 
 
 		 187 aa  332  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4714  isochorismatase hydrolase  70.49 
 
 		 191 aa  265  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2021  isochorismatase hydrolase  67.93 
 
 		 187 aa  256  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.128296  normal  0.0227718 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5812  isochorismatase hydrolase  67.39 
 
 		 187 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241433  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1712  putative isochorismatase hydrolase  61.62 
 
 		 187 aa  245  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2403  isochorismatase hydrolase  65.22 
 
 		 185 aa  241  3.9999999999999997e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2816  isochorismatase hydrolase  59.36 
 
 		 187 aa  227  7e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.978539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2950  isochorismatase hydrolase  60.11 
 
 		 188 aa  218  3e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2306  isochorismatase hydrolase  53.3 
 
 		 185 aa  202  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.978441  normal  0.33888 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  57.51 
 
 		 193 aa  202  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0276  isochorismatase hydrolase  48.02 
 
 		 204 aa  169  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  42.71 
 
 		 195 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  42.71 
 
 		 200 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  43.37 
 
 		 195 aa  149  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  43.96 
 
 		 188 aa  141  5e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  43.33 
 
 		 190 aa  136  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  41.4 
 
 		 190 aa  131  6.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3277  hypothetical protein  44.02 
 
 		 199 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3599  hypothetical protein  44.02 
 
 		 199 aa  127  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  41.11 
 
 		 188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  41.11 
 
 		 188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  41.11 
 
 		 188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  41.11 
 
 		 188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  41.11 
 
 		 188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  41.11 
 
 		 188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1477  isochorismatase hydrolase  41.44 
 
 		 198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0542  isochorismatase hydrolase  41.75 
 
 		 199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  39.56 
 
 		 188 aa  124  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  39.56 
 
 		 188 aa  124  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  39.56 
 
 		 188 aa  124  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  39.56 
 
 		 188 aa  124  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  39.56 
 
 		 188 aa  124  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  40.56 
 
 		 188 aa  124  7e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  40.56 
 
 		 188 aa  124  7e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  44.12 
 
 		 190 aa  123  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  43.09 
 
 		 192 aa  123  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1016  amidase  37.76 
 
 		 200 aa  114  8.999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0172  isochorismatase hydrolase  35.75 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0177  isochorismatase hydrolase  35.75 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1769  isochorismatase hydrolase  40.72 
 
 		 189 aa  108  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1678  isochorismatase hydrolase  36.47 
 
 		 166 aa  95.1  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000210474  normal  0.105079 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2152  isochorismatase hydrolase  32.2 
 
 		 185 aa  85.1  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  35.2 
 
 		 189 aa  84.3  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  34.08 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  37.71 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0430  isochorismatase hydrolase  29.28 
 
 		 184 aa  77.4  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.650644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0032  isochorismatase hydrolase  26.82 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  25.54 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  33.7 
 
 		 195 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  32.94 
 
 		 189 aa  74.3  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1936  isochorismatase hydrolase  32.83 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20850  isochorismate hydrolase  29.63 
 
 		 221 aa  71.6  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00852514 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1023  isochorismatase hydrolase  32.33 
 
 		 191 aa  70.9  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.228804  normal  0.0648547 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3069  isochorismatase hydrolase  34.08 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000901159  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  29.95 
 
 		 244 aa  68.6  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  38.53 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  33.77 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1200  isochorismatase family protein  37.09 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.474191  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  29.03 
 
 		 389 aa  68.2  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  33.99 
 
 		 228 aa  68.2  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1215  isochorismatase hydrolase  32.88 
 
 		 185 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  28.34 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 199 aa  67.8  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2113  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 180 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0439307  normal  0.165313 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 199 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1403  isochorismatase hydrolase  34.72 
 
 		 175 aa  67.4  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  32.89 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  27.87 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  31.4 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  27.87 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0815  isochorismatase hydrolase  27.62 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4313  isochorismatase hydrolase  34.48 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2274  Isochorismatase  27.62 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.412367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0792  isochorismatase hydrolase  27.62 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5030  isochorismatase hydrolase  34.39 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0593911  decreased coverage  0.00786893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3307  isochorismatase hydrolase  33.9 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323098  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  29.79 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1569  isochorismatase  28.12 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0910481  normal  0.0511098 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1846  isochorismatase hydrolase  34.75 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  33.56 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  29.49 
 
 		 235 aa  64.7  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  31.13 
 
 		 231 aa  64.3  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  28.87 
 
 		 201 aa  64.3  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  32.53 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  31.18 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  31.13 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4714  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.249873 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0757  isochorismatase hydrolase  32.24 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.000750492  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1721  isochorismatase hydrolase  35.76 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3421  isochorismatase hydrolase  32.64 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  29.45 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  31.13 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0906  isochorismatase hydrolase  29.95 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00114508  normal  0.390187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>