More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1827 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1846  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
216 aa  435  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0666128  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1893  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
216 aa  435  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159582  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1827  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
216 aa  435  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1289  isochorismatase hydrolase  50.48 
 
 
210 aa  195  4.0000000000000005e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.189342  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0606  isochorismatase hydrolase  31.38 
 
 
200 aa  102  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  31.41 
 
 
189 aa  94.7  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  32.47 
 
 
180 aa  90.5  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  32.49 
 
 
224 aa  84.7  9e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  32.24 
 
 
201 aa  83.2  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  30.05 
 
 
201 aa  82.8  0.000000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  31.37 
 
 
224 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1793  isochorismatase hydrolase  35.14 
 
 
215 aa  77.4  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.130883 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  27.47 
 
 
235 aa  77  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  25.73 
 
 
203 aa  75.9  0.0000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  30.86 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0073  isochorismatase hydrolase  22.35 
 
 
176 aa  74.7  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  27.23 
 
 
199 aa  72.8  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  31.22 
 
 
214 aa  72.8  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  25.73 
 
 
174 aa  72.4  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 
239 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  28.96 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  30.91 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  29.76 
 
 
230 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  27.42 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  30.23 
 
 
234 aa  69.3  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2142  isochorismatase hydrolase  32.12 
 
 
195 aa  68.9  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  30.52 
 
 
232 aa  68.2  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  30.92 
 
 
239 aa  68.2  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  32.52 
 
 
227 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  31.74 
 
 
212 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  28.88 
 
 
201 aa  67.8  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  26.79 
 
 
213 aa  67.4  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  27.65 
 
 
227 aa  67.4  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4851  isochorismatase hydrolase  33.93 
 
 
224 aa  67  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22170  nicotinamidase-like amidase  31.38 
 
 
197 aa  67.4  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000776565  normal  0.0158237 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  26.43 
 
 
233 aa  66.2  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0460  isochorismatase hydrolase  26.86 
 
 
174 aa  66.2  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000118146  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  29.35 
 
 
237 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  29.14 
 
 
190 aa  65.1  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  29.55 
 
 
193 aa  64.7  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  29.77 
 
 
233 aa  64.7  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1828  isochorismatase hydrolase  24 
 
 
228 aa  64.7  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0120591  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  28.42 
 
 
201 aa  64.7  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  32.09 
 
 
236 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0445  isochorismatase hydrolase  25.15 
 
 
174 aa  64.3  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000176183  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  30.37 
 
 
239 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  25.82 
 
 
196 aa  63.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1242  isochorismatase hydrolase  40.59 
 
 
192 aa  63.9  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02070  nicotinamidase-like amidase  30.6 
 
 
258 aa  62.8  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.450894  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  30.48 
 
 
188 aa  63.2  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  29.95 
 
 
248 aa  63.2  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  30 
 
 
201 aa  63.2  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  29.44 
 
 
200 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  29.55 
 
 
231 aa  62.8  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  29.44 
 
 
195 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  28.33 
 
 
274 aa  62.8  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  32.76 
 
 
215 aa  62.4  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  31.69 
 
 
205 aa  62.4  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1674  isochorismatase family protein  37.5 
 
 
182 aa  62  0.000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000489002  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  28.04 
 
 
215 aa  62  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1908  isochorismatase hydrolase  26.09 
 
 
205 aa  62  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.460102 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  27.31 
 
 
230 aa  62  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  34.96 
 
 
247 aa  61.6  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  29.74 
 
 
228 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  28.64 
 
 
245 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  27.68 
 
 
195 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  30.59 
 
 
209 aa  61.2  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0828  isochorismatase hydrolase  28.96 
 
 
202 aa  61.2  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  32.12 
 
 
186 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1598  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  37.62 
 
 
183 aa  61.2  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0241286  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  29.23 
 
 
228 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0906  isochorismatase hydrolase  32.45 
 
 
193 aa  60.5  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.312292  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  27.65 
 
 
234 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  28.42 
 
 
192 aa  60.5  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  26.49 
 
 
241 aa  60.1  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  32.62 
 
 
213 aa  59.7  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  32.77 
 
 
241 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  28.44 
 
 
246 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  28.11 
 
 
234 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  30.81 
 
 
227 aa  59.7  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  28.9 
 
 
227 aa  60.1  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 
231 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  27.08 
 
 
188 aa  59.3  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4359  isochorismatase hydrolase  28.24 
 
 
218 aa  58.9  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0222954  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2002  isochorismatase hydrolase  26.19 
 
 
202 aa  58.9  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0995803  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  26.79 
 
 
233 aa  58.9  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  25.84 
 
 
191 aa  58.5  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  31.43 
 
 
217 aa  58.5  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  31.28 
 
 
248 aa  58.5  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  27.23 
 
 
230 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  26.94 
 
 
188 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  26.94 
 
 
188 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  27.23 
 
 
231 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  27.01 
 
 
231 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  27.23 
 
 
231 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  27.23 
 
 
231 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  26.94 
 
 
188 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  26.94 
 
 
188 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  29.05 
 
 
204 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  27.75 
 
 
190 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>