More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1793 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1793  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 215 aa  433  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.130883 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  57.55 
 
 		 224 aa  262  3e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02070  nicotinamidase-like amidase  43.24 
 
 		 258 aa  128  6e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.450894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2624  isochorismatase hydrolase  42.57 
 
 		 226 aa  123  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.722886  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  36.36 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  39.49 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  37.3 
 
 		 245 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  35.2 
 
 		 248 aa  94.7  9e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  31.07 
 
 		 227 aa  94.4  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  36.81 
 
 		 246 aa  92  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  35.87 
 
 		 204 aa  91.7  7e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0638  isochorismatase hydrolase  35.47 
 
 		 200 aa  91.3  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  35.68 
 
 		 258 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  35.96 
 
 		 241 aa  90.1  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  36.31 
 
 		 213 aa  89.4  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3109  isochorismatase hydrolase  44.14 
 
 		 207 aa  89.4  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.456789  normal  0.0286843 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  37.08 
 
 		 212 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  36.52 
 
 		 227 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  32.86 
 
 		 233 aa  87  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  34.78 
 
 		 248 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  29.52 
 
 		 239 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  32.2 
 
 		 234 aa  86.3  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  30.19 
 
 		 233 aa  85.5  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  33.89 
 
 		 231 aa  85.1  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  36.57 
 
 		 233 aa  85.1  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  31.68 
 
 		 236 aa  85.1  7e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  33.5 
 
 		 228 aa  84.7  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  30.2 
 
 		 228 aa  84.7  9e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  33.33 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  33.33 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  32.56 
 
 		 239 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  33.94 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  34.78 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  30.33 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1289  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.189342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  33.33 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1846  isochorismatase hydrolase  33.66 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0666128  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  33 
 
 		 236 aa  83.6  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1893  isochorismatase hydrolase  33.66 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  27.78 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  33.33 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1827  isochorismatase hydrolase  33.66 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  26.87 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  32.34 
 
 		 225 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  29.77 
 
 		 227 aa  81.6  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  28.71 
 
 		 230 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  32.78 
 
 		 231 aa  81.6  0.000000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  29.21 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  34.78 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22170  nicotinamidase-like amidase  36.52 
 
 		 197 aa  81.3  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000776565  normal  0.0158237 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  31.98 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  28.36 
 
 		 389 aa  80.5  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  31.87 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  28.23 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  31.84 
 
 		 191 aa  80.9  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  35.75 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  26.87 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  35.75 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2058  isochorismatase hydrolase  31.88 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  33.85 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  28.22 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  30.46 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  34.55 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  35.75 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  29.83 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  35.63 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  33.84 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1936  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  26.42 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  30.99 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1023  isochorismatase hydrolase  29.45 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.228804  normal  0.0648547 
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  31.77 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  37.68 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  32.98 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  29.05 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  31.47 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  29.29 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  31.98 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  33.89 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1993  isochorismatase hydrolase  31.89 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.94623 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  33.16 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  29.56 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2858  isochorismatase hydrolase  34.23 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  31.34 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  37.68 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  33.52 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  34.2 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  32.72 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  30.73 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  31.11 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0764  hypothetical protein  34.78 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0418642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  30.51 
 
 		 187 aa  74.7  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  29.29 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  33.8 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1030  isochorismatase hydrolase  32.79 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  32.72 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  31.22 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  33.16 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>