More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1156 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  100 
 
 		 246 aa  507  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  93.88 
 
 		 245 aa  453  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  78.67 
 
 		 248 aa  370  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  78.73 
 
 		 231 aa  363  1e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  78.28 
 
 		 230 aa  362  3e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  78.28 
 
 		 231 aa  362  3e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  78.28 
 
 		 231 aa  362  3e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  78.28 
 
 		 230 aa  362  3e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  77.83 
 
 		 231 aa  360  8e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  77.83 
 
 		 231 aa  360  9e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  77.38 
 
 		 231 aa  358  3e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  81 
 
 		 230 aa  357  9.999999999999999e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  72.57 
 
 		 244 aa  344  8.999999999999999e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  74.88 
 
 		 233 aa  342  2.9999999999999997e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  72.07 
 
 		 252 aa  333  1e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  68.3 
 
 		 241 aa  331  5e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  71.67 
 
 		 248 aa  328  6e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  72.1 
 
 		 248 aa  319  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  72.22 
 
 		 247 aa  318  6e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  76.28 
 
 		 258 aa  312  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  32.9 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  30.29 
 
 		 264 aa  125  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  33.04 
 
 		 274 aa  115  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  32.72 
 
 		 236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  33.49 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  34.29 
 
 		 224 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  30.08 
 
 		 227 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17210  nicotinamidase-like amidase  35.43 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  33.99 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  31.53 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  33.5 
 
 		 233 aa  106  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  33.51 
 
 		 239 aa  106  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  34.63 
 
 		 230 aa  106  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  33.66 
 
 		 231 aa  106  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  33.17 
 
 		 239 aa  105  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  32.99 
 
 		 228 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  31.96 
 
 		 228 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  30.63 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  29.6 
 
 		 223 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  29.19 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  32.24 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  30.63 
 
 		 222 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  31.28 
 
 		 212 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  31.43 
 
 		 228 aa  102  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  32.32 
 
 		 232 aa  102  8e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  30.05 
 
 		 389 aa  101  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  32.47 
 
 		 239 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  33 
 
 		 221 aa  99.4  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  34.55 
 
 		 224 aa  99  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  32.69 
 
 		 213 aa  99  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  32.94 
 
 		 227 aa  98.2  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1793  isochorismatase hydrolase  36.21 
 
 		 215 aa  97.8  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.130883 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  31.84 
 
 		 214 aa  96.7  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  35.23 
 
 		 201 aa  96.3  4e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  32.65 
 
 		 240 aa  95.9  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  31.03 
 
 		 227 aa  95.9  6e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  30.41 
 
 		 203 aa  95.5  7e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  31.79 
 
 		 240 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  34.71 
 
 		 201 aa  93.6  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  28.43 
 
 		 233 aa  94.4  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  31.92 
 
 		 230 aa  92.4  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  33.15 
 
 		 204 aa  92  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  30.99 
 
 		 196 aa  92  8e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  32.18 
 
 		 199 aa  92  9e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  29.05 
 
 		 234 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  33.18 
 
 		 201 aa  91.3  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2765  isochorismatase hydrolase  31.96 
 
 		 230 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  31.79 
 
 		 234 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2809  isochorismatase hydrolase  31.96 
 
 		 230 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.168317 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  34.05 
 
 		 213 aa  90.1  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  28.87 
 
 		 247 aa  89  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  34.59 
 
 		 201 aa  88.6  7e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  29.78 
 
 		 233 aa  88.6  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  31.69 
 
 		 213 aa  88.6  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  32.34 
 
 		 213 aa  87.8  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  28.84 
 
 		 225 aa  87  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  26.82 
 
 		 236 aa  87  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  32.72 
 
 		 226 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  32.41 
 
 		 226 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2026  isochorismatase hydrolase  34.59 
 
 		 218 aa  85.5  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  32.41 
 
 		 226 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  33.97 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  27.69 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  31.73 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  28.87 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0370  isochorismatase hydrolase  28.5 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  31.38 
 
 		 329 aa  82.4  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2306  isochorismatase hydrolase  32.67 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  31.4 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  28.5 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  30.85 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  32.35 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0764  hypothetical protein  32.81 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0418642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  31.76 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  30.5 
 
 		 189 aa  78.2  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  28.37 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  28.57 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  28.57 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  28.57 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>